人體微生物群與微生物組

郭曉奎

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)與微生物學(xué)系，上海 200025

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·特約專稿·

人體微生物群與微生物組

郭曉奎

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)與微生物學(xué)系，上海 200025

隨著微生物群(組)研究的興起，人體微生物組對機(jī)體健康或疾病作用的探索一度呈井噴之勢，但研究技術(shù)及分析方法仍處于起步階段，需進(jìn)一步深入。本文對微生物群和微生物組的概念進(jìn)行了解釋，闡述了人體微生物群與機(jī)體的相互作用模式，概括了微生物群與人體有關(guān)疾病的關(guān)系，提出了人體微生物組研究中的6個(gè)關(guān)鍵問題，并對未來的發(fā)展方向進(jìn)行了展望。

微生物群；微生物組；微生物群調(diào)控

微生物群(microbiota)是特定時(shí)間及特定生境中所有微生物有機(jī)體的總稱，其組成包括非細(xì)胞結(jié)構(gòu)的病毒(包括噬菌體)、原核生物中的真細(xì)菌和古細(xì)菌以及真核細(xì)胞微生物。與之對應(yīng)，微生物群可劃分為病毒群、細(xì)菌群、古細(xì)菌群和真核細(xì)胞型微生物群。而微生物組(microbiome)是特定時(shí)間及特定生境中微生物群所包含的基因序列(含同源序列)的總和。兩者不完全對應(yīng)(圖1)，微生物組的范圍更廣，特別是動物和植物微生物組。微生物組與其宿主基因組有重疊部分——主要是宿主基因組包含的與微生物同源的基因序列，特別是與病毒基因序列的同源部分。相應(yīng)地，微生物組也可分為病毒組、細(xì)菌組、古細(xì)菌組、真核細(xì)胞型微生物組。微生物組推動自然界進(jìn)化過程的變化近年來受到廣泛關(guān)注，涉及人體、動物、植物、水體、土壤、大氣、農(nóng)業(yè)和水產(chǎn)養(yǎng)殖、環(huán)境保護(hù)和新能源等諸多方面，目前人體微生物組研究取得的成果最為豐富。……