李雪娟,黃原,雷富民
1. 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,西安 710062;
2. 中國科學(xué)院動物研究所動物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100101
山鷓鴣屬鳥類線粒體基因組的比較及系統(tǒng)發(fā)育研究
李雪娟1,黃原1,雷富民2
1. 陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,西安 710062;
2. 中國科學(xué)院動物研究所動物進(jìn)化與系統(tǒng)學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100101
海南山鷓鴣(Arborophila ardens)對生境選擇比較嚴(yán)格,種群數(shù)量稀少,屬于瀕危物種。為進(jìn)一步研究山鷓鴣屬的進(jìn)化和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,文章利用Illumina Hiseq2000高通量測序技術(shù)獲得了海南山鷓鴣線粒體全基因組序列,從比較基因組學(xué)角度分析了4種山鷓鴣鳥類的線粒體基因組特征,并探討了山鷓鴣屬鳥類的系統(tǒng)發(fā)育地位。研究結(jié)果表明:(1) 海南山鷓鴣線粒體基因組長度為16 730 bp,編碼13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)核糖體RNA基因、22個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA基因以及1個(gè)控制區(qū);(2) 山鷓鴣屬物種受到了純化選擇的作用,且在進(jìn)化過程中積累了更多的非同義替換;(3) 山鷓鴣屬位于雉科鳥類系統(tǒng)樹的基部位置,其中白眉山鷓鴣與紅喉山鷓鴣互為姐妹群,海南山鷓鴣位于山鷓鴣屬的基部位置,與其他3種山鷓鴣鳥類的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。
海南山鷓鴣;線粒體基因組;比較基因組學(xué);系統(tǒng)發(fā)育
山鷓鴣屬(Arborophila)鳥類隸屬雞形目(Galliformes)、雉科(Phasianidae)[1],分布于我國西藏、四川、云南、廣西、廣東、福建、海南和臺灣等地,國外見于印度、緬甸、泰國及東南亞地區(qū)。山鷓鴣屬鳥類全世界共有 18種,其中 10種分布于我國,4種為我國特有種。海南山鷓鴣(Arborophila ardens)是我國的特有種,僅分布于海南島,生活環(huán)境與白鷴(Lophura nycthemera whiteheadi)及灰孔雀雉(Polyplectron bicalcaratum katsumatae)相似[2]。……