利用16 Sr-DNA高通量測序技術對發酵床墊料微生物區系的分析

管業坤，楊　艷△，王榮民*，婁佑武，吳志勇，涂凌云( .江西省畜牧技術推廣站，江西 南昌 330046；.南昌市動物疫病預防控制中心，江西 南昌330008)

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利用16 Sr-DNA高通量測序技術對發酵床墊料微生物區系的分析

管業坤1，楊艷△1，王榮民1*，婁佑武1，吳志勇1，涂凌云2( 1.江西省畜牧技術推廣站，江西 南昌 330046；2.南昌市動物疫病預防控制中心，江西 南昌330008)

[摘要]本研究旨在了解發酵床養豬墊料微生物菌群區系結構，探索菌種及墊料對發酵床墊料微生物區系的影響。將商業菌、土著菌分別接種于含稻殼與鋸末成分比為1∶1和2∶1墊料中，制作成四個處理組的發酵床，經154 d豬飼養試驗后，收集發酵床墊料，采用16Sr-DNA高通量測序技術對發酵床中微生物區系進行測定分析。結果表明：(1)豐富度方面，土著菌(Chao指數：10175～10754)豐富度高于商業菌(Chao指數：6720～7554)；(2)相似性方面，商業菌種處理的菌群結構受墊料因素的影響較小，土著菌處理的菌群結構受墊料因素的影響較大；(3)多樣性方面，墊料對菌群多樣性的影響較菌種對其的影響大，且稻殼與鋸末比值為2∶1的墊料微生物多樣性(shannon指數：6.64～6.91)高于稻殼與鋸末比值1∶1的墊料微生物多樣性(shannon指數：5.90～5.94)；(4)菌群組成方面，發酵床墊料菌群主要由4個門組成：擬桿菌門(27.66%～60.93%)、厚壁菌門(13.41%～34.21%)、變形菌門(10.28%～14.71%)和放線菌門(4.63%～26.24%)，并從屬水平上確定了Galbibacter為發酵床墊料微生物的優勢菌屬。試驗發現菌種和墊料對發酵床墊料微生物區系的豐富度、相似性、多樣性均有不同程度的影響。

[關鍵詞]16Sr-DNA高通量測序；發酵床；微生物區系；菌種；墊料

發酵床養豬技術是通過發酵床墊料中有益微生物消納生豬的排泄物，有效解決生豬生產帶來的環境污染問題[1]。……