摘要:生物類專業是一門實踐性強的專業,其專業英語教學也同時應具備較強的實用性。本文以生物類專業分子生物學內容為例子,提出了專業英語的實踐性教學思路,包括閱讀專業英文文獻、使用專業軟件、閱讀實驗工具的說明書、專業網站的解析等方面,以期提高學生運用專業類英語的能力。
關鍵詞:生物;專業英語;實踐性教學
中圖分類號:G642.0?搖 文獻標志碼:A 文章編號:1674-9324(2013)25-0070-02
生物類專業英語課是面向生物科學和生物技術專業高年級本科生開設的必修課程,其先修課為大學英語及一些專業基礎課程,教學目標為拓寬學生專業詞匯量,幫助提高學生閱讀專業英語的能力,熟練使用一些英文版本的專業工具,為專業科技論文的書寫打下良好的基礎。但是,該課程很容易停留在生物科普英語文章的閱讀上,從而成為大學英語教學的簡單延伸。筆者認為,生物類專業英語的教學應該加強其實踐性,其上課方式應有機地結合專業課和英語課的教授方式,使學生不僅掌握專業英語詞匯,并且能夠對已經學習過的專業基礎課進行有效的復習及進一步的加深理解,而且能夠基本掌握英文版本的專業工具。分子生物學是生命科學發展過程中產生的對生物在分子層次上進行研究的一門課程,其研究領域涵蓋了遺傳學、生物化學和生物物理系等學科,是生物科學和生物技術專業本科生非常重要的專業基礎課,同時也是一門理論性和實踐性緊密結合的課程。
本文以分子生物學的內容作為例子,來探討生物類專業英語教學的一些思路,以期對生物類專業英語的教學改革起到拋磚引玉的作用。該部分教學內容可包含以下幾個部分。
一、英文說明書的閱讀
一般說明書內容包括最基本的產物概況、性能、特點、使用方法和保存等。在分子生物學實驗中,最基本的實驗操作有質粒提取、各類酶的使用、PCR操作等。通過對說明書的閱讀,學生不僅能熟悉這些試劑、藥品的英文單詞,而且能夠對以前學過的專業知識加以熟悉。比如在酶切反應實驗中,主要的工具是限制性內切酶,很多學生做該類實驗的時候,都是請教老生,或者直接依賴于某些現成的操作步驟。一般情況下沒有太多問題,但是如果某些酶比較特殊,有特殊的反應溫度或具有星活性,不仔細鉆研說明書的話,就很容易出錯。還有些學生對酶的保存或適用緩沖液也比較糊涂。利用專業英語課,對限制性內切酶的說明書進行閱讀,學生可以對限制性內切酶有系統的了解,包括濃度、純度、使用方式、貯存液等英文描述,而且養成學生做實驗前仔細閱讀特定酶說明書的習慣。例如,在NEB(New England Biolabs)出產的BamHI核酸內切酶說明書里,包括四大部分的內容:一是產品的基本信息,比如酶量、濃度、生產批號、貯存條件、保質期、識別序列等;二是產品包裝的說明,其中有購買該酶附帶在反應中共同使用的試劑(Reagents Supplied with Enzyme),反應條件(Reaction Conditions)及附帶試劑中緩沖液的組成(1X NEBuffer 3),酶單位定義(Unit Definition)以及稀釋兼容性(Diluent Compatibility);三是產品質量控制檢測(Quality Control Assays),說明該酶出廠前有以下幾種質量控制檢測方式,分別是Ligation、16-Hour Incubation、Exonuclease Activity、Endonuclease Activity和Blue/White Screening Assay,并對每種檢測方式進行描述;四是酶的特性(Enzyme Properties),包括在不同緩沖液中的活性(Activity in NEBuffers)、酶活性持續時間(Survival in a Reaction)、是否加熱失活(Heat Inactivation)以及對質粒的切割時間及用量(Plasmid Cleavage)。這些方面的內容在一般教科書里都沒有,但是學生又是在使用該酶時必須要掌握的知識,不僅是簡單的英文翻譯,并且其專業內涵也要清楚。
二、文獻摘要的閱讀
文獻摘要是科技論文的精華,是簡明扼要呈現文獻主要內容的一種方式,能使讀者在最短的時間內得知原著的大意。這也是生物學家在尋找研究思路,確定研究方法之前最大量閱讀的文獻類型。盡量選擇學生在專業課中已經學習過的,同時也是分子生物學課程中的重點內容,比如核酸結構和功能、蛋白質結構和功能、分子生物學研究技術等的相關文獻。文獻主要有兩大類,一類是綜述文獻,是在大量研究論文的基礎上進行歸納、提煉出來的針對某一專題的文章;另一類是實驗研究論文,是指通過實驗對某些科學問題進行研究,最后通過結果得出結論的一些文章。例,發表在2009年Nature上的“On the road to reading the RNA-interference code”就是一篇綜述文獻,其摘要為:The finding that sequence-specific gene silencing occurs in response to the presence of double-stranded RNAs has had an enormous impact on biology,uncovering an unsuspected level of regulation of gene expression.This process,known as RNA interferenc(RNAi)or RNA silencing,involves small non-coding RNAs,which associate with nuclease-containing regulatory complexes and then pair with complementary messenger RNA targets,thereby preventing the expression of these mRNAs.Remarkable progress has been made towards understanding the underlying mechanisms of RNAi,raising the prospect of deciphering the 'RNAi code' that,like transcription factors,allows the fine-tuning and networking of complex suites of gene activity,thereby specifying cellular physiology and development.該摘要簡潔地介紹了RNAi技術的意義及基本過程,然后提出了在對RNAi深入研究的基礎上,可通過破譯RNAi密碼來對基因進行更為精確的調節,以調控細胞的生長發育。通過閱讀這篇簡短的摘要,學生可以了解RNA沉默的兩種表述方式“RNA interference”和“RNA silencing”,以及RNAi過程,即通過非編碼小RNA與具有酶活性的調節復合體共同作用于互補與小RNA的信息RNA的靶序列,抑制其表達。在講解的過程中,還可以讓學生回顧RNA的分類及不同RNA的功能,并且將幾種RNA的英文表述進行復習。
三、專業軟件的使用
在分子生物學序列分析中,有不少常用的免費軟件都是英文界面的,如ApE可以對基因序列進行各種操作,將序列從環形轉換為線形,還可以轉換為互補序列,并且可以對序列進行酶切位點分析,簡單的質粒酶切圖譜繪制,酶切片段大小分析,開放閱讀框架查找,核酸序列到氨基酸序列的轉換及蛋白質片段分子量計算,引物設計,不同序列同源性比對,這些功能能滿足基本的分子生物學核酸序列分析,界面簡單。在講授方式上,可以給出一些DNA序列,選定一些限制性內切酶,讓學生直接用該軟件分析酶切后的片段的預計大小,或者對一些同源序列進行比對等。
四、專業網站的解析
學生應該學會使用公共平臺上的一些專業網站,如美國國家生物技術信息中心NCBI,具有強大的數據庫檢索系統,能進行基因序列分析、染色體分析、基因組規模分析、基因表達及分型分析、蛋白質結構及建模分析,為全世界生物學家所最為常用的專業網站。針對生物科學和生物技術專業的大學生,可采用其相對比較簡單的功能入手,比如進行文獻的Pubmed及一些核酸序列的同源序列搜索功能。在講授方式上,文獻檢索可給出學生在專業課和專業基礎課中學過的一些知識的英文單詞,如讓學生去進行檢索,其檢索內容盡量具體,比如酵母雙雜交(yeast two hybrid),輸入英文單詞后,就會顯示出很多文獻,這些文獻都按時間發表的先后順序進行排列,最新的排在最前,因為該技術已經被發明了很多年,所以前面大多文獻都只是使用了該技術,如果想深入了解其原理,可以在右方的“related searches”中點擊“yeast two hybrid system review”,這類綜述文章就會更深入地討論該技術的發明、發展及應用。通過文獻檢索,不僅讓學生熟悉該網站的功能,培養進行英文檢索的習慣,并且能開拓他們的視野,讓他們知道新的研究成果每天都在層出不窮。
這幾方面的內容可以有機地聯系在一起。比如,先給學生一些需要查找文獻的關鍵詞,然后從搜索出來的文獻中找出部分來讓學生進行摘要閱讀;或者給出一段DNA序列,讓學生在NCBI數據庫中進行搜索,看看是什么樣的基因,并用ApE軟件進行酶切位點分析,編碼的蛋白質序列分析,再選定其中的酶切位點,讓學生閱讀該內切酶的說明書,甚至可以延伸到怎么樣對該基因進行克隆。
綜上所述,筆者認為,生物類專業英語的教授方法應該緊扣專業知識,讓學生學習及掌握英文這門工具對專業知識的拓展和專業技術的使用,從而具有更強的實用性。
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作者簡介:費小雯(1973-),女,四川洪雅人,博士,海南醫學院理學院生物化學與分子生物學教研室副教授。