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貂圓環(huán)病毒感染的分子流行病學(xué)研究

2015-02-24 01:09:54王玉瑩張樂萃扈榮良
中國獸醫(yī)雜志 2015年5期
關(guān)鍵詞:檢測(cè)

王玉瑩,劉 曄,連 海,李 楠,張樂萃,扈榮良

(1.青島農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,山東 青島 266109;2.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所吉林省人獸共患病預(yù)防與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林 長春 130122)

貂圓環(huán)病毒(Minkcircovirus,MiCV)是我國最近發(fā)現(xiàn)的一種引起傳染性水貂腸炎的新病原,臨床感染以紅白痢為主要特征,俗稱“頑固性腸炎”。貂圓環(huán)病毒性腸炎最早于20世紀(jì)70年代末在大連地區(qū)流行,目前國內(nèi)多地的養(yǎng)貂場均發(fā)現(xiàn)類似病例,在年輕貂群的感染率高達(dá)70%~80%。雖然該病致死率較低(7%~8%),但嚴(yán)重影響毛皮質(zhì)量,而且尚無疫苗和特效藥物[1]。因此,本研究在2013年9月至2014年9月,先后從山東諸城、河北饒陽和遼寧大連收集患腸炎水貂樣品,通過PCR檢測(cè),對(duì)貂圓環(huán)病毒的感染情況和病毒核酸序列進(jìn)行了分析,明確該病在我國的流行情況和病毒演化特征,為盡快研制針對(duì)性強(qiáng)的防治藥物奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 樣品采集 從2013年9月到2014年9月,在山東諸城、遼寧大連、河北饒陽3個(gè)地區(qū)主要的規(guī)?;B(yǎng)殖場收集病貂樣品185份(主要包括水貂尸體65份和肛拭子120份)(表2)。

1.2 主要試劑和儀器 體液病毒DNA/RNA小量提取試劑盒(批號(hào):04114kc5),質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒(批號(hào):04314KA1),DNA凝膠回收試劑盒(批號(hào):KE10120701-G),均購自康寧生命科學(xué)(吳江)有限公司。預(yù)染型PCR預(yù)混反應(yīng)液(批號(hào):A140A),pMD18-T(批號(hào):K6701AB),均購自寶生物工程(大連)有限公司。

TGRANDIENTPCR儀,購自HYBAID公司。DYFⅢ2型電泳儀,購自Bio-Rad公司。UVI firereader XS凝膠成像系統(tǒng),購自廣州市華奧行儀器有限公司。1.3 檢測(cè)方法 應(yīng)用本實(shí)驗(yàn)室建立的水貂圓環(huán)病毒PCR檢測(cè)方法,引物序列為F:5′-ATGCCCG?TAAGATCGCGAT-3′;R:5′-GGTACCTTAAGTTT?GCTTTGGG-3′,能夠擴(kuò)增貂圓環(huán)病毒Cap全基因,對(duì)采集自我國山東、河北和遼寧3個(gè)地區(qū)規(guī)?;B(yǎng)殖場水貂樣品進(jìn)行檢測(cè)。根據(jù)設(shè)計(jì)引物,可以獲得陽性樣品水貂圓環(huán)病毒基因Cap序列,貂圓環(huán)Cap全基因序列大小為684 bp。

1.4 克隆測(cè)序與序列分析 按照1.3的方法,于山東、河北、遼寧每個(gè)地區(qū)陽性病料進(jìn)行檢測(cè),選取一份陽性PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收,與pMD18-T克隆載體16℃連接過夜后轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂布于氨芐青霉素抗性的細(xì)菌培養(yǎng)皿上37℃培養(yǎng)12 h后挑去單個(gè)菌落,37℃、200 r/min振蕩過夜,取2mL菌液按方法1.3進(jìn)行PCR鑒定,挑選陽性重組質(zhì)粒送吉林省庫美生物科技有限公司進(jìn)行測(cè)序,序列分析用DNAMAN軟件。

1.5 系統(tǒng)演化分析 將本實(shí)驗(yàn)所獲得的3株毒株序列與GenBank中現(xiàn)有的圓環(huán)病毒屬成員序列,應(yīng)用MEGA4[2]進(jìn)行系統(tǒng)演化分析?;蛐蛄行畔碓匆姳?。

2 結(jié)果

2.1 病料的PCR擴(kuò)增 所獲得的185份病貂樣品,山東地區(qū)陽性率為44.4%,河北地區(qū)陽性率為63.2%,遼寧地區(qū)陽性率為54.0%,總陽性率為54.6%(表2)。根據(jù)不同季節(jié)采集樣品結(jié)果顯示,2014年5月份采集自遼寧大連的4份肛拭子糞便樣品檢測(cè)全部為陰性;2014年6月份采集自山東諸城的5份肛拭子糞便樣品全部為陰性;2014年8月份采集自河北的5份肛拭子糞便樣品全部為陰性。陽性樣品檢出率較高的時(shí)間主要集中于9~10月份,且陽性樣品病貂均有腹瀉癥狀。

2.2 基因序列的測(cè)定與分析 所獲得的3個(gè)地區(qū)陽性樣品測(cè)序結(jié)果顯示,山東地區(qū)與遼寧地區(qū)擴(kuò)增的Cap全基因完全相同,序列大小為684 bp,為貂圓環(huán)病毒Cap全基因;河北地區(qū)陽性結(jié)果與其他地區(qū)貂圓環(huán)病毒Cap全基因相比,只有3個(gè)堿基發(fā)生變化,但不同地區(qū)基因編碼的氨基酸仍然一致(圖1)。

2.3 系統(tǒng)演化分析 將新分離獲得的兩株圓環(huán)病毒Cap基因與GenBank中已經(jīng)登錄的不同種圓環(huán)病毒Cap基因序列進(jìn)行演化分析,進(jìn)化樹顯示,水貂圓環(huán)病毒與分離自菊頭蝙蝠的圓環(huán)病毒最相近[3],其同源性為73%(圖2)。

表1 本文所用的基因序列信息

表2 2013年9到2014年9月收集樣品信息及檢測(cè)結(jié)果

圖1 山東、河北和遼寧3地區(qū)分離株貂圓環(huán)病毒Cap全基因編碼氨基酸比對(duì)結(jié)果

圖2 水貂圓環(huán)病毒與其他圓環(huán)病毒系統(tǒng)演化分析

3 討論

圓環(huán)病毒過去一直被列為未分類的病毒,是所有已知?jiǎng)游锊《局凶钚〉腫4]。近年來,研究發(fā)現(xiàn),圓環(huán)病毒呈高度流行,在世界不同地理區(qū)域廣泛分布。貂圓環(huán)病毒(Minkcircovirus,MiCV)是我國長春軍事獸醫(yī)研究人員于2013年發(fā)現(xiàn)的一種新的哺乳動(dòng)物圓環(huán)病毒[1]。

根據(jù)調(diào)查結(jié)果,所有陽性水貂樣品,水貂都伴隨腹瀉,根據(jù)病程表現(xiàn)為白痢、黃痢和紅痢,繼而出現(xiàn)黑色血便,口鼻蒼白,最終死亡。根據(jù)檢測(cè)結(jié)果顯示,水貂圓環(huán)病毒在我國規(guī)?;B(yǎng)貂場的感染率為54.6%,需要引起重視。目前,沒有疫苗可以預(yù)防本病,不同地區(qū)曾接種自家苗來預(yù)防此病,但容易受貂阿留申病毒[5]感染帶來的不良影響。

根據(jù)序列分析結(jié)果顯示,山東地區(qū)水貂圓環(huán)病毒Cap基因與大連地區(qū)完全相同,沒有堿基突變,而河北地區(qū)僅有幾個(gè)堿基變化,堿基的變化并沒有導(dǎo)致氨基酸發(fā)生突變。實(shí)地調(diào)查結(jié)果證實(shí),山東很多地區(qū)貂場都從大連進(jìn)行調(diào)種,這是導(dǎo)致本病傳播的因素,并且進(jìn)一步揭示了水貂圓環(huán)病毒在我國不同地區(qū)流行一致性。系統(tǒng)演化分析表明,該病毒與蝙蝠圓環(huán)病毒同源性最近,與其他圓環(huán)病毒親緣關(guān)系較遠(yuǎn),這是新發(fā)現(xiàn)的哺乳動(dòng)物圓環(huán)病毒之一,根據(jù)比對(duì)結(jié)果可以證明該病毒為新的種。目前對(duì)于該病毒研究還處于初級(jí)階段,對(duì)病毒的致病機(jī)理和預(yù)防措施需要進(jìn)一步研究。

同時(shí),我們需要對(duì)全國不同地區(qū)養(yǎng)貂場養(yǎng)殖狐貍和貉子以及養(yǎng)殖人員也進(jìn)行此種圓環(huán)病毒的檢測(cè),以對(duì)本病做更全面了解。

[1]Lian H,Liu Y,Li N,etal.Novel Circovirus from Mink,China[J].Emerging Infectious Diseases,2014,9(20):1548-1550.

[2]Tamura K,Nei M,Kumar S.Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method[J].PNAS,2004,101:11030-11035.

[3]He B,Li Z,Yang F,etal.Virome profiling of bats from Myanmar by metagenomic analysis of tissue samples reveals more novel mammalian viruses[J].PLoSONE,2013,8:e61950.http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0061950.

[4]Hughes A L,Piontkivska H.Nucleotide sequence polymorphism in circoviruses[J].InfectGenet Evol,2008,8:130-138.

[5]Elisabeth G,Soren A,Anders C,etal.Nucleotide sequence anal?ysis of aleutian mink disease parvovirus shows thatmultiple virus types are present in infected mink[J].Journal of Virology,1991,65(8):4378-4386.

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