亞生江·托乎提 李彥華 徐紅霞 李卉 李惠武 羅永海 汪常偉 鄒廣華
新疆維吾爾族和漢族非綜合征型感音神經(jīng)性聾患者線粒體DNA 12Sr RNA A1555G突變分析△
亞生江·托乎提1李彥華1徐紅霞2李卉3李惠武3羅永海1汪常偉1鄒廣華1
目的 研究新疆地區(qū)維吾爾族(簡稱維族)和漢族非綜合征型感音神經(jīng)性聾患者線粒體DNA(mtDNA)12SrRNA A1555G突變頻率并比較其差異。方法 新疆地區(qū)非綜合征型遺傳性聾患者維族88例、漢族75例為患者組;正常人維族82例、漢族78例為正常對照組。抽取所有受檢者外周靜脈血,從白細(xì)胞中提取DNA,多聚酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增線粒體DNA目的片斷,Alw26I限制性內(nèi)切酶檢測A1555G點(diǎn)突變,對陽性病例的PCR產(chǎn)物進(jìn)行DNA測序驗(yàn)證。結(jié)果 正常組中未檢出DNA12Sr RNA A1555G突變,患者組中檢出16例mtDNA A1555G點(diǎn)突變,12人為漢族(16.00%,12/75),4人為維族(4.55%,4/88),漢族與維族比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=6.001,P=0.014)。結(jié)論 線粒體DNA12S r RNA A1555G突變是導(dǎo)致新疆地區(qū)非綜合征型遺傳性聾患者致病的主要原因之一,漢族高于維吾爾族。
非綜合征型; 基因; 突變; 遺傳性聾; 線粒體
據(jù)統(tǒng)計,有0.05%~0.10%的兒童出生時為極重度聾,同時,一半以上的先天性聾是由于遺傳因素造成的[1]。遺傳性聾患者中有30%為綜合征型聾,70%為非綜合征型聾[2]。線粒體DNA(mtDNA)12Sr RNA A1555G突變可以導(dǎo)致非綜合征型遺傳性聾,其突變的發(fā)生頻率在中國不同地區(qū)、不同民族之間有很大差異[3]。本研究旨在對中國新疆地區(qū)維吾爾族和漢族非綜合征型遺傳性聾患者進(jìn)行mtDNA 12Sr RNA A1555G突變的研究并比較其差異,為今后該地區(qū)維漢民族遺傳性聾的預(yù)防和治療提供可靠的依據(jù)。
1.1 研究對象 收集新疆喀什、阿克蘇、和田等部分邊遠(yuǎn)、貧窮、落后地區(qū)的非綜合征型遺傳性聾患者163例為患者組。其中維族88例,漢族75例;男82例,女81例;年齡3~22歲,平均15.20±2.90歲。同時,選擇該地區(qū)聽力正常人群160例為正常對照組,其中維族82例,漢族78例;男80例,女80例,年齡3~23歲,平均15.70±3.50歲。對全部研究對象由專業(yè)人員進(jìn)行純音測聽和聲導(dǎo)抗檢查,對不能配合的患者行耳聲發(fā)射、聽性腦干反應(yīng)檢查。耳聾分級[4]:輕度:20~40 dB HL;中度:41~70 d B HL;重度:71~95 dB HL;極重度:>95 d B HL。163例耳聾患者中重度聾151例,中度聾12例。聾前有明確氨基糖苷(aminoglycoside antibiotic,Am An)類抗生素應(yīng)用史者32例,其中漢族15例,維吾爾族17例,用藥年齡多在半歲到2歲之間,用藥原因多為感冒、發(fā)燒和腹瀉,但具體用藥量不詳。
耳聾患者入選標(biāo)準(zhǔn)[5]:①雙側(cè)對稱性的、以高頻聽力下降為主的感音神經(jīng)性聾;②有家族史,家系中至少2人耳聾;③不伴其他任何癥狀。排除標(biāo)準(zhǔn):①有與國外種族聯(lián)姻家族史者;②外耳、中耳畸形;有可能導(dǎo)致傳導(dǎo)性聾病史,如有急慢性中耳炎、中耳或外耳手術(shù)史,聲導(dǎo)抗測試結(jié)果異常;③有其他明確的導(dǎo)致聽力下降的原因(如:細(xì)菌性腦膜炎、迷路炎、累及耳蝸的顳骨骨折等);伴有全身疾病者(如:心臟病、糖尿病等);④有影響聽力檢測結(jié)果的疾病(如:智力障礙者);⑤診斷為進(jìn)行性耳聾的患者(如自身免疫性內(nèi)耳病、梅毒性內(nèi)耳疾病等);⑥己經(jīng)明確為綜合征型聾患者(如:Waadrnebugr綜合征、Usher綜合征等)。
1.2 方法
1.2.1 DNA提取 采集受檢者外周靜脈血2~4 ml,用酚/氯仿法從白細(xì)胞中提取基因組DNA(含線粒體DNA),應(yīng)用1%瓊脂糖進(jìn)行電泳和分光光度計進(jìn)行純度和濃度鑒定。TE溶解,-20℃凍存。蛋白酶K、TE、50×TAE液、限制性內(nèi)切酶A1w26I及與其配套使用的Buffer均購于上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司。
1.2.2 線粒體DNA目的片斷的PCR反應(yīng) 以外周血白細(xì)胞DNA為模板,應(yīng)用Primer3軟件在線設(shè)計,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成的引物5’CCCTGATGAAGGCTACAAAGTAAGCGC 3’(nt 1278-1304);R:5’CAGCTATC ACCAGGCTCGGTAGGTTT 3’(nt 2018-1993)擴(kuò)增產(chǎn)物為741 bp。PCR反應(yīng)體系為50μl,反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,65℃復(fù)性1 min,72℃延伸45 s,35個循環(huán),反應(yīng)終止后再72℃延伸10 min,4℃保存。取5μl進(jìn)行2%瓊脂糖電泳檢測PCR產(chǎn)物。
1.2.3 Alw26I酶切分析 取PCR反應(yīng)產(chǎn)物8μl,buffer 2 μl,Alw26I內(nèi)切酶0.5μl,補(bǔ)充雙蒸水至20μl,37℃水浴箱內(nèi)消化120 min,以2%瓊脂糖凝膠電泳觀察酶切結(jié)果。
1.2.4 DNA序列測定驗(yàn)證 對于經(jīng)酶切確定為陽性的病例,取相應(yīng)的PCR產(chǎn)物純化后送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測序部完成,應(yīng)用NCBI數(shù)據(jù)庫BLAST在線比對測序結(jié)果,用DNAMAN軟件將產(chǎn)物序列與標(biāo)準(zhǔn)序列比對,找出堿基改變的位點(diǎn),分析突變情況。12Sr RNA標(biāo)準(zhǔn)序列參照:NC_011137。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS13.0統(tǒng)計軟件包進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。維漢民族mtDNA A1555G突變的陽性率比較采用χ2檢驗(yàn),當(dāng)理論頻數(shù)<1時使用Fisher確切概率法,P<0.05認(rèn)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 限制性內(nèi)切酶酶切結(jié)果 mt DNA 12Sr RNA A1555G突變使原存在于線粒體基因1552~1556位的Alw26I酶切位點(diǎn)消失。有這種突變的PCR片斷,用Alw26I酶切后經(jīng)瓊脂糖電泳仍為一條帶,而無此突變的擴(kuò)增片斷則被切割成278 bp和463 bp兩條帶(圖1)。對所有酶切呈一條帶的患者,再取PCR反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行直接測序驗(yàn)證(圖2)。

圖1 PCR產(chǎn)物經(jīng)Alw26I酶切分析檢測mt DNA 12Sr RNA A1555G突變M:PCR分子量標(biāo)準(zhǔn)物(DL2000);2、3、6、9、10:Alw26I酶切后的突變樣品,其中2、3、6為漢族,9、10為維族;其余為Alw26I酶切后的無突變樣品
2.2 基因突變檢測結(jié)果 正常對照組中未檢出mtDNA A1555G突變。163例耳聾患者中16例(9.82%,16/163)存在mtDNA A1555G突變,其中漢族12例(16.00%,12/75),維族4例(4.55%,4/88),漢族mtDNA A1555G突變檢出率顯著高于維吾爾族,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=6.001,P=0.014)。這16例中,漢族8例有Am An應(yīng)用史,維族有3例。
mtDNA突變是導(dǎo)致非綜合征型母系遺傳性聾的主要原因[6],其突變還可以導(dǎo)致個體對致聾環(huán)境因素的易感性增加,其中以對Am An易感的mtDNA12Sr RNA A1555G點(diǎn)突變較為常見。1993年,Prezant等[7]首次證實(shí)線粒體DNA 12Sr RNA A1555G點(diǎn)突變與氨基糖苷類抗生素致聾患者的相關(guān)性,現(xiàn)在也已經(jīng)證實(shí)mtDNA A1555G突變和氨基糖苷類藥物誘發(fā)的耳聾密切相關(guān)[8]。本組患者中,16例存在mt DNA 12SrRNA A1555G突變者中即有11例有AmAn應(yīng)用史。
在我國,氨基糖苷類藥物性聾是導(dǎo)致新生兒先天性聾和成人后天性聾的主要原因之一,通過耳聾基因檢測確定為mt DNA 12Sr RNA A1555G突變陽性的患者,根據(jù)線粒體母系遺傳的特點(diǎn),其所有母系家庭成員應(yīng)終身絕對禁止使用Am An。這樣,在明確病因的同時,大大降低了家族成員發(fā)生藥物性聾的危險性。

圖2 線粒體DNA1555位點(diǎn)序列分析箭頭所指為mt DNA 12Sr RNA A1555G突變位點(diǎn)
mtDNA A1555G突變在不同國家發(fā)病情況不同,甚至同一國家不同地區(qū)、不同民族的發(fā)病也不同。這除了社會經(jīng)濟(jì)因素外,可能與不同的遺傳背景有關(guān)。研究表明日本的NSHL患者中發(fā)現(xiàn)mtDNA A1555G突變的攜帶率為3.45%(11/319)[9]。歐洲中部德國、匈牙利、波蘭320例NSHL中mtDNA A1555G突變有4人,攜帶率為1.25%[10]。北歐丹麥則為2.4%(2/85)[11]。Li等[12]在美國辛辛那提的NSHL兒童中發(fā)現(xiàn)A1555G攜帶率為0.6%(1/164)。戴樸等[3]在對中國不同省份特教學(xué)校的2 016例NHSL患者mt DNAA1555G突變篩查中發(fā)現(xiàn)陽性病例57例,檢出率為2.83%。Malik等[13]在印尼的蘇拉威西島75名非綜合征型聾患者中檢測到A1555G陽性患者4例,A1555G攜帶率達(dá)5.3%,而劉曉雯等[14]報道甘肅A1555G突變陽性率為8.4%(67/802)。本研究顯示本組新疆地區(qū)漢族和維吾爾族非綜合征型性聾者mt DNAA1555G突變總陽性率為9.82%,而漢族陽性率相當(dāng)高,達(dá)16%。分析其高檢出率的原因主要是:①新疆地處祖國西北,屬于貧窮落后地區(qū),醫(yī)療條件和水平落后,缺醫(yī)少藥,Am An具有價格低廉、抗菌譜廣、殺菌作用快等優(yōu)點(diǎn),其使用相對較廣泛,在一定程度上提高了耳聾發(fā)生率,這些患者納入調(diào)查后提高了這一基因突變的檢出率;②也可能是人種、地域、氣候及飲食習(xí)慣等因素共同引起了新疆A1555G突變的高發(fā)生率;③新疆作為一個特殊地區(qū),環(huán)境因素可能參與較多,而氨基糖苷類抗生素誘發(fā)或加重耳聾的程度使環(huán)境因素在耳聾的發(fā)病方面顯得更為突出[15]。線粒體單倍體型的不同也可能引起線粒體基因突變攜帶率的不同,進(jìn)而導(dǎo)致不同民族發(fā)病率的差異;④自身存在的抽樣誤差也可造成維漢兩民族不同的檢出率。本研究樣本量偏小,有待擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步研究。
因此,有必要應(yīng)用基因診斷手段對高危人群或特定人群進(jìn)行mtDNA A1555G突變的普遍性篩查,為存在mtDNA A1555G突變者提供早期診斷、早期干預(yù)、早期治療方案及詳盡的遺傳咨詢;并利用分子遺傳學(xué)檢測手段對于母親孕期或新生兒進(jìn)行mtDNA A1555G突變的篩查,提高非綜合征型聾產(chǎn)前診斷的可能性,減少遺傳性聾的發(fā)生,并為探索相應(yīng)的基因治療方法提供理論依據(jù)。在未來的很長一段時間,Am An還將在醫(yī)療水平滯后地區(qū)繼續(xù)使用,所以預(yù)先發(fā)現(xiàn)對Am An耳毒性致聾的易感性個體就具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。從本研究可以看出,mt DNA A1555G在新疆地區(qū)有較高的突變率,漢族高于維吾爾族,在中國新疆地區(qū)開展維漢兩民族mtDNA 12Sr RNA A1555G突變的檢測工作顯得尤為重要。
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(2010-05-11收稿)
(本文編輯 周濤)
10.3969/j.issn.1006-7299.2011.01.019
R764.44
A
1006-7299(2011)01-0061-04
△ 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30860358)、新疆維吾爾自治區(qū)自然科學(xué)基金項(xiàng)目(200721117)資助
1 新疆醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院耳鼻咽喉科(烏魯木齊 830000); 2 新疆醫(yī)科大學(xué)2007級碩士研究生; 3 新疆醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院科研中心地方病分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
李彥華(Email:liyanhua1953@126.com)