不同粗飼料條件下梅花鹿瘤胃甲烷菌結構的比較分析

李志鵬　劉晗璐　司華哲　鮑　坤　李光玉

(中國農業科學院特產研究所經濟動物研究室，長春130112)

?

不同粗飼料條件下梅花鹿瘤胃甲烷菌結構的比較分析

李志鵬劉晗璐司華哲鮑坤李光玉*

(中國農業科學院特產研究所經濟動物研究室，長春130112)

本研究旨在基于高通量測序技術分析比較采食3種常見粗飼料梅花鹿瘤胃甲烷菌結構。選取3只2歲齡的裝有永久性瘤胃瘺管的成年雄性梅花鹿為研究對象，采用3×3拉丁方設計，分別飼喂以柞樹葉(OL組)、玉米秸稈(CS組)和玉米青貯(CI組)為主要粗飼料的飼糧。預試期為1周，正試期為4周。采用引物A519F、A976R擴增瘤胃甲烷菌16S rRNA基因V3～V4區，基于Illumina Miseq PE250平臺進行測序。結果表明：9個樣本共獲得600 352條高質量的甲烷菌16S rRNA基因序列，基于97%相似性共歸為111個分類操作單元(OTU)。覆蓋度指數表明本試驗樣品覆蓋了瘤胃99%的甲烷菌。分類分析結果表明甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacterspp.)[OL組：(97.80±6.00)%；CS組：(97.10±1.50)%；CI組：(87.50±5.50)%]是梅花鹿瘤胃優勢甲烷菌，但采食3種粗飼料梅花鹿瘤胃甲烷菌在種水平的分布有差異。CI組Methanosphaerastadtmanae相對豐度顯著高于OL組與CS組(P<0.05)。OL組與CI組Methanobrevibactermillerae相對豐度高于CS組(P>0.05)，OL組與CS組Methanobrevibacterboviskoreani相對豐度高于CI組(P>0.05)，而CS組與CI組Methanobrevibacterolleyae相對豐度高于OL組(P>0.05)。本研究發現Methanobrevibacterspp.是梅花鹿瘤胃優勢甲烷菌。

梅花鹿；甲烷菌；Methanobrevibacterspp.；粗飼料

甲烷是一種與全球氣候變化密切相關的溫室氣體。據統計，畜牧業貢獻了全球9%～18%的溫室氣體排放，其中反芻動物排放占有率為80%，同時反芻動物的甲烷形成過程也導致機體損失2%～12%的凈能量[1-2]。因此，反芻動物的甲烷排放越來越受到人們的關注。對反芻動物而言，甲烷主要是由瘤胃甲烷菌利用飼料消化過程中所產生的中間代謝產物，如氫氣、甲酸、甲醇及甲胺等，還原二氧化碳而生成的。因此……