山鷓鴣屬鳥類線粒體基因組的比較及系統(tǒng)發(fā)育研究

李雪娟，黃原，雷富民

1. 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，西安 710062；

2. 中國科學(xué)院動物研究所動物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100101

山鷓鴣屬鳥類線粒體基因組的比較及系統(tǒng)發(fā)育研究

李雪娟1，黃原1，雷富民2

1. 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，西安 710062；

2. 中國科學(xué)院動物研究所動物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，北京 100101

海南山鷓鴣(Arborophila ardens)對生境選擇比較嚴(yán)格，種群數(shù)量稀少，屬于瀕危物種。為進(jìn)一步研究山鷓鴣屬的進(jìn)化和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，文章利用Illumina Hiseq2000高通量測序技術(shù)獲得了海南山鷓鴣線粒體全基因組序列，從比較基因組學(xué)角度分析了4種山鷓鴣鳥類的線粒體基因組特征，并探討了山鷓鴣屬鳥類的系統(tǒng)發(fā)育地位。研究結(jié)果表明：(1) 海南山鷓鴣線粒體基因組長度為16 730 bp，編碼13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)核糖體RNA基因、22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因以及1個(gè)控制區(qū)；(2) 山鷓鴣屬物種受到了純化選擇的作用，且在進(jìn)化過程中積累了更多的非同義替換；(3) 山鷓鴣屬位于雉科鳥類系統(tǒng)樹的基部位置，其中白眉山鷓鴣與紅喉山鷓鴣互為姐妹群，海南山鷓鴣位于山鷓鴣屬的基部位置，與其他3種山鷓鴣鳥類的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

海南山鷓鴣；線粒體基因組；比較基因組學(xué)；系統(tǒng)發(fā)育

山鷓鴣屬(Arborophila)鳥類隸屬雞形目(Galliformes)、雉科(Phasianidae)[1]，分布于我國西藏、四川、云南、廣西、廣東、福建、海南和臺灣等地，國外見于印度、緬甸、泰國及東南亞地區(qū)。山鷓鴣屬鳥類全世界共有 18種，其中 10種分布于我國，4種為我國特有種。海南山鷓鴣(Arborophila ardens)是我國的特有種，僅分布于海南島，生活環(huán)境與白鷴(Lophura nycthemera whiteheadi)及灰孔雀雉(Polyplectron bicalcaratum katsumatae)相似[2]。……