中國黃牛mtDNA 16S rRNA基因遺傳多樣性與系統進化分析

佘一凡，武　青，張春雷，房興堂，何丹丹，陳　宏(江蘇師范大學 細胞與分子生物學研究所 生命科學學院，江蘇 徐州 221116)

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科學研究

中國黃牛mtDNA 16S rRNA基因遺傳多樣性與系統進化分析

佘一凡，武青，張春雷，房興堂，何丹丹，陳宏*(江蘇師范大學 細胞與分子生物學研究所 生命科學學院，江蘇 徐州 221116)

[摘要]采用 PCR和 DNA 測序技術和生物信息學方法，測定分析了10個中國黃牛品種(群體)和2個外來牛品種共131個體的mtDNA 16S rRNA基因全序列的遺傳變異，并分析了品種(群體)間的親緣關系以及母系起源。結果表明，在12個群體131條16S rRNA基因序列中，共發現了78個變異位點，形成了40種單倍型，揭示了中國黃牛群體具有豐富的遺傳多樣性?？側后w的平均單倍型多樣性指數(Hd)為0.857±0.024，平均核苷酸多樣性指數(Pi)為0.00582，Kimura雙參數品種間遺傳距離范圍為0.001～0.009，10個中國黃牛品種(群體)核苷酸多樣度高于2個外來牛品種?；贙imura-2-parameter距離采用NJ法構建了10個中國黃牛品種(群體)分子系統樹，111個體聚為2簇，即分別與瘤牛和普通牛聚在一起，說明中國黃牛存在兩個母系起源，主要起源于瘤牛和普通牛。其中草原紅牛和蒙古牛起源于普通牛，恩施牛主要起源于瘤牛，但是對于親緣關系復雜的中原地區黃牛而言，瘤牛和普通牛對它們的影響力大小因品種而異。這些結果為我國黃牛的種質資源保護、雜交育種和品種改良奠定了分子遺傳學基礎。

[關鍵詞]中國黃牛；mtDNA 16S rRNA；遺傳多樣性

我國地方黃牛種質資源十分豐富，但是近年來由于對地方良種的品種特性認識不夠以及受外來肉用和乳用性能高的品種的雜交沖擊等原因[1]，我國地方良種黃牛品種資源數量和質量都有不同程度的下降，保種工作面臨著巨大的挑戰。……