全基因組測序揭示水源性土拉菌病

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全基因組測序揭示水源性土拉菌病

KARADENIZLI及其同事采用全基因組測序進行土耳其境內（錫瓦斯，昆侖以及科賈埃利省）口咽部土拉菌病暴發流行的研究。這次暴發流行波及178人，經典的流行病學已經提示飲用水污染為暴發流行的可能原因，然而缺乏分子層面的證實。

33例首發病例中12例的咽拭子培養分離到土拉桿菌亞種holarctica，同時從暴發流行地區未經消毒的飲用水水源收集的140份水樣中有5份分離出該亞種。全基因組測序顯示有6株分離株屬于B.12型。土拉菌遺傳變異非常少，因此傳統的分子生物學方法不能鑒別菌株的型別，但是全基因組測序可以解決該問題。全基因組測序結果顯示所檢測的菌株有2個新基因簇，與已知的土拉桿菌基因組序列至少有20和26 個堿基多態性的差異。

研究者指出，該病流行區域的水庫入水口都暴露在外，輸送飲用水的管道也無覆蓋。因此，水源易受污染。

經皮下注射或吸入＜10個細菌，或口服要求＞106個細菌可導致感染，提示本次暴發土拉菌病的主要原因是流行地區的水源被高度污染。美國，每年約有100例土拉菌病，多數為散發病例，但并無飲用水被污染導致發病的證據。

研究者指出將土拉菌蓄意污染飲用水水源具有可能作為生物武器的風險。

In the literature. Waterborne tularemia：whole-genome sequencing nails it. Clin Infect Dis， 2015：61（1October）.

高 瓊摘譯 黃海輝審校

Waterborne tularemia： whole-genome sequencing nails it

2015-12-02