宋興超,徐 超,王 雷,巴恒星,王桂武,楊福合
(中國農業科學院特產研究所 吉林省特種經濟動物分子生物學重點實驗室,吉林 長春 130112)
鹿科與牛科動物IGF-1基因序列比較及分子進化分析
宋興超,徐 超,王 雷,巴恒星,王桂武,楊福合*
(中國農業科學院特產研究所 吉林省特種經濟動物分子生物學重點實驗室,吉林 長春 130112)
以GenBank中已登錄的梅花鹿(Cervusnippon)、馬鹿(Cervuselaphus)、普通牛(Bostaurus)、水牛(Bubalusbubalis)、山羊(Caprahircus)和綿羊(Ovisaries)胰島素樣生長因子-1(IGF-1)基因mRNA序列為研究材料,通過DNAStar 7.0等生物信息學軟件對6個物種的IGF-1基因進行序列比較及分子進化分析。結果表明:鹿科與牛科動物IGF-1基因編碼區均為465 bp,并且堿基組成表現為G>C>A>T,且G+C含量高于A+T;6個物種IGF-1基因密碼子第1位富含A,密碼子第2位4種堿基的分布相對均勻,密碼子的第3位堿基C含量較高;編碼區堿基序列中共檢測到20個變異位點,包括10個單一變異和10個簡約變異,鹿科和牛科動物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均較高;(4) NJ和UPGMA兩種方法構建的分子進化樹均把6個物種聚為2個大類:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亞科和羊亞科兩類。
鹿科;牛科;胰島素樣生長因子-1基因;序列比較;密碼子
胰島素樣生長因子(Insulin-like growth factors,IGFs)是一類廣泛存在于動物體組織內且能夠促進細胞分化、蛋白質沉積、骨骼增長以及個體生長發育的多功能細胞增殖調控因子[1]。IGFs系統包括I型胰島素樣生長因子(IGF-1)、II型胰島素樣生長因子(IGF-2)、胰島素樣生長因子受體(IGF-1 R和IGF-2 R)、胰島素樣生長因子結合蛋白(IGFBP)、IGFBP相關蛋白及IGFBP酶等[2]。其中,IGF-1基因被認為是影……