田海英 張東旸 徐榮建 秦毅 蘭亞良 矯文捷 韓玉棟
肺癌是發病率和死亡率高居第一位的惡性腫瘤,對人類的身體健康構成了極大的威脅,其中大部分是非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)[1]。肺癌的發生發展與基因表達及信號通路傳導異常密切相關,研究該過程中的具體分子機制是當今NSCLC基礎研究的熱點[2]。我們前期通過高通量測序技術發現TRIM59 mRNA在肺癌組織中的表達量高于癌旁組織。TRIM59已被報道與腦膠質瘤[3]、胃癌[4]、膽管癌[5]、乳腺癌[6,7]、卵巢癌[8]等多種癌癥密切相關,但與NSCLC的關系尚不清楚。在該研究中,首先通過挖掘公共數據庫中的NSCLC數據信息,分析TRIM59 mRNA在NSCLC中的表達及其與預后的關系;進一步通過檢測TRIM59蛋白在NSCLC中的表達水平,分析其與臨床病理特征及患者預后的關系,為NSCLC的診斷和治療提供一定的思路。
1.1 高通量芯片表達譜數據庫(Gene Expression Omnibus, GEO)和腫瘤基因組計劃(The Cancer Genome Atlas, TCGA)數據庫檢索 本研究中通過檢索TCGA(http://cancergenome.nih.gov/)數據庫和GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)數據庫中的NSCLC基因表達譜數據和臨床數據,用于基因差異分析和預后分析。
1.2 研究對象及臨床資料 收集2009年1月-2010年12月在青島大學附屬醫院胸外科進行手術切除的90例患者的NSCLC組織和癌旁組織標本。入組標準:初診,術前未放化療,術后病理為NSCLC,圍術期未出現嚴重的并發癥,所有病例的臨床資料、病理分型分期及隨訪信息完整,隨訪截止時間2018年12月。該研究經青島大學附屬醫院倫理委員會批準,并取得患者及家屬的知情同意。1.3 免疫組織化學方法檢測TRIM59蛋白在肺癌及癌旁組織中的表達……p>