CREB5在大腸癌轉移中的調控機制

齊魯,丁彥青,

1. 南方醫科大學基礎醫學院病理學系,廣州 510515;

2. 南方醫科大學南方醫院病理科,廣州 510515

大腸癌早期癥狀不明顯,發現時通常已發生轉移,且轉移是影響大腸癌患者預后的重要因素,是否發生轉移與患者的生存時間密切相關。因此轉移是大腸癌主要危害之一,篩選大腸癌轉移相關信號調控網絡中的關鍵調控點,對闡明大腸癌轉移分子機制、尋找有效的藥物治療靶點有著重要意義。

在本課題組前期研究工作中,利用 GSEA[1](Gene set enrichment analysis)工具對具有 TNM(Tumor node metastasis)分期信息的大腸癌表達譜數據進行了功能富集分析,比較分析了早期T1、T2期和晚期M1期的大腸癌表達譜數據,GSEA富集類別選擇 miRNA作用位點基因集以及轉錄因子結合位點基因集,最終篩選出了與大腸癌轉移密切相關的miRNA及轉錄因子結合位點,對相關富集類中表達上調的基因取交集,獲得在大腸癌晚期 M1期表達上調、且上游調控區域具有較多轉移相關miRNA作用位點和轉錄因子結合位點的關鍵基因 CREB5(cAMP responsive element binding protein 5)[2]。

本課題組利用SAM3.01[3](Significance Analysis of Microarrays)對具有生存時間信息的大腸癌表達譜數據進行分析,篩選出與大腸癌患者生存時間相關的基因共235個,利用TFM-Explorer[4](The transcription factor matrix explorer)工具對235個基因進行轉錄因子結合位點富集分析,獲得與大腸癌生存時間密切相關的轉錄因子結合位點,對轉錄因子結合位點所對應的基因取交集,獲得含有生存相關轉錄因子結合位點較多的基因,將這些基因與早期轉移大腸癌中表達上調的基因集取交集,得到與患者生存時間相關、受轉錄因子調控較多、且在大腸癌組織中表達上調的關鍵基因同樣為CREB5[5,6]。……