從江香豬基因組中2個拷貝數變異區的多態性研究

趙恒鑫，何樹芳，王嘉福，冉雪琴

(1.貴州大學 動物科學學院，貴州 貴陽550025；2.貴州大學 農業生物工程重點實驗室，貴州 貴陽，550025)

從江香豬基因組中2個拷貝數變異區的多態性研究

趙恒鑫1，2，何樹芳1，2，王嘉福2，冉雪琴1*

(1.貴州大學 動物科學學院，貴州 貴陽550025；2.貴州大學 農業生物工程重點實驗室，貴州 貴陽，550025)

為了研究從江香豬生長和繁殖差異與拷貝數變異拷貝數變異(copy number variation，CVN)之間的關系，采用實時熒光定量PCR方法，對從江香豬和大白豬基因組中的CNVR100與CNVR373的拷貝數進行了測定，并分析了從江香豬拷貝數與生長繁育性狀之間的相關性。結果表明，從江香豬和大白豬基因組中都檢測到CNVR100和CNVR373；與大白豬相比，從江香豬的CNVR100拷貝數較低，CNVR373拷貝數較高；相關性分析結果顯示，從江香豬2個CNVRs與其體長和胸圍有一定的負相關關系，表明這2個CNVRs的多態性可能對從江香豬的生長有一定的影響。

拷貝數變異；KIT基因；嗅覺受體；從江香豬

從江香豬是20世紀70年代末期，在貴州都柳江上游與廣西壯族自治區接壤山區發現的一種小型地方豬種，其中心產區在貴州從江縣的宰便、秀塘、加鳩等鄉鎮。經過長期的自然和人為的選擇，形成了從江香豬肉質優良、耐粗飼、近交不退化等特點。香豬群體個體間的生長繁育性狀的個體差異較大，3～8 月齡期間平均日增重152～186 g，窩產仔數范圍為5～21 頭[1-2]。近年來的研究表明，基因組中存在拷貝數變異(copy number variation，CNV)現象，并導致動物的表型發生改變[3]。CNV是2004年由Iafrate和Sebat研究小組從人類基因組中首次發現[4-5]，主要指基因組中1 kb以上的DNA片段的插入、缺失和/或擴增，及其互相組合衍生出的復雜染色體結構變異[6]?！?br>