李嬌, 郭予琦, 崔偉玲, 許愛(ài)華, 田曾元
鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院, 鄭州 450001
玉米苗期SR蛋白基因家族的干旱脅迫應(yīng)答
李嬌, 郭予琦, 崔偉玲, 許愛(ài)華, 田曾元
鄭州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院, 鄭州 450001
基因表達(dá)的選擇性剪接(Alternative splicing, AS)調(diào)控與植物對(duì)逆境脅迫應(yīng)答密切相關(guān), SR蛋白(Serine/ arginine-rich proteins)是其中關(guān)鍵的調(diào)節(jié)因子。文章對(duì)玉米B73參考基因組進(jìn)行分析顯示: 多數(shù)SR蛋白家族基因成員啟動(dòng)子區(qū)域含有3~8種與發(fā)育或脅迫相關(guān)的順式調(diào)控元件; 27個(gè)基因成員編碼堿性蛋白, 其中23個(gè)成員的編碼蛋白依照其N(xiāo)′端的首個(gè)RRM(RNA recognition motif)結(jié)構(gòu)域特征大體上可劃分為5個(gè)亞組。利用雙向分級(jí)聚類(lèi)方法, 對(duì)三葉期干旱脅迫下玉米雜交種鄭單958及其親本鄭58和昌7-2的SR蛋白基因家族的分析顯示,該基因家族的表達(dá)模式具有明顯的組織表達(dá)特異性和基因型依賴(lài)性特征; 其中在干旱脅迫下地下組織以下調(diào)表達(dá)模式為主, 而地上組織中以上調(diào)表達(dá)模式為主。在重度干旱脅迫后的3個(gè)不同時(shí)段復(fù)水過(guò)程中, 地上和地下組織中SR蛋白基因家族的表達(dá)皆以下調(diào)表達(dá)模式為主。另外, 盡管不同基因成員的表達(dá)模式在干旱脅迫及其后的復(fù)水過(guò)程中存在明顯差異, 但普遍存在自身選擇性剪接現(xiàn)象。SR蛋白基因家族在玉米干旱脅迫的應(yīng)答規(guī)律, 為從AS-network視角解析玉米的抗逆分子機(jī)制提供了新思路。
玉米干旱脅迫; SR蛋白基因; 表達(dá)模式; 選擇性剪接
選擇性剪接(Alternative splicing, AS)又叫可變剪接, 指某真核生物基因轉(zhuǎn)錄出的 pre-mRNA通過(guò)不同的剪接方式和剪接位點(diǎn)的選擇調(diào)節(jié), 形成不同的成熟mRNA的過(guò)程。……