劉昆昂, 郝 楠, 李海立, 黃亞麗 , 賈振華
(河北省科學院 生物研究所,河北 石家莊 050081)
解淀粉芽胞桿菌(Bacillusamyloliquefaciens)是一種與枯草芽胞桿菌親緣關系很近的革蘭陽性細菌,屬于芽胞桿菌屬(Bacillussp.)[1]。因其能產生豐富的次級代謝產物,并具有廣譜的抗真菌、細菌活性,多作為生防菌劑在農作物病害的防治中被廣泛使用;同時又是一種植物根際促生菌,對植物的生長具有促進作用。植物根際促生菌(Plant growth-promoting rhizobacteria,PGPR)是指能夠促進植物生長、防治病害、增加作物產量的根際微生物[2]。解淀粉芽胞桿菌在營養缺乏或其他逆境條件脅迫下,能夠形成對高溫、紫外線、干燥、電離輻射及有毒化學物質具有抗性的芽胞。通過在生長過程中與病原菌競爭營養和侵染位點、分泌抗菌物質和誘導植物產生系統抗病性來達到生物防治的目的[3]。關于解淀粉芽胞桿菌的前期研究主要集中在菌株的篩選、鑒定和抑菌物質的種類、作用、產生條件和分離純化等方面。隨著測序技術的逐漸發展,尤其是高通量測序技術的廣泛應用,使利用基因組學尤其是功能基因組學,包括轉錄物組學、蛋白質組學、代謝物組學、比較基因組學來研究生防菌的生防機制及其調控網絡成為熱點[4-5]。
1997年Kunst等[6]發布了枯草芽胞桿菌的全基因序列,這是第一個得到全基因序列的革蘭陽性細菌。基因組大小為4 214 810 bp,編碼4 100個基因。2007年Chen等[7]發布了解淀粉芽胞桿菌FZB42的全基因序列,基因組大小為3 918 589 bp,編碼3 693個基因,G+C的……