sgf73+在裂殖酵母中的大規模遺傳篩選

郭雨辰, 雷秉坤, 鄧小龍, 余垚, 呂紅

復旦大學生命科學學院, 遺傳工程國家重點實驗室, 上海 200433

sgf73+在裂殖酵母中的大規模遺傳篩選

郭雨辰, 雷秉坤, 鄧小龍, 余垚, 呂紅

復旦大學生命科學學院, 遺傳工程國家重點實驗室, 上海 200433

遺傳相互作用(Genetic interaction, GI)直接提示了生物體內各個基因在功能上的關聯性, 為研究一個基因的潛在功能提供了線索。遺傳篩選是研究基因遺傳相互作用的重要方法。文章以 SAGA(Spt-Ada-Gcn5 acetyltransferase)復合物去泛素化模塊亞基基因sgf73+為查詢基因, 在裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中進行了大規模遺傳篩選。結果顯示, 164個基因與 sgf73+具有負遺傳相互作用, 42個基因具有正遺傳相互作用。GO(Gene ontology)分析結果表明, 這些基因富集于染色質修飾、DNA損傷修復、壓力應答、RNA轉錄等生物過程。通過組蛋白修飾檢測實驗首次發現, sgf73+的缺失導致組蛋白H3K9、H4K16位點乙酰化水平下降, H3K4位點甲基化修飾水平上升。此外, 系列稀釋實驗顯示sgf73Δ菌株對DNA損傷試劑HU和CPT的敏感性提高, 并且Sgf73參與高氧脅迫應答。這些結果顯示sgf73+參與了染色質修飾、DNA損傷修復和高氧壓力應答過程。

遺傳相互作用; 裂殖酵母; sgf73+; 組蛋白修飾; DNA損傷修復; 壓力應答

遺傳相互作用(Genetic interaction, GI)是研究生物基因型和表型關系之間的橋梁[1,2], 在揭示生物網絡的基因冗余性、理解人類重大疾病的分子機制中發揮重要作用[3,4]。遺傳篩選是探究基因間遺傳相互作用的重要方法。近年來隨著高通量篩選技術的快速發展, 使得遺傳相互作用的大規模篩選得以實現, 從而為解讀生物體中各個基因之間的遺傳關系網絡、挖掘重要基因的多功能性提供了很好的研究方法。……