阿麗塔,許培揚,孫靈芝
(中國醫學科學院醫學信息研究所/圖書館,北京 100005)
藥物研發除需了解化學實體及其合成工藝外,還需掌握相關的行政保護、藥理、藥效等信息及市場銷售情況。由于藥學數據庫資源類型復雜,如何科學合理地加以利用,以提高藥物研發的水平,是廣大藥學科研工作者需解決的問題。為此,筆者在系統分析新藥研發流程(研發篩選、臨床前研究、臨床研究、新藥報批)的基礎上,依據新藥研發的流程將藥學數據庫資源分為4類,為藥學科研工作者提供查詢方便。
藥學數據庫資源涵蓋了從藥物市場調研、新藥發現、篩選設計到藥學研究、藥理學和毒理學評價、臨床研究以及藥品上市及上市后監管的信息等各個方面。由于長期以來藥物研發主要由藥物化學和藥理學所驅動,尋找新藥的過程起始于化合物合成,因此早期的藥物數據庫主要以化學數據為主。隨著分子遺傳學、功能基因組學、蛋白質組學和生物信息學的迅猛發展,藥物研發正在向以藥物靶標為起點轉變,化學制藥領域對生物信息的需求迅猛增長,化合物數據庫開始整合生物信息以滿足廣大藥學工作者的需求。創新藥物的研究與開發是推動醫藥產業發展的不竭動力,因此,眾多醫藥信息公司以此為契機,推出了為新藥研發提供信息支持的各類數據庫,以進一步推動醫藥產業的發展。
隨著信息分析、評價理論的發展和信息分析工具的完善,藥學數據庫將在不斷完善檢索功能的基礎上,結合信息分析評價的理論和方法對檢索結果進行分析,為廣大藥學科研工作者提供更有價值的信息[1]。
2.1 項目調研數據庫資源
Inpharma Databas(新藥信息全文數據庫):是美國Adis公司推出的藥物信息全文數據庫。該庫主要收錄了關于新藥物、治療突破、藥物經濟學、藥物研究與開發(R%D)、藥物反應、藥物應用的發展趨勢及衛生保健政策等方面的評論性、總結性報告。
Pharma-Transfer(藥物研究與開發信息庫):是由美國UTEK公司研制的藥物研究與開發信息庫,可提供藥物早期發現、臨床前及臨床試驗、產品注冊等信息,為藥物合作開發與授權提供機遇。
Prous Science Integrity(Prous綜合醫藥信息平臺):由Prous Science公司1958年研制開發,數據庫中收錄了30多萬種上市和在研藥物,以及關于這些藥物的實驗藥理學數據、藥代動力學、代謝數據、臨床實驗記錄等,同時還包括相關疾病綜合評述、藥物合成方法、專利、生物標記物、公司、基因序列、文獻新聞等信息。
Thomson Pharma(綜合性全球藥學信息解決方案):是Thomson Reuters公司于2004年研發的生物技術企業動態信息集成和知識管理平臺。它集成了科學數據庫、財經數據庫、衛生保健數據庫和法律及管理數據庫4類數據庫,每一類數據庫中又包含了多個數據庫。這4類數據庫實現了無縫集成檢索,而且對用戶是透明的。
2.2 臨床前研究數據庫資源
DerwentDrug File(德溫特藥學文檔):由德溫特出版有限公司推出,收錄了1983年至今幾乎所有關于藥物科學的文獻,年收錄量約為10萬條,數據來源于1 200種科學出版物,包括世界范圍內的期刊和會議記錄,其中大約11%的資料來源于非英語語種文獻,內容涉及藥品開發、生產制備、藥物評價等方面,包括分析化學、生物化學、內分泌、免疫學、醫學、微生物學、制劑學、藥理學、生理學、毒理學等。
World Drug Index(世界藥物索引):由德溫特出版有限公司推出,是世界上已上市藥物和正在開發藥物的權威索引,提供了每個藥物的活性、作用機制、功能主治、生產者、別名以及醫學信息。
Xpharm(藥理學信息數據庫):由Elsevier公司推出,提供了藥劑、分子靶標、相關紊亂以及反應控制機理等信息。Xpharm包含3 700篇藥理學文獻,其格式簡潔,引文豐富,易于閱讀和吸收。Xpharm每年更新2次。
CrossFire Beilstein/Gmelin:由 Elsevier公司推出,CrossFire Beilstein是世界上最大的關于有機化學的事實型數據庫,數據來源于175種期刊,已收錄超過960萬個化合物和1千萬個有機化學反應,以及3億2千萬個按科學方法測試的事實。CrossFiregmelin是金屬有機和無機化學領域收錄數據最廣泛的數據庫,收錄了1771年以來文獻記錄中的234萬個化合物、180萬個反應以及123萬篇1995年以來包括標題和文摘的文獻引文。
SciFinder數據庫:1998年美國化學文摘社推出了CA網絡版產品的學術版SciFinder。SciFinder的內容幾乎涉及了化學家和生物學家感興趣的所有領域,其中除有機化學、藥物化學、分析化學、無機化學、材料學、物理化學、高分子化學外,還包括藥物學、毒物學、環境化學、生物學以及物理學等共80大類學科領域。
BIOSISPreviews(生物學文獻庫):由美國生物科學信息服務社出版,該庫收錄了會議、報告、評論、圖書、專論等多種文獻,學科涵蓋生物學、生物化學、生物技術、植物學、醫學、藥理學、動物學、農業、獸醫學等領域。
EMBASE.com數據庫(荷蘭醫學文摘數據庫):是Elsevier公司推出的生物醫學與藥理學文獻數據庫,是EMBASE與MEDLINE強強聯合而成的生物醫學與藥理學信息專業檢索引擎。EMBASE.com覆蓋各種疾病和藥物信息,尤其涵蓋了大量歐洲和亞洲醫學刊物,其他同類型數據庫無法匹敵。
PubMed數據庫:由美國國立醫學圖書館下屬的國家生物技術信息中心開發研制,涉及醫學、護理學、牙科學、獸醫學、衛生保健和基礎醫學等[2]。PubMed以收錄期刊為主,是一個基于互聯網的大型數據庫系統,向全球公眾免費提供生物醫學論文的題錄檢索服務,并提供期刊或者其他相關網絡全文鏈接[3]。
2.3 臨床研究數據庫資源
ClinicalTrial.gov(臨床試驗信息網站):是由美國國立衛生研究所通過美國國立醫學圖書館與美國食品藥品監督管理局合作建立的提供臨床試驗信息的數據庫。截至2009年9月,Clinical Trial.gov共收錄來自172個國家的78 337條臨床試驗信息,這些信息由NIH和其他聯邦機構以及私營企業贊助。
Drugs in Clinical Trials Database(藥物臨床試驗數據庫):由美國CenterWatch信息服務公司研發。該數據庫包含3 000多種藥物的從臨床!期到臨床"期的詳細研發信息,每周更新;數據來源廣泛,包括通過與研發機構溝通獲取信息、參加專業會議獲取信息、與業內專業人士交流獲取信息等;數據經過嚴格篩選,信息過時即刻被刪除,確保了信息準確。
PharmaPendium(藥物安全信息數據庫):由Elsevier公司于2007年推出,是以搜索美國食品藥物管理局和歐盟藥品監督管理局的批準信息包為特色的產品。PharmaPendium能夠提供臨床前、臨床中與上市后的藥品安全信息的縱向視圖,從而使得研究人員能夠確定類似的候選復方藥品已經觀察到的動物療效能否適用于人類。
2.4 藥物評審信息數據庫資源
European Medicines Agency(歐洲藥品審評管理局):歐洲藥品審評管理局集成了各歐盟成員國的研究資源和國家級的監督機構網絡,主要負責整個歐盟范圍內藥物及相關醫用產品的技術審查和批準上市工作,并全面負責評價藥品的科學性,監測藥品在歐盟范圍內的安全性、有效性。
USFood and Drug Administration(美國食品藥品監督管理局):美國食品藥品監督管理局下屬機構藥品評審和研究中心(Center for Drug Evaluation and Research,CDER)是負責美國人用藥(處方藥、非處方藥和生物制藥)上市前審批和上市后監管的政府機構。CDER對同類信息提供多角度、多方位的檢索途徑和檢索入口,同樣的信息可通過不同的途徑和方法來獲取[4]。
Ministry of Health,Labour and Welfare(日本厚生勞動省):日本厚生勞動省是日本負責醫療衛生和社會保障的主要部門,設有11個局,主要負責日本的國民健康、醫療保險、醫療服務提供、藥品和食品安全、社會保險和社會保障、勞動就業、弱勢群體社會救助等職責。
中國國家食品藥品監督管理局:是中國食品和藥品的監管機構,其網站中提供數據查詢,資源包括我國藥品監督管理部門批準的藥品、器械、保健食品、化妝品、安全監管、市場監管等相關數據。
Recently Approved Drugs by the Food and Drug Administration (美國FDA審批藥物目錄):由美國CenterWatch信息服務公司研發,該目錄提供自1995年以來經美國FDA批準在美國銷售的藥物信息。
[1]馬建玲.新一代制藥和生物技術企業動態信息服務系統[J].中華醫學圖書情報雜志,2007,16(1):58-60.
[2]朱華玲.CHKD與PubMed檢索功能對比分析[J].醫學信息雜志,2008 (11):39-43.
[3]鄭 靜,鄭傳友,程紹敏,等.PubMed:一個重要的生物醫學論文數據庫系統的簡介[J].中國現代醫學雜志,2008,18(16):2 429-2 432.
[4]楊 悅,尹 戎,董 麗.美國FDA藥品不良反應檢測體系簡介[J].中國工業醫學雜志,2003,16(5):305-307.