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RVP Fast與Seeplex PneumoBacter ACE Detection assay聯(lián)合診斷呼吸道感染病原體

2018-10-31 01:27:16鄭齊鍶寧明哲
中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué) 2018年10期
關(guān)鍵詞:檢測

戴 蕾,鄭齊鍶,東 芳,寧明哲

(南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院 檢驗(yàn)科,江蘇 南京210008)

呼吸道感染(RI) 是臨床常見疾病之一,近年來,隨著大氣環(huán)境的改變,霧霾天氣的增多,社會(huì)老齡化程度加劇,呼吸道感染的病例呈逐年上升趨勢。其臨床癥狀差異不明顯,而引起呼吸道感染的病原體很多,明確診斷病原體,合理用藥,針對性治療,才能避免抗生素的濫用和疾病的延誤[1]。傳統(tǒng)檢測呼吸道病原體檢測方法如細(xì)菌培養(yǎng)、病毒培養(yǎng)、免疫熒光和抗原檢測,存在實(shí)驗(yàn)周期長、操作復(fù)雜或敏感度低等缺點(diǎn)。某些難以培養(yǎng)的細(xì)菌,如軍團(tuán)菌、百日咳等,在日常檢測中基本處于檢測盲區(qū)。本研究收集了我院呼吸道感染患者的咽拭子標(biāo)本67份,分別應(yīng)用xTAG呼吸道病毒群快速檢測(RVP Fast)與Seeplex PneumoBacter ACE Detection assay 進(jìn)行病原體檢測,明確診斷病原體,為臨床合理用藥提供一定的依據(jù)。

1 材料與方法

1.1材料咽拭子標(biāo)本來源于我院門診2015年3月至10月在我院呼吸科門診診斷為呼吸道感染的患者,共67份。其中,男性患者36人,女性患者31人,年齡21-92歲。

1.2儀器與試劑2720 Thermal Cycler PCR擴(kuò)增儀(美國ABI公司) ,Luminex xMAP 200IS 儀(美國Luminex 公司),電泳儀(美國bio-rad公司),UTM(Universal Transport Media) 病毒采集和保存體系(意大利COPAN 公司) ,RNA 和DNA 提取試劑盒(德國Qiagen 公司) ,xTAG RVP Fast(加拿大Luminex公司) ,Seeplex PneumoBacter ACE Detection試劑盒,瓊脂糖為BIOWEST REGULAR GAROSE G-10。

1.3RNA與DNA提取使用Qiagen公司核酸提取試劑盒。

1.4RVPFast檢測按照試劑盒說明書及文獻(xiàn)[2,3]報(bào)道,先PCR擴(kuò)增19個(gè)亞型的呼吸道病毒基因,將擴(kuò)增產(chǎn)物與標(biāo)記特異探針的磁珠混合液雜交,雜交產(chǎn)物在xMAP 200IS 儀器上檢測熒光信號強(qiáng)度中位數(shù)值(MFI) ,應(yīng)用配套軟件分析檢測結(jié)果。檢測設(shè)空白對照以確認(rèn)是否污染,設(shè)置lambda 噬菌體為陽性質(zhì)控,噬菌體MS2 RNA 為內(nèi)參照。

1.5SeeplexPneumoBacterACEDetectionassay檢測按照試劑盒說明書配置反應(yīng)體系:5× PB ACE PM 4 μl,2× Multiplex Master Mix 10 μl,8-MOP Solution 3 μl,DNA模板 3 μl,共20 μl。反應(yīng)條件:94℃,15 min;94℃,30 s,60℃ 90 s,72℃ 90 s,40個(gè)循環(huán);72℃ 15 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈照射成像,根據(jù)產(chǎn)物位置判斷病原體類型。

2 結(jié)果

2.1RVP Fast共檢測標(biāo)本67份,陽性標(biāo)本4例,陽性率為5.97%,其中腸鼻病毒2例,流感A型病毒1例,呼吸道合胞病毒(RSV)1例。見表1。

表1 檢出病毒標(biāo)本詳細(xì)列表

2.2Seeplex PneumoBacter ACE Detection assay檢測標(biāo)本67份,陽性標(biāo)本26份,陽性率38.81%。其中,單病原體感染者14名,男10名,女4名;雙病原體感染者12名,男5名,女7名。檢出肺炎鏈球菌7例,流感嗜血桿菌8例,肺炎支原體5例,肺炎衣原體9例,百日咳鮑特桿菌4例,軍團(tuán)菌5例。見表2及圖1。

表2 檢出的病原體分布

注:泳道7為 PB ACE MARKER。泳道1、2、4、5、11為肺炎鏈球菌陽性,泳道9為流感嗜血桿菌陽性,泳道12為肺炎衣原體陽性

圖1PCR產(chǎn)物(Seeplexace試劑盒)電泳圖

3 討論

成人呼吸道感染的病原體檢測日益受到國內(nèi)外學(xué)者的重視。尤其近年來由于霧霾天氣日益增多,大氣環(huán)境的改變,成人呼吸道感染患者逐步增加。而且各類抗生素的廣泛應(yīng)用,細(xì)菌感染發(fā)生率有所降低,使得由病毒和非典型性病原體(肺炎支原體、肺炎衣原體和嗜肺軍團(tuán)菌) 引起的肺炎和支氣管炎相對突出。呼吸道病原體致病性強(qiáng)、傳播快、起病急,人群不易形成持久抵抗力,臨床特征缺乏特異性,容易造成抗生素的濫用,給疾病的診治及防控造成一定的困難[5],(肺炎支原體、肺炎衣原體和嗜肺軍團(tuán)菌) 引起的肺炎和支氣管炎相對突出。呼吸道病原體致病性強(qiáng)、傳播快、起病急,人群不易形成持久抵抗力,臨床特征缺乏特異性,容易造成抗生素的濫用,給疾病的診治及防控造成一定的困難[5],且呼吸道病原體在不同的季節(jié)、不同地區(qū)和不同人群中流行性也不盡相同[6]。因此對本地區(qū)成人呼吸道感染的病原學(xué)和流行病學(xué)調(diào)查和研究顯得尤為重要。

xTAG=呼吸道病毒群快速檢測(RespiratoryViral Panel RVP Fast Array,RVP Fast) 為代表的液相多重檢測技術(shù)能在同一反應(yīng)體系同時(shí)檢測流感病毒(甲、乙型,甲型H1、H3 亞型及未知亞型) ,呼吸道合胞病毒(A、B 型) ,冠狀病毒(OC43 亞型、NL63 亞型、229E 亞型和HUK1 亞型) ,副流感病毒(1-4型) ,人類偏肺病毒,腸道/鼻病毒,腺病毒和人博卡病毒共8 個(gè)種屬19 個(gè)型別。有關(guān)研究評估了RVP Fast 方法篩查呼吸道病毒的效能[2,3,6],但國內(nèi)目前尚未在臨床實(shí)驗(yàn)室推廣。本研究中,67份標(biāo)本檢測陽性率為5.97%,低于文獻(xiàn)報(bào)道的20.9%-35.4%。但兩種研究方法不同,本研究應(yīng)用的為PCR后流式熒光免疫分析技術(shù),而文獻(xiàn)6中使用的為德國歐蒙公司的間接免疫熒光(IIF)法,且本研究例數(shù)較少,而且操作相對繁瑣,干擾因素多,對結(jié)果有一定的影響。因此,本法暫僅用于臨床研究,不適合在醫(yī)院推廣。

Seeplex PneumoBacter ACE Detection assay一次檢測七種非典型肺炎的病原體,包括肺炎支原體、肺炎衣原體、肺炎鏈球菌、嗜肺軍團(tuán)菌、百日咳鮑特桿菌、流感嗜血桿菌。相比于RVP Fast檢測,此方法耗時(shí)少,且陽性率高。普通PCR也可檢測此類病原體,但一次僅能檢測一種病原體,此方法可一次檢測六種病原體,提高檢出率,幫助臨床明確診斷。細(xì)菌培養(yǎng)可檢出肺炎鏈球菌、流感嗜血桿菌,但其為苛養(yǎng)菌,形態(tài)與正常菌群相似,不易分辨,檢出率低。此技術(shù)的推廣,可提高此兩種病原體的檢出率,耗時(shí)較細(xì)菌培養(yǎng)短。目前,大多數(shù)醫(yī)院微生物室均不能培養(yǎng)嗜肺軍團(tuán)菌、百日咳鮑特桿菌,使得這兩種細(xì)菌的診斷處于盲區(qū)。此技術(shù)的使用與推廣,為臨床提供明確的診斷,合理使用抗生素提供依據(jù)。

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