金茅黑雞肉品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)轉(zhuǎn)錄組分析

李國輝，謝愷舟，戴國俊，張跟喜，張 濤，楊國明，陳 蘭，韓 威，蘇一軍，王金玉*

（1.揚(yáng)州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，教育部農(nóng)業(yè)與農(nóng)產(chǎn)品安全國際合作聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室，江蘇揚(yáng)州 225009；2.江蘇省家禽科學(xué)研究所，江蘇揚(yáng)州 225125；3.江蘇三得利牧業(yè)發(fā)展有限公司，江蘇常州 213200）

肉品質(zhì)性狀是復(fù)雜性狀，具有遺傳力低、易受環(huán)境影響等特點(diǎn)。一般影響復(fù)雜性狀的基因都是由多個基因控制，而每個基因?qū)π誀畹呢暙I(xiàn)率相對較小，并且基因與基因之間、環(huán)境與基因之間還可能存在各種互作關(guān)系。研究人員通過不同途徑來解析性狀形成的分子機(jī)制。首先通過候選基因關(guān)聯(lián)分析的方法鑒定了一些影響雞肉品質(zhì)的候選基因，如雞肌內(nèi)脂肪（Intramuscular Fat，IMF）含量的候選基因H-FABP和A-FABP[1]。隨著測序技術(shù)的發(fā)展，科研人員應(yīng)用GWAS 技術(shù)鑒定了影響雞腹脂、體重和生長、免疫和繁殖性狀的基因和染色體區(qū)域，初步揭示這些性狀形成的分子機(jī)制[2-3]。Kong 等[4]利用全基因重測序技術(shù)對2 個品系的肉雞肌肉進(jìn)行研究，發(fā)現(xiàn)APOB、ATM、MIA3、MICAL2等基因表達(dá)可能影響肉色的形成，是影響肉雞肌肉肉色的重要候選基因。然而，GWAS 發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn)大多位于非編碼區(qū)，如何從功能上解釋這些位點(diǎn)的調(diào)控作用一直是人們關(guān)注的焦點(diǎn)。以芯片為基礎(chǔ)的基因表達(dá)譜研究能夠分析某一狀態(tài)下的細(xì)胞或組織的mRNA 表達(dá)豐度，可以高通量地研究基因在轉(zhuǎn)錄組水平的表達(dá)量。通過全基因組表達(dá)譜研究發(fā)現(xiàn)了存在大量的差異表達(dá)基因（Differentially Expressed Genes，DEGs），但由于其覆蓋度較低，難以檢測低豐度的基因表達(dá)。……