黃青昕,劉 婷,胡淇睿,章 旭,潘 瑤,俞燕芳,馮建高,黎小萍,鄧澤元,陳 芳
基于體外模擬消化、發(fā)酵和網(wǎng)絡(luò)藥理學探討桑葉酚類物質(zhì)的潛在生物學活性
黃青昕1,劉 婷1,胡淇睿2,章 旭1,潘 瑤1,俞燕芳3,馮建高1,黎小萍3,鄧澤元2,陳 芳1
1. 南昌大學公共衛(wèi)生學院 江西省預防醫(yī)學重點實驗室,江西 南昌 330006 2. 南昌大學 食品科學與技術(shù)國家重點實驗室,江西 南昌 330029 3. 江西省經(jīng)濟作物研究所,江西 南昌 330202
基于體外模擬消化、發(fā)酵和網(wǎng)絡(luò)藥理學探討桑葉酚類物質(zhì)對于阿爾茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)、癌癥和糖尿病3種疾病的潛在共同作用靶點,為研究桑葉治療多種疾病提供理論基礎(chǔ)。新鮮桑葉冷凍干燥粉碎后模擬體外消化及腸道微生物發(fā)酵過程,取不同消化(或發(fā)酵)階段產(chǎn)物,利用UPLC-Q-TOF-MS/MS技術(shù)分析其中的特征酚類物質(zhì),結(jié)合Swiss Target Prediction和Genecards數(shù)據(jù)庫篩選特征酚類物質(zhì)治療AD、癌癥和糖尿病3種疾病的潛在作用靶點,采用String平臺構(gòu)建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,再用Cytoscape軟件分析特征酚類物質(zhì)與以上3種疾病作用的共同核心靶點,并篩選出其中的主要活性組分;通過David數(shù)據(jù)庫對共同核心靶點進行基因本體(gene ontology,GO)功能和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信號通路富集分析;使用Autodock vina和PyMol軟件對主要活性組分和共同核心靶點進行分子對接。桑葉體外消化(或發(fā)酵)各階段共檢測到19種特征酚類物質(zhì),其中主要活性組分為咖啡酸、槲皮素和山柰酚。特征酚類物質(zhì)與3種疾病交集靶點的共同靶點有48種。PPI得出特征酚類物質(zhì)對3種疾病作用的10個共同核心靶點(AKT1、TNF、EGFR、PTGS2、SRC、TLR4、CASP3、ESR1、STAT3和MMP9)。……