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急性髓系白血病mRNA與非編碼RNA差異表達(dá)譜及CeRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析

2023-02-12 10:51:58張?jiān)旅?/span>羅雅琴鄭偉徐杰董雪燕李善琛王敬毅
生物技術(shù)進(jìn)展 2023年1期
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)差異分析

張?jiān)旅?, 羅雅琴 , 鄭偉 , 徐杰 , 董雪燕 , 李善琛 , 王敬毅

1.山東中醫(yī)藥大學(xué),濟(jì)南 250000;

2.山東中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,濟(jì)南 250000

急性髓系白血病(acute myelogenous leukemia,AML)是骨髓造血干/祖細(xì)胞的惡性克隆性疾病,其特征為髓系祖細(xì)胞快速大量增殖并逐漸取代骨髓正常造血細(xì)胞。其臨床主要表現(xiàn)為貧血、出血、發(fā)熱和感染,該病多具有病情急重、難以控制、容易復(fù)發(fā)、預(yù)后兇險(xiǎn)等臨床特點(diǎn),對(duì)人類的生命健康造成了嚴(yán)重的威脅。已有研究認(rèn)為,染色體數(shù)量或者結(jié)構(gòu)異常、基因突變或表達(dá)水平的異常導(dǎo)致細(xì)胞過度增殖、分化受阻以及凋亡受抑制是AML發(fā)病的主要機(jī)制。而這些過程中,細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)通路以及細(xì)胞周期調(diào)控異常是白血病發(fā)生過程中的關(guān)鍵事件。當(dāng)前AML的治療手段包括化療、造血干細(xì)胞移植和生物治療,這些治療手段使AML的治愈率能夠達(dá)到50%[1],但是AML發(fā)展迅速,發(fā)病原因及機(jī)制較為復(fù)雜,其高度異質(zhì)性導(dǎo)致AML化療后易復(fù)發(fā)[2]。因此,深入研究AML的發(fā)生發(fā)展機(jī)制,探究新的分子標(biāo)志物對(duì)于提高藥物的治療效果以及改善AML患者的預(yù)后具有重要意義。有研究表明,長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)對(duì)微小RNA(microRNA,miRNA)具有海綿吸附作用,可以作為內(nèi)源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)與miRNA競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,從而影響miRNA與mRNA的結(jié)合,調(diào)控腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移[3]。但是,許多l(xiāng)ncRNAs在AML發(fā)生發(fā)展中的生物學(xué)作用及臨床意義還有待進(jìn)一步研究。為此,本研究通過生物信息學(xué)的方法分析AML相關(guān)的差異表達(dá)基因,并構(gòu)建lncRNA-miRNA-mRNA的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析差異表達(dá)基因的生物學(xué)功能及AML發(fā)病的潛在機(jī)制,旨在為發(fā)現(xiàn)AML發(fā)病新的潛在機(jī)制及治療靶點(diǎn)提供理論依據(jù)。……

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