河南省結核分枝桿菌MIRU-VNTR和間隔區寡核苷酸分型分析

石 潔，鄭丹薇，朱巖昆，馬曉光，王少華，李 輝，張國龍

河南省疾病預防控制中心 鄭州 450016

結核病是嚴重威脅人類健康的公共衛生問題，尤其是發展中國家。盡管世界衛生組織在2017年提出了“終止結核病”的目標，但我國每年新發結核病約90萬例，是全球第三大高負擔國家，特別是耐多藥結核病疫情較重[1]。河南省作為中國人口最多的省份，結核和耐多藥結核患者數均多于其他省份，近年來平均發病率為81/10萬[2]。目前針對河南省結核分枝桿菌分子流行病學的研究較少，亟需對河南菌株進行分型分析。

制定一套合適的分型方法對于結核病的防控有重要的意義，可調查結核病的傳播模式，追蹤結核病的傳播，監測可疑的結核病暴發[3]。間隔區寡核苷酸分型(spoligotyping)是通過檢測結核分枝桿菌基因組中43個同向重復序列是否缺失進行分型的方法，是鑒定北京家族基因型的金標準[4]。分枝桿菌散在重復單元-數目可變串聯重復序列(mycobacterium interspersed repetitive unit-variable number tandem repeat，MIRU-VNTR)分型是另一種結核分枝桿菌分型方法，其根據不同位點散在重復單位數目的不同進行分型[3,5]。這兩種方法均操作簡單，結果可數字化，重復性較好，具有較好的經濟效益，二者結合后對結核分枝桿菌具有較高的分辨力。以往研究[6-7]表明，除了傳統24位點外，ETRF和Mtub38這兩個位點對于我國結核分枝桿菌的分型有較高的分辨力。本研究使用Spoligotyping和26位點(標準24位點和ETRF、Mtub38)MIRU-VNTR方法評價了河南省結核分枝桿菌的基因多態性，并將26位點的檢驗效能與標準24位點、15位點和12位點相比較。……