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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究五味子抗心力衰竭作用

2024-03-04 08:32:16徐嘉豪劉成琳武子敬夏清瑤童華利劉雪坤
人參研究 2024年1期
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)分析研究

徐嘉豪,劉成琳,武子敬,夏清瑤,童華利,劉雪坤

(通化師范學(xué)院?吉林 通化?134002)

心力衰竭(HF)是各類心臟病的最終過(guò)程。發(fā)病率和致死率均較高,五年內(nèi)存活率小于50%,與惡性腫瘤相仿,正在成為21 世紀(jì)最嚴(yán)重的心血管病癥[1-3]。中藥具有辨證論治、整體觀念的特點(diǎn),可以更好的發(fā)揮治療效果。五味子具有收斂固澀,益氣生津,補(bǔ)腎寧心等功效,主要分布在東北、華北地區(qū)。五味子最早見(jiàn)于《神農(nóng)本草經(jīng)》,列為上品。現(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn)五味子能起到保護(hù)心血管細(xì)胞的作用[4-6]。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是從生物網(wǎng)絡(luò)的角度,研究疾病發(fā)生和發(fā)展的過(guò)程,認(rèn)識(shí)藥物化學(xué)成分與機(jī)體靶點(diǎn)的相互作用,并指導(dǎo)新藥研發(fā)的新學(xué)科。應(yīng)用高通量組學(xué)數(shù)據(jù)、分子網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù),對(duì)藥物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)整體的分析,有利于理解藥物的多靶點(diǎn)、多途徑網(wǎng)絡(luò)作用模式,研究藥物的藥理作用機(jī)制及新藥研發(fā),將藥物作用重新定位的同時(shí)開(kāi)展老藥新用的研究[7-10]。通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究五味子治療心力衰竭的潛在作用靶點(diǎn),探討五味子治療心力衰竭的作用機(jī)制,為后續(xù)的研究提供數(shù)據(jù)支持和科學(xué)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 五味子化學(xué)成分的篩選與靶點(diǎn)預(yù)測(cè)

使用TCMSP(http://tcmspw.com/tcmsp.php)數(shù)據(jù)庫(kù),以口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18、滲透性(Caco-2)>-0.4 為篩選條件,得到五味子的化學(xué)成分。將得到的化學(xué)成分信息通過(guò)TCMSP 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行靶點(diǎn)提取,進(jìn)一步使用Uniprot 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.uniprot.org/) 中的搜索功能,將物種設(shè)置為human,對(duì)搜集篩選得到的靶點(diǎn)蛋白與基因信息進(jìn)行校正,獲得靶點(diǎn)的Uniprot ID,運(yùn)用Cytoscape3.9.2 軟件構(gòu)建“化合物-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖。

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