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熒光定量PCR儀(ABI7500)操作規程及日常維護

2017-06-09 03:34:43曹蕾馬揚光施小明
今日健康 2016年11期
關鍵詞:維護

曹蕾 馬揚光 施小明

【摘 要】 介紹了熒光定量PCR儀(ABI7500)操作規程,總結了其日常維護和注意事項,為其使用提供指導。

【關鍵詞】 熒光定量PCR儀 操作規程 維護

熒光定量PCR儀將PCR熱循環,熒光檢測和各種應用分析軟件結合在一起,可以動態觀察PCR每一循環各反應管中PCR擴增產物逐漸增加的情況。

1 原理介紹

實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法[1]。

熒光染料法:熒光染料能特異性摻人DNA雙鏈,發出熒光信號,而不摻入雙鏈中的染料分子不發出熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產物增加完全同步[1]。

熒光探針法:探針的5 端標記熒光報告基團 (reporter R) 3 端標記淬滅基團(quencher Q),探針完整時,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5-3外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物的形成完全同步[1] [2]。

通常,熒光擴增曲線可分為三個階段,即熒光背景信號階段、熒光信號指數擴增階段和平臺期。在熒光信號指數擴增階段,PCR產物量的對數值與起始模板量之間存在線性關系,因此可以在該階段進行定量分析。為了便于對所檢測樣本進行比較,在指數期需要設定一個熒光信號的閾值。熒光信號由本底進入指數增長階段的閾值所對應的循環次數稱為ct值。模板的ct值與其起始拷貝數的對數存在線性關系,起始拷貝數越多,則ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品及其相應的ct值可繪制出標準曲線,測得未知樣品的Ct值后,根據標準曲線便可準確計算出該樣品的起始拷貝數[3]。

2 操作規程

2.1 開機

2.1.1 依次打開電腦顯示器和電腦主機的電源開關,進入Windows界面。

2.1.2 接著打開AB7500儀器電源開關,預熱10分鐘。

2.1.3 點擊SDS軟件。

2.2 檢測

2.2.1 選擇File-New-新建,在New Document Wizard窗口中,從Assay下拉列表中選擇反應類型:相對定量,絕對定量,等位基因鑒別或陽性陰性實驗,從Container下拉列表中選擇反應板類型,在Default Plate Name中輸入反應板文件名,點擊Next,選擇需要添加到反應板文件的探針,點擊Next,為每個孔指定探針和任務,單擊Finish。

2.2.2 在Well Inspector-View-Well Inspector中輸入樣品名。

2.2.3 運行相應的反應類型程序,選擇Instrument設定PCR條件。

2.2.4 點擊Save下拉菜單下的Save As,輸入文件名,點擊save,關閉設置界面。

2.2.5 按壓儀器托盤上的按壓位,待托盤彈出后,將所需檢測反應板放入檢測孔位,再次按壓托盤使其滑入儀器,點擊Start開始檢測。

2.3 結果分析

PCR反應結束后自動保存結果,對擴增曲線進行分析,選擇Analysis-Analysis Settings 選擇Auto Ct,軟件自動為每個反應空生成基線和閾值,也可根據分析后圖像調節Baseline的Start值、End值,Threshold值,點擊Analyze進行再次分析。

2.4 關機

實驗結束后取出反應管(切勿打開管蓋),順序關閉AB7500軟件、定量PCR儀電源,關閉電腦

3 日常清潔維護[4]

3.1 每周用無絨布塊蘸取75%酒精清潔儀器的表面。

3.2 每周使用75%酒精浸泡反應管托架(晾干后放回儀器內)。

3.3 每月執行一次背景校準

3.4 每半年檢查燈具狀態。在7500 Software中,選擇Instrument-Lamp Status/Replacement以確定鹵素燈的狀態:Condition顯示 Good 表示燈具工作良好,不需更換鹵素燈;顯示Failed表示鹵素燈已壞,需更換; Change Soon表示燈具使用超過2000小時,建議將更換。

3.5在PCR儀運行之前或期間,7500 Software可能顯示警告,按警告要求進行目標區(ROI)校正、背景校準、光學校準、染料校準、RNase P儀器驗證試驗等。

參考文獻

[1] 鐘江華,張光萍,柳小英.實時熒光定量PCR技術的研究進展與應用[J].氨基酸和生物資源,2011,33(2):68~72.

[2] 蘭靜,李秋根.實時熒光定量PCR技術理論研究及其在醫學方面的應用[J].南昌大學學報(醫學版),2011,51(10):97~100.

[3] 王志平.熒光定量PCR技術的原理與應用[J].渭南師范學院學報,2012,27(10):61~64.

[4] 魏建新. ABI7500 型熒光定量PCR儀的使用維護及故障排除[J]. 中國衛生檢驗雜志, 2015,25(21):3780~3781.

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