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胃癌組織miR-513a-3p、RNF6表達及其與患者預后的關系

2023-01-14 04:52:34李紅云
胃腸病學和肝病學雜志 2022年11期
關鍵詞:胃癌水平分析

李紅云,徐 陽

中國人民解放軍總醫院第三醫學中心腫瘤內科,北京 100039

胃癌是一種源于胃黏膜上皮的腫瘤,其發病率高,早期無明顯癥狀,使其早期診斷率低,預后較差[1-2]。因此,探尋可早期診治胃癌的有效指標甚是重要。研究認為,胃癌發生發展與微小RNA(microRNA,miRNA)異常表達、幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染、相關信號轉導等有關[3-4]。有關研究顯示,miR-513a-3p在胃癌細胞中呈低表達,其可能是胃癌的診治靶點[5];另外,環指蛋白6(ring finger protein 6,RNF6)在胃癌患者中表達水平較高,其與胃癌發生發展關系密切[6]。但miR-513a-3p在胃癌組織中的表達水平及其與RNF6、預后的關系鮮有報道。因此,本文通過測定miR-513a-3p、RNF6在胃癌組織中的表達情況,分析miR-513a-3p與RNF6的相關性,及二者與胃癌患者預后的關系,以期為臨床診治胃癌提供參考。

1 資料與方法

1.1 臨床資料選取2015年12月至2018年5月我院收治的胃癌患者77例作為研究對象,年齡(59.74±14.38)歲(39~76歲),<60歲33例,≥60歲44例;淋巴結轉移31例,淋巴結未轉移46例;H.pylori感染49例,H.pylori未感染28例;TNM分期:Ⅰ~Ⅱ期45例,Ⅲ~Ⅳ期32例;男46例,女31例;低分化30例,中、高分化47例;腫瘤直徑≤ 5 cm 35例,> 5 cm 42例。

納入標準:(1)患者符合《NCCN胃癌臨床實踐指南》[7]中有關胃癌判定標準,經組織病理檢查確診;(2)患者為初診,有完善的檢查資料;(3)患者對本研究知情同意,獲得了本院倫理委員會批準(批號:2015-04-72)。排除標準:(1)病理檢查難以確定者;(2)合并肝、腎、心器官功能不全、其他腫瘤者;(3)術前接受抗腫瘤治療者。

1.2 方法

1.2.1 Ualcan數據庫檢索:利用Ualcan數據庫(http://ualcan.path.uab.edu)檢索RNF6 mRNA表達水平。gene symbol設為RNF6,TCGA數據集設定為Stomach adenocacinoma,進行檢索。

1.2.2 組織標本收集:收集胃癌患者經手術切除的胃癌組織和距腫瘤邊界2 cm處的組織(癌旁正常組織),迅速放置于液氮中,冷凍24 h,-80 ℃冰箱儲存。

1.2.3 實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法檢測miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平:研碎凍存的胃癌組織和癌旁正常組織,加TRIzol Reagent(S30876,上海源葉生物科技有限公司)以獲得總RNA;隨后用TruScript First Strand cDNA Synthesis Kit(54400-E,加拿大Norgen Biotek公司)將RNA反轉錄成cDNA,且miR-513a-3p的反轉錄采用頸環法,其逆轉錄引物序列為5′-GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGACC-CTTCTCA-3′;最后,利用Perfectstart SYBR Green qPCR master mix(TQ2300-01,北京索萊寶科技有限公司)及qRT-PCR儀(SLAN-96S,上海宏石醫療科技有限公司)將cDNA擴增、檢測。qRT-PCR儀擴增參數:97 ℃ 5 min;94 ℃ 30 s,65 ℃ 30 s,62.8 ℃ 25 s,40個循環。miR-513a-3p、RNF6的內參分別是U6、GAPDH,引物序列如表1所示。miR-513a-3p、RNF6 mRNA相對表達量以2-ΔΔCT法計算。

表1 miR-513a-3p、U6、RNF6、GAPDH引物序列 Tab 1 Primer sequences of miR-513a-3p, U6, RNF6 and GAPDH

1.2.4 生物信息學網站預測miR-513a-3p和RNF6的關系:利用生物信息學網站(http://www.targetscan.org)預測分析miR-513a-3p與RNF6之間的關系。

1.3 隨訪對77例胃癌患者隨訪36個月,隨訪起點為胃癌患者手術當天,隨訪終點為胃癌患者死亡或隨訪至2021年5月,以微信/門診/電話隨訪為主,記錄胃癌患者生存情況。

2 結果

2.1 Ualcan數據庫中胃癌組織和癌旁正常組織RNF6 mRNA表達水平比較Ualcan數據庫中,胃癌組織RNF6 mRNA表達水平高于癌旁正常組織(P<0.05,見圖1)。

圖1 Ualcan數據庫中胃癌組織、癌旁正常組織RNF6 mRNA表達水平

2.2 胃癌組織、癌旁正常組織中miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平比較胃癌組織中miR-513a-3p表達水平低于癌旁正常組織(P<0.05),RNF6 mRNA表達水平高于癌旁正常組織(P<0.05,見表2)。

表2 胃癌組織、癌旁正常組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平比較

2.3 胃癌組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平與胃癌臨床病理特征的關系分別以胃癌組織中miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平的均值0.45、2.18為臨界值,低于miR-513a-3p表達水平均值的胃癌患者為miR-513a-3p低表達組(39例),高于miR-513a-3p表達水平均值的胃癌患者為miR-513a-3p高表達組(38例);低于RNF6 mRNA表達水平均值的胃癌患者為RNF6低表達組(37例),高于RNF6 mRNA表達水平均值的胃癌患者為RNF6高表達組(40例)。結果顯示,胃癌組織miR-513a-3p表達水平與淋巴結轉移、H.pylori感染、TNM分期呈負相關(P<0.05),與胃癌分化程度呈正相關(P<0.05);RNF6 mRNA表達水平與淋巴結轉移、H.pylori感染、TNM分期呈正相關(P<0.05),與胃癌分化程度呈負相關(P<0.05);而胃癌組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平與年齡、性別、腫瘤直徑無關(P>0.05,見表3)。

2.4 胃癌組織中miR-513a-3p表達水平與RNF6 mRNA的相關性Pearson法分析顯示,胃癌組織中miR-513a-3p表達水平與RNF6 mRNA呈負相關(r=-0.575,P<0.05,見圖2);生物信息學分析顯示,miR-513a-3p與RNF6 mRNA存在靶向關系(見圖3)。

表3 胃癌組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平與胃癌臨床病理特征關系[例數(%)]Tab 3 Relationship between expression levels of miR-513a-3p and RNF6 mRNA and clinicopathological features of gastric cancer tissues [n(%)]

圖2 胃癌組織中miR-513a-3p表達水平與RNF6 mRNA的相關性

2.5 胃癌組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平與胃癌患者預后的關系對77例胃癌患者隨訪36個月,生存者54例。Kaplan-Meier生存曲線分析顯示,miR-513a-3p低表達組胃癌患者的平均生存時間為27.77個月(95%CI:24.65~30.89),短于miR-513a-3p高表達組胃癌患者的平均生存時間34.61個月(95%CI:33.19~36.02),Log-Rank檢驗結果顯示,miR-513a-3p高、低表達組胃癌患者的累積生存率比較,差異有統計學意義(χ2=13.761,P=0.000,見圖4);RNF6低表達組胃癌患者的平均生存時間為34.27個月(95%CI:32.66~35.88),長于RNF6高表達組胃癌患者的平均生存時間28.25個月(95%CI:25.20~31.30),Log-Rank檢驗結果顯示,RNF6高、低表達組胃癌患者的累積生存率比較,差異有統計學意義(χ2=9.548,P=0.002,見圖5)。

圖3 生物信息學分析miR-513a-3p與RNF6 mRNA的靶向關系 Fig 3 Bioinformatics analysis of the targeting relationship between miR-513a-3p and RNF6 mRNA

圖4 胃癌組織miR-513a-3p表達水平與胃癌患者預后的關系;圖5 胃癌組織RNF6 mRNA表達水平與胃癌患者預后的關系

2.6 Cox回歸分析胃癌患者預后的影響因素單因素Cox回歸分析顯示,miR-513a-3p、分化程度是影響胃癌患者不良預后的保護因素(P<0.05),H.pylori感染、淋巴結轉移、RNF6、TNM分期是影響胃癌患者不良預后的危險因素(P<0.05);多因素Cox回歸分析顯示,miR-513a-3p是影響胃癌患者不良預后的獨立保護因素(P<0.05),H.pylori感染、淋巴結轉移、RNF6、TNM分期是影響胃癌患者不良預后的獨立危險因素(P<0.05,見表4)。

表4 影響胃癌患者預后的單因素和多因素Cox回歸分析Tab 4 Univariate and multivariate Cox regression analysis affecting prognosis of gastric cancer patients

3 討論

胃癌早期癥狀比較隱匿,無特異性,易被漏診/誤診,且臨床多采用根治性手術治療,但胃癌患者預后較差[8-9]。因此,尋找與胃癌發病相關,且可評估胃癌患者預后的指標,對及早干預,改善胃癌患者的生存狀況有積極意義。

miRNA可調控細胞增殖、信號轉導、細胞凋亡過程,與腫瘤病理變化顯著有關[10-11]。研究發現,miR-513a-3p是miRNA中的一員,其在結直腸癌中表達水平降低,miR-513a-3p可能通過靶向己糖激酶2進而抑制結直腸癌細胞的糖酵解,其可能在結直腸癌中發揮抑癌作用[12];另外,miR-513a-3p在胃癌中表達失調,其可能通過影響己糖激酶2進而影響胃癌發生發展[13]。本研究中胃癌組織中miR-513a-3p表達水平較低,與Wang等[13]研究趨勢一致,提示miR-513a-3p可能與胃癌發病過程相關,推測miR-513a-3p可能通過靶向調節己糖激酶2等有關基因進而影響胃癌細胞增殖、信號轉導等過程,從而在胃癌中起抑制作用,但其具體機制仍需進一步探討。此外,本研究中胃癌組織miR-513a-3p表達水平與淋巴結轉移、H.pylori感染、TNM分期呈負相關,與胃癌分化程度呈正相關,提示miR-513a-3p與胃癌疾病進展程度有關,測定胃癌組織miR-513a-3p表達有利于臨床判斷胃癌患者病情,有助于制定個體治療方案。

RNF6可調控胚胎分化,影響雄性激素受體轉錄,觸發蛋白質泛素化過程,調節蛋白質降解、細胞生長,影響信號轉導過程,與腫瘤發生相關[14-15]。研究發現,RNF6在結直腸癌中表達水平上調,其與淋巴血管浸潤等密切相關,RNF6可能是預測結直腸癌患者預后、腫瘤轉移的標志物[16];另外,RNF6在胰腺癌中呈過表達,其可能促進有氧糖酵解過程,RNF6有望成為治療胰腺癌的潛在靶點[17]。以上研究表明,RNF6表達失調可能與消化道腫瘤發生、發展有關。本研究顯示,胃癌組織中RNF6 mRNA表達水平較高,與黃子明等[6]研究趨勢及Ualcan數據庫分析結果相似,提示RNF6 mRNA可能在胃癌中有重要作用,推測高水平RNF6 mRNA可能通過影響有氧糖酵解,引發蛋白質泛素化、調節信號轉導過程,進而在胃癌中發揮促癌作用,其機制有待深入研究證實。本研究中RNF6 mRNA表達水平與淋巴結轉移、H.pylori感染、TNM分期呈正相關,與胃癌分化程度呈負相關,提示RNF6 mRNA表達水平與胃癌病情進展相關,RNF6 mRNA可作為治療胃癌的有效靶標。

生物信息學分析顯示,miR-513a-3p與RNF6 mRNA存在靶向關系,故本文探討了胃癌組織miR-513a-3p表達水平與RNF6 mRNA的相關性,結果顯示,miR-513a-3p表達水平與RNF6 mRNA呈負相關,提示miR-513a-3p可能與RNF6 mRNA協同影響胃癌病理變化過程,但其機制仍需結合基礎研究加以探討。本研究顯示,miR-513a-3p低表達組、RNF6高表達組胃癌患者平均生存時間、累積生存率低于miR-513a-3p高表達組、RNF6低表達組,提示miR-513a-3p、RNF6 mRNA可能均與胃癌預后密切相關,miR-513a-3p表達水平越低、RNF6 mRNA表達水平越高,胃癌患者預后越差,miR-513a-3p、RNF6 mRNA有望成為評估胃癌患者預后的指標。進一步分析顯示,RNF6 mRNA表達水平升高、TNM分期增加、伴有H.pylori感染、淋巴結發生轉移、miR-513a-3p表達水平降低均會增加胃癌患者發生不良預后的風險,檢測胃癌組織miR-513a-3p、RNF6 mRNA表達水平可能有助于及時診治胃癌、預測胃癌患者預后情況。

綜上,胃癌患者癌組織miR-513a-3p表達水平較低,RNF6 mRNA表達水平較高,miR-513a-3p、RNF6 mRNA可作為預測胃癌患者預后情況的輔助指標,二者為臨床診治胃癌提供參考。但本研究樣本較少,結果可能有一定偏倚,后期需擴大樣本,分析miR-513a-3p在胃癌中與RNF6 mRNA的相關性及有關機制,為臨床診療胃癌提供更有力的依據。

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