超算平臺(tái)在高校的建設(shè)及性能分析

何小波，楊慶濤

（重慶醫(yī)科大學(xué) 信息中心，重慶 400016）

0 引 言

高性能計(jì)算平臺(tái)對(duì)醫(yī)科院校的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)的研究和發(fā)展有著非常重要的作用。由于學(xué)校學(xué)科建設(shè)和科研能力不斷增強(qiáng)，對(duì)高性能運(yùn)算的需求也不斷提高。基于不斷增長(zhǎng)的科研需求，我校開(kāi)啟了校級(jí)高性能計(jì)算平臺(tái)的建設(shè)，面向全校科研團(tuán)隊(duì)和人員提供高性能計(jì)算服務(wù)，滿足各學(xué)科領(lǐng)域?qū)τ诖笠?guī)模數(shù)據(jù)處理和大規(guī)模科學(xué)計(jì)算的需求。通過(guò)公共服務(wù)平臺(tái)的建設(shè)，也將有助于學(xué)校生信領(lǐng)域的科學(xué)研究和發(fā)展，有利于校內(nèi)軟硬件資源的整合和高效使用，可有效降低科研成本。

1 超算建設(shè)的現(xiàn)狀分析

高性能平臺(tái)的使用將有力地支撐學(xué)校科研活動(dòng)的開(kāi)展，但是由于專業(yè)性比較強(qiáng)，真正能完全掌握超算平臺(tái)的使用和管理人員相對(duì)較少。目前，在高校中普遍是院系級(jí)的科研人員在進(jìn)行建設(shè)和使用，覆蓋的科研領(lǐng)域、范圍及使用的人員都比較有限。在前期的工作中，我校也建設(shè)有院系級(jí)的超算平臺(tái)，然而使用效果并不理想。但通過(guò)對(duì)院系級(jí)高性能平臺(tái)的使用，我們?nèi)〉昧艘欢ǖ氖斋@：首先是在管理上已經(jīng)了解并掌握了平臺(tái)的運(yùn)行機(jī)制，為后續(xù)校級(jí)平臺(tái)的建設(shè)和管理工作奠定了基礎(chǔ)；同時(shí)在高性能平臺(tái)的使用中，通過(guò)對(duì)平臺(tái)系統(tǒng)和調(diào)度軟件的學(xué)習(xí)，以及在使用過(guò)程中不同學(xué)科方向的學(xué)者互相學(xué)習(xí)，積累了一定的超算平臺(tái)使用經(jīng)驗(yàn)。其次，通過(guò)不斷的溝通和交流，很多專業(yè)人員和學(xué)生對(duì)超算平臺(tái)能夠提供和產(chǎn)生的價(jià)值有了非常清晰的認(rèn)識(shí)，為后續(xù)校級(jí)平臺(tái)的建設(shè)提供了基礎(chǔ)和動(dòng)力。……