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結直腸癌組織中lncRNA TUSC7與miR-1270表達的相關性及臨床病理意義

2022-11-07 09:56:00任維聃劉桂偉冶浩鵬郭慶金耿學辰姜國勝
河北醫學 2022年10期
關鍵詞:數據庫水平研究

姜 輝,任維聃,劉桂偉,冶浩鵬,郭慶金,耿學辰,姜國勝

(1.河北省滄州市人民醫院肛腸外科,河北 滄州 061000 2.河北省滄州市中心醫院結直腸肛門外科,河北 滄州 061000)

結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是一種多發于40歲以上中老年人的癌癥,由于飲食及生活習慣的改變,其發生率逐年上升[1]。因此,尋找與CRC相關,且可評估CRC患者預后的標志物尤為關鍵。微小RNA(microRNA,miRNA)和長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)均是不能編碼蛋白的RNA分子,兩者均可能參與CRC發生發展[2,3]。近期報道顯示,lncRNA腫瘤抑制候選基因7(lncRNA tumor suppressor candidate 7,lncRNA TUSC7)在CRC中呈低表達,與CRC患者預后密切相關[4];微小RNA-1270(microRNA-1270,miR-1270)在胃癌中表達上調,高表達miR-1270與患者不良預后相關,miR-1270可能是診治胃癌的潛在靶標[5]。基于上述研究,本文檢測了miR-1270在CRC組織中的表達情況,分析其與lncRNA TUSC7、CRC預后關系,為臨床診治CRC提供新參考。

1 資料與方法

1.1一般資料:選取2018年6月至2019年1月本院診治的CRC患者130例進行研究,年齡42~70歲,平均年齡(58.07±10.66)歲,<60歲67例,≥60歲63例;低分化45例,中、高分化85例;男71例,女59例;浸潤深度:T1~T2 78例,T3~T4 52例;病理類型:浸潤型15例,隆起型26例,潰瘍型89例;淋巴結轉移48例,淋巴結未轉移82例;腫瘤直徑:< 5cm 61例,≥5cm 69例;TNM分期:Ⅲ~Ⅳ期54例,Ⅰ~Ⅱ期76例。本院倫理委員會批準本研究,受試者和家屬對此研究知情同意。CRC患者納入標準:①符合CRC診斷標準[6],經病理診斷為原發性CRC;②患者病例及檢查資料齊全;③入院前未行放化療、靶向治療等抗腫瘤治療;④除CRC外,不伴有其他原發性腫瘤。排除標準:①隨訪資料缺失、病理類型難以判定者;②合并嚴重臟器病變者。

1.2方 法

1.2.1lnCAR數據庫檢索:采用lnCAR數據庫(https://lncar.renlab.org/#1st-screen)檢索CRC和正常結直腸組織中lncRNA TUSC7表達情況。

1.2.2標本收集:收集130例CRC患者行根治性手術切除的CRC組織、癌旁組織(距腫瘤邊緣≥5 cm),生理鹽水清洗,立即放入液氮罐(凍存24h),移至-80℃冰箱。

1.2.3實時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法檢測lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平:取出-80℃冰箱儲存的CRC和癌旁組織,無菌條件下,研缽中研碎,添加Trizol Reagent(簡石生物技術有限公司,CT2001)以提取CRC和癌旁組織中的總RNA;使用MultiMACS(TM) cDNA Synthesis Kit(美國Miltenyi公司,130-094-410)將總RNA反轉錄成cDNA;最終,應用SYBR Green qPCR Master Mix(美國MCE公司,HY-K0501)、qRT-PCR儀(美國ABI公司,PRISM?7900HT)擴增cDNA,讀取各基因循環閾值(CT值)。擴增參數:98.4℃預變性8min;97.6℃變性15s,64.5℃退火10s,68.2℃延伸15s,40個循環。GAPDH、U6分別是lncRNA TUSC7、miR-1270的內參基因(引物序列見表1)。lncRNA TUSC7、miR-1270相對表達量以2-△△CT法計算。

表1 lncRNA TUSC7 GAPDH miR-1270 U6引物序列

1.2.4生物信息學網站預測lncRNA TUSC7與miR-1270的關系:使用生物信息學網站(http://starbase.sysu.edu.cn/)預測lncRNA TUSC7與miR-1270間的關系。

1.3隨訪:以電話、入戶等方式跟蹤隨訪CRC患者6~36個月,以CRC患者手術后次日作為隨訪起點,隨訪截至CRC患者死亡或2022年1月。

2 結 果

2.1lnCAR數據庫中CRC組織與正常結直腸組織lncRNA TUSC7表達水平比較:lnCAR數據庫分析顯示,CRC組織lncRNA TUSC7表達水平較正常結直腸組織降低(P<0.05)。見圖1。

圖1 lnCAR數據庫中CRC和正常結直腸組織中lncRNA TUSC7表達水平比較

2.2癌旁和CRC組織中lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平比較:CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平較癌旁組織降低(P<0.05),miR-1270表達水平較癌旁組織升高(P<0.05)。見表2。

表2 癌旁/CRC組織中lncRNA TUSC7 miR-1270表達水平比較

2.3CRC組織lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平與臨床病理特征的關系:以CRC組織lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平的中位數(0.39、2.67)為界值,以低于lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平中位數的CRC患者為lncRNA TUSC7低表達組(66例)、miR-1270低表達組(62例),以高于或等于lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平中位數的CRC患者為lncRNA TUSC7高表達組(64例)、miR-1270高表達組(68例)。結果顯示,CRC組織lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平與年齡、病理類型、性別、腫瘤直徑無關(P>0.05),與腫瘤淋巴結轉移、浸潤深度、分化程度、TNM分期相關(P<0.05)。見表3。

表3 CRC組織lncRNA TUSC7 miR-1270表達水平與臨床病理特征關系n(%)

2.4CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平與miR-1270的相關性:Pearson法分析顯示,CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平與miR-1270呈負相關(r=-0.578,P<0.05),見圖2;生物信息學分析顯示,lncRNA TUSC7與miR-1270存在靶向結合位點,見圖3。

2.5CRC組織lncRNA TUSC7、miR-1270表達水平與CRC患者預后的關系:跟蹤隨訪CRC患者6~36個月,死亡45例,生存85例。Kaplan-Meier生存曲線分析顯示,lncRNA TUSC7低表達組平均生存時間為27.77個月(95%CI:25.53~30.02),短于lncRNA TUSC7高表達組平均生存時間34.34個月(95%CI:23.10~35.59),log-rank檢驗結果顯示,lncRNA TUSC7低表達組、lncRNA TUSC7高表達組累積生存率比較,差異有統計學意義(χ2=30.459,P=0.000),見圖4;miR-1270低表達組平均生存時間為33.90個月(95%CI:32.54~35.27),長于miR-1270高表達組平均生存時間28.37個月(95%CI:26.15~30.58),log-rank檢驗結果顯示,miR-1270低表達組與miR-1270高表達組累積生存率相比,差異有統計學意義(χ2=18.172,P=0.000),見圖5。

圖2 CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平與miR-1270的相關性

圖3 生物信息學分析lncRNA TUSC7與miR-1270的靶向結合位點

圖4 CRC組織lncRNA TUSC7表達水平與CRC患者預后的關系

圖5 CRC組織miR-1270表達水平與CRC患者預后的關系

3 討 論

CRC患者可出現便血、大便性狀變化、腹痛等癥狀,臨床多以手術治療CRC為主,但治療效果不容樂觀,CRC患者預后較差[7]。因此,尋找與CRC有關的生物學靶點,對及時有針對性干預,提高CRC患者治愈率,降低病死率有積極意義。

lncRNA作為一類非編碼RNA,其雖不可編碼蛋白,但可調控信號轉導,影響CRC等癌癥細胞增殖、凋亡,參與機體免疫逃逸等過程[8]。研究發現,lncRNA TUSC7在食管鱗癌中表達下調,與淋巴結轉移相關,lncRNA TUSC7有望成為診治食管鱗癌的分子靶標[9];另外,Zhang等[10]研究發現,過表達lncRNA TUSC7可抑制CRC細胞增殖、上皮-間質轉化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),lncRNA TUSC7在CRC發展中起抑癌作用。本研究顯示,CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平較低,與lnCAR數據庫檢索結果及曹珊珊等[4]研究趨勢一致,提示lncRNA TUSC7可能與CRC病理發展相關。本文中CRC組織lncRNA TUSC7表達水平與腫瘤淋巴結轉移、浸潤深度、分化程度、TNM分期相關,提示lncRNA TUSC7可能與CRC嚴重程度有關,檢測CRC組織lncRNA TUSC7表達水平有助于臨床判斷CRC患者病情,對制定針對CRC患者的干預方案甚是有利。進一步研究發現,lncRNA TUSC7低表達組CRC患者平均生存時間、累積生存率短于、低于lncRNA TUSC7高表達組,提示lncRNA TUSC7可能與CRC患者預后密切相關,lncRNA TUSC7表達水平越低,CRC患者預后越差,lncRNA TUSC7可輔助臨床判定CRC患者預后情況。分析可能原因,lncRNA TUSC7可能通過與靶基因結合進而影響CRC細胞EMT、增殖、侵襲,從而影響CRC發展進程,顯示出其與CRC患者TNM分期等臨床特征、預后相關[10]。

miRNA是一類短鏈非編碼RNA,其可參與肝細胞癌、CRC等癌細胞異常增殖,調節信號轉導,介導自噬,影響肝細胞癌、CRC等疾病發生發展[11]。近期報道顯示,miR-1270在食管癌、肝細胞癌中表達上調,且miR-1270可能是診治食管癌、肝細胞癌的潛在靶標[12,13]。而miR-1270在甲狀腺乳頭狀癌、膀胱癌中呈高表達,miR-1270在甲狀腺乳頭狀癌、膀胱癌中發揮促癌作用[14,15]。以上研究表明,miR-1270在不同腫瘤中的作用不同。本文中CRC組織miR-1270表達水平較高,與其在胃癌中的趨勢相同,提示miR-1270可能參與CRC發生發展,miR-1270可能是診治CRC的分子靶點。進一步研究顯示,處于Ⅲ~Ⅳ期、T3~T4浸潤深度、低分化,發生淋巴結轉移的CRC患者中miR-1270高表達患者占比較高,表明miR-1270可能與CRC發展程度相關,miR-1270有望成為評估CRC嚴重程度的標志物。另外,本研究顯示,miR-1270低表達組CRC患者平均生存期、累積生存率長于高于miR-1270高表達組,表示CRC組織中miR-1270表達水平越高,CRC患者發生不良預后風險越大,miR-1270有望成為臨床評估CRC患者預后的潛在指標。推測,miR-1270可能通過促進CRC細胞增殖、EMT,抑制CRC細胞凋亡,進而在CRC發生發展中起促進作用,從而顯示出miR-1270與CRC患者TNM分期等臨床特征、預后關系緊密[5]。

此外,生物信息學分析顯示,lncRNA TUSC7與miR-1270存在靶向結合位點,故本文探討了CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平與miR-1270相關性,結果顯示,lncRNA TUSC7表達水平與miR-1270呈負相關,提示lncRNA TUSC7可能與miR-1270共同影響CRC病理變化,推測lncRNA TUSC7可能與miR-1270靶向結合,進而影響CRC細胞增殖、EMT等惡性生物學行為,從而協同影響CRC發展過程。

綜上,CRC組織中lncRNA TUSC7表達水平較低,miR-1270表達水平較高,二者呈負相關,且lncRNA TUSC7、miR-1270均與TNM分期、浸潤深度、淋巴結轉移、分化程度、預后等顯著相關,為臨床診治CRC、判定CRC患者預后提供新方向。但本研究樣本有限,后期將延長隨訪時間,擴大樣本,從多角度探究lncRNA TUSC7、miR-1270與CRC的關系,以增加實驗可靠性。

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