雷蒙德氏棉HSP70基因家族的進化分析及其同源基因在陸地棉中的表達分析

張毓婷，王敏華，陳家棟，戎均康,3，丁明全,3

1. 浙江農林大學，亞熱帶森林培育國家重點實驗室培育基地，臨安 311300；

2. 浙江農林大學農業(yè)與食品科學學院，浙江省農產品品質改良技術研究重點實驗室，臨安 311300；

3. 中國農業(yè)科學院棉花研究所，棉花生物學國家重點實驗室，安陽 45500

雷蒙德氏棉HSP70基因家族的進化分析及其同源基因在陸地棉中的表達分析

張毓婷1,2，王敏華1,2，陳家棟2，戎均康2,3，丁明全2,3

1. 浙江農林大學，亞熱帶森林培育國家重點實驗室培育基地，臨安 311300；

2. 浙江農林大學農業(yè)與食品科學學院，浙江省農產品品質改良技術研究重點實驗室，臨安 311300；

3. 中國農業(yè)科學院棉花研究所，棉花生物學國家重點實驗室，安陽 45500

熱激蛋白70家族(HSP70)是一類在植物中高度保守的分子伴侶蛋白，在細胞中協(xié)助蛋白質正確折疊。文章利用隱馬可鏈夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)全基因組范圍內進行HSP70基因家族成員進化分析，共得到30個HSP70家族成員。利用生物信息學對雷蒙德氏棉HSP70基因的結構、染色體分布、基因倍增模式以及系統(tǒng)進化進行分析，結果表明，HSP70基因家族根據(jù)亞細胞定位結果可分為不同的基因亞家族，各亞家族中HSP70基因具有相對保守的基因結構；染色體片段重復和串聯(lián)重復是雷蒙德氏棉HSP70基因家族擴增的主要方式。通過對不同物種的HSP70基因家族進行系統(tǒng)進化分析可知，HSP70亞組的分化發(fā)生在單細胞植物形成前，且細胞質型 HSP70成員大量擴增。比較陸地棉棉纖維發(fā)育不同時期的深度測序表達譜，發(fā)現(xiàn)HSP70基因可能參與棉纖維的生長發(fā)育。……