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長沙地區(qū)血小板供者基因數(shù)據(jù)庫理論建模分析*

2023-08-02 10:58:30蔣義陽智芬曹麗群陳潔楊妞康甜謝毓濱長沙血液中心輸血研究所長沙410001
臨床檢驗雜志 2023年4期
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫

蔣義,陽智芬,曹麗群,陳潔,楊妞,康甜,謝毓濱(長沙血液中心輸血研究所,長沙410001)

單采血小板輸注主要用于預(yù)防和治療血小板減少或血小板功能異常引起的出血,然而免疫性血小板無效輸注(platelet transfusion refractoriness,PTR)在長期血小板輸注的患者中發(fā)生率為10%~70%,遠(yuǎn)高于其他輸血不良反應(yīng)的發(fā)生率[1]。免疫性PTR主要由人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)抗體及人類血小板抗原(human platelet antigen,HPA)抗體引起,而HLA及HPA抗原具有遺傳多態(tài)性,在不同地區(qū)和不同人群中分布有所差異[2]。因此,建立本地區(qū)血小板供者已知HLA/HPA基因數(shù)據(jù)庫,可為臨床提供與患者HLA/HPA相匹配的單采血小板,大大降低免疫性PTR的發(fā)生,提高臨床血小板輸注的有效性。目前,長沙地區(qū)已建立了血小板供者已知HLA/HPA基因數(shù)據(jù)庫,但建立多大的庫存規(guī)模可滿足本地區(qū)臨床基因匹配單采血小板的供應(yīng)尚在摸索實踐中,本研究通過對已知數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,探討建設(shè)規(guī)模與匹配程度的關(guān)系。

1 資料與方法

1.1研究對象 長沙地區(qū)無親緣關(guān)系的單采血小板捐獻(xiàn)者1 029名,年齡18~45歲,所有志愿者均簽署加入血小板資料庫知情同意書。本研究已通過長沙血液中心倫理委員會批準(zhǔn)。

1.2主要儀器與試劑 Ion Gene StudioTMS5二代測序儀,A24811 PCR儀、Q5熒光定量PCR儀及AllTypeTMNGS HLA分型試劑(美國賽默飛世爾科技公司),Epoch酶標(biāo)儀(美國BioTek公司)。全血基因組DNA提取試劑盒(北京天根公司),熒光PCR法HPA基因分型試劑盒(江蘇偉禾公司)。

1.3方法

1.3.1DNA提取 按照試劑盒說明書提取外周血DNA,其濃度≥30 ng/μL,A260 nm/A280 nm值1.6~2.0。

1.3.2HPA基因分型 采用多重?zé)晒釶CR法,按照試劑說明書進(jìn)行HPA-1~6、10、15及21的基因分型,針對HPA系統(tǒng)多態(tài)性位點設(shè)計擴(kuò)增引物和熒光探針,利用Taq酶5′端外切的特性,分離探針上的淬滅熒光基團(tuán)和報告熒光基團(tuán),依據(jù)熒光強(qiáng)度直接分析產(chǎn)物情況。……

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