李建軍,吳素方,白豐璽
肺結核(pulmonary tuberculosis,PTB)是一種由結核分枝桿菌(mycobacterium tuberculosis,Mtb)感染引起的慢性呼吸系統傳染?。?-2]。肺泡巨噬細胞(alveolar macrophage,AM)是肺內主要的免疫細胞,可對Mtb進行免疫調節和免疫清除[3-4]。AM與肺結構細胞存在密切聯系,特別是Ⅱ型肺泡上皮細胞(type Ⅱalveolar epithelial cell,AECⅡ)能夠以接觸依賴性或非接觸依賴性方式調節肺中AM的免疫反應[5];AECⅡ和AM之間的相互作用可調節和(或)塑造AM 的 表 型,以 應 對 損 傷[6]。另 外,外 泌 體(exosomes,Exos)在細胞間信號的傳遞中起著關鍵作用。近年來,Exos 中的微小RNA(microRNA,miRNA 或miR)成為研究熱點[7]。研究顯示,用脂多糖處理AEC 可上調AEC 來源Exos 中miR-92a-3p的表達,進而通過將炎癥信號傳遞給活化的AM 來引發肺內炎癥反應[8]。Exos介導的miRNA遞送是一種治療肺部炎癥反應的新方法[9]。本研究使用miRNA 測序對正常AECⅡ來源的Exos(AEC-Exos)和Mtb 感染AECⅡ來源的Exos(Mtb-AEC-Exos)中差異表達的miRNAs 進行鑒定,并篩選出與炎癥反應有關的miR-145,進一步評估了miR-145 在Mtb-AEC-Exos中的表達及其對AM極化的影響。
1.1 主要試劑與儀器 Mtb 毒株H37Rv 購自中國獸藥檢驗所;FITC標記的抗CD86抗體和PE標記的抗CD163抗體均購自美國Becton Dickinson 公司;綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表達質粒購自南京雙領生物科技有限公司;CD63、CD81和熱休克蛋白70(HSP70)抗體均購自英國Abcam 公司;EdU 細胞增殖檢測試劑盒、DiO(細胞膜綠色熒光探針)、BCA 蛋白濃度測定試劑盒、RIPA 裂解液購自碧云天生物科技公司;TRITC標記鬼筆環肽(粉末)購自北京百奧萊博科技有限公司;miRNA cDNA 合成試劑盒購自美國Thermo 公司;TRIzol 試劑、逆轉錄試劑盒、SYBR Green PCR Master Mix 和miRNA 熒光定量檢測試劑盒均購自日本TaKaRa 公司;白細胞介素(interleukin,IL)-6、IL-10、腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)酶聯免疫吸附試驗(ELISA)試劑盒購自上海酶聯生物科技有限公司。Leica confocal 118 SP5共聚焦顯微鏡(德國Leica 公司);Hitachi H-600 透射電子顯微鏡(日本Hitachi 公司);ZetaView 納米顆粒跟蹤分析儀(德國Particle Metrix公司);Coulter Optima TM L-80XP 超速離心機、Cytomics FC500 流式細胞儀(美國貝克曼庫爾特有限公司);ABI Prism?7500型熒光定量PCR儀(美國應用生物系統公司);iMark680 多功能酶標儀(美國Bio-Rad公司)。大鼠肺泡巨噬細胞NR8383(CL-0172)和大鼠Ⅱ型肺泡上皮細胞RLE-6TN(CP-R003)購自武漢普諾賽生命科技有限公司。
1.2 實驗1 Mtb-AEC-Exos的鑒定
1.2.1 細胞培養 NR8383培養于含有15%胎牛血清的Ham's F-12K培養基中,RLE-6TN在含有10%胎牛血清、100 IU/mL青霉素和100 mg/L 鏈霉素的DMEM 培養基中,于5%CO2、37 ℃的培養箱中培養。隔天換液,當細胞密度融合至80%左右時進行傳代。
1.2.2 Mtb毒株H37Rv培養 所有與Mtb H37Rv菌株相關的實驗均在生物安全三級(BSLⅢ)實驗室進行。Mtb H37Rv細菌在含有10%Middlebrook ADC 增菌液和0.05%Tween 80 的Middlebrook 7H9培養基中于37 ℃下培養。在對數生長期收取細菌,并以1×108個桿菌/mL 的濃度在DMEM/F-12 培養基中沉淀并重懸。然后將其等分成6 份,并儲存在-80 ℃作為工作原液備用。
1.2.3 Mtb感染AECⅡ 為了可視化Mtb感染,將AECⅡ接種在蓋玻片上,并以1∶50感染復數(multiplicity of infection,MOI)感染GFP標記的Mtb(Mtb-GFP),命名為Mtb-AECⅡ組,另設AECⅡ組(正常培養不進行感染),并在37 ℃5%CO2培養箱中培養。72 h 后,用磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌AECⅡ3 次并用4%多聚甲醛固定20 min,再次用PBS 洗滌AECⅡ3次,用4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)染色,在共聚焦顯微鏡下觀察。此外,在感染72 h后,使用EdU 細胞增殖檢測試劑盒在Mtb 感染的AECⅡ中檢測細胞增殖水平[10],使用共聚焦顯微鏡拍攝圖像。
1.2.4 Mtb-AEC-Exos 的分離與鑒定 AEC Ⅱ于無血清DMEM 中在Mtb 存在的情況下培養72 h后,收集來自AECⅡ的細胞培養基,并在4 ℃下以300×g離心10 min、2 000×g離心20 min(棄沉淀,除去細胞)和10 000×g離心30 min(棄沉淀,除去亞細胞成分);收集上清液用0.22μm 規格過濾器過濾,在超速離心機中4 ℃100 000×g離心70 min,沉淀Exos;Exos顆粒用無菌PBS洗滌,繼續在4 ℃,100 000×g離心70 min;沉淀的Exos在無菌PBS中重懸,并儲存在-80 ℃冰箱中,命名為Mtb-AECⅡ組。從正常AECⅡ培養上清液中提取的Exos(AEC-Exo)用作對照,命名為AECⅡ組。隨后使用透射電子顯微鏡(TEM)和納米粒子追蹤分析(NTA)觀察Exos形態,檢測Exos 的數量和大??;并使用流式細胞術鑒定Exos 表面特征標志物CD63、CD81和HSP70,3個指標同時有表達即表示Exos的存在;使用RIPA裂解液分離Exos中的蛋白質,并使用BCA蛋白質測定試劑盒檢測Exos的蛋白質含量。
1.2.5 Exos的miRNA微陣列檢測 miRNA微陣列研究Mtb-AEC-Exos 和AEC-Exo 之間差異表達的miRNA。使用miRNeasy Mini Kit 提取和純化總RNA。Exos miRNA 微陣列雜交、數據生成和歸一化由上海生工生物工程技術服務有限公司完成。為了全面分析微陣列數據,篩選出兩者中基因變化倍數≥2 的miRNA。在miRNA 微陣列檢測后,使用miRNA cDNA 合成試劑盒合成cDNA 樣本并采用miRNA 熒光定量PCR(qPCR)檢測試劑盒進行檢測,使用2-ΔΔCt方法計算歸一化為U6后miRNA的相對表達量。
1.2.6 Mtb-AEC-Exos 在巨噬細胞中的作用 為了評估Mtb-AEC-Exos 對AM 活化的影響,用親脂性染料DiO 標記Exos,用TRITC-鬼筆環肽標記AM 的細胞骨架。AM(1×105個)接種在蓋玻片上,分為AECⅡ組和Mtb-AECⅡ組,分別與標記的Exos(AEC-Exos、Mtb-AEC-Exos)共培養24 h后,將用Exos 處理的巨噬細胞在4%多聚甲醛中固定,用0.1%Triton X-100滲透,用3%胎牛血清白蛋白封閉。然后,取200μL現配的TRITC-鬼筆環肽染色工作液,完全覆蓋蓋玻片上的細胞,室溫避光孵育30 min。用DAPI 對細胞核進行染色??篃晒獯銣鐒┓馄?,在共聚焦顯微鏡下觀察。ELISA檢測細胞培養上清液中TNF-α、IL-6和IL-10的水平。
1.3 實驗2 Mtb-AEC-Exos對AM極化的影響及分子機制
1.3.1 細胞轉染 由上海GenePharma 公司合成miR-145 模擬物(mimic)、miR-145 沉默序列(inhibitor)及其相應的陰性對照(mimic-NC和inhibitor-NC)慢病毒載體。為了獲得過表達或沉默miR-145的Exos,用過表達或沉默miR-145的慢病毒以20 MOI 轉染AECⅡ。實驗分為:對照組、mimic-NC 組、miR-145 mimic 組、inhibitor-NC 組、miR-145 inhibitor 組。然后,參照1.2.3 和1.2.4 步驟用Mtb 感染AECⅡ并分離Exos,qPCR 檢測轉染的Mtb-AECⅡExos 中miR-145mRNA 水平。最后,將NR8383細胞分別與上述各組中的Exos(含終濃度為80 mg/L Exos的培養基)共同孵育24 h,以誘導M1或M2巨噬細胞極化。
1.3.2 流式細胞術檢測巨噬細胞M1型標志物(CD86)、M2型標志物(CD163)表達 采用流式細胞術分析CD163 和CD86陽性巨噬細胞的百分比。NR8383細胞重懸于PBS中并調整濃度為1×106個/mL,加入5 μL FITC-CD86 抗體或5 μL PECD163 抗體,在室溫下孵育30 min。使用流式細胞儀分析CD86和CD163巨噬細胞的百分比。
1.3.3 qPCR 檢測巨噬細胞中miR-145、TNF-α、誘導型一氧化氮合酶(iNOS)、精氨酸酶1(Arg-1)和IL-10的mRNA 水平 使用TRIzol試劑從細胞中分離總RNA,使用逆轉錄試劑盒將RNA 逆轉錄為cDNA。在Prism?7500 熒光定量PCR 儀上使用SYBR Green PCR Master Mix 進行qPCR。反應條件:95 ℃30 s;95 ℃5 s,60 ℃30 s,40 個循環。U6用作miR-145的內參,mRNA水平用β-肌動蛋白(β-actin)的mRNA水平進行標準化,并表示為倍數變化。引物序列見表1。基因的相對表達水平用2-ΔΔCt法表示。

Tab.1 The primer sequence of qPCR表1 qPCR的引物序列
1.4 統計學方法 采用GraphPad Prism 8.0軟件進行數據分析。符合正態分布計量數據以±s表示。2 組間比較采用獨立樣本t檢驗,多組間比較采用單因素方差分析,組間多重比較用SNK-q檢驗。P<0.05為差異有統計學意義。
2.1 實驗1
2.1.1 Mtb感染AECⅡ與Exos的鑒定 共聚焦顯微鏡成像結果顯示,Mtb 被AECⅡ吸收,見圖1。EdU檢測結果顯示,與正常培養的AECⅡ相比,Mtb感染不影響AECⅡ的增殖(P>0.05),見表2,圖2。Exos分離后,TEM 和NTA 分析結果顯示,Mtb-AEC 組和AECⅡ組均分泌直徑約為100 nm 的球形囊泡,見圖3;Mtb-AECⅡ組Exos 的數量高于AECⅡ組(P<0.01),見表2。流式細胞術結果顯示,Exos中CD63、CD81、HSP70 均呈陽性表達,見圖4。此外,與AECⅡ組相比,Mtb-AECⅡ組Exos 中蛋白質含量增加(P<0.01),見表2。

Fig.1 Image showing that Mtb was absorbed by AECⅡ圖1 Mtb被AECⅡ吸收
Tab.2 Comparison of AECⅡproliferation activity,Exos quantity and protein content between the two groups表2 2組間AECⅡ增殖活性、Exos數量和蛋白質含量的比較 (n=3,±s)

Tab.2 Comparison of AECⅡproliferation activity,Exos quantity and protein content between the two groups表2 2組間AECⅡ增殖活性、Exos數量和蛋白質含量的比較 (n=3,±s)
**P<0.01。
組別AECⅡ組Mtb-AECⅡ組t Edu陽性細胞(%)42.36±5.27 45.29±5.67 0.656 Exos數量(×105/cell)1.39±0.20 2.28±0.25 4.815**Exos蛋白質含量(mg/L)0.35±0.05 0.71±0.08 6.609**

Fig.2 The effect of Mtb infection on the proliferation of AECⅡ圖2 Mtb感染對AECⅡ增殖的影響

Fig.3 Morphology and particle size distribution of Mtb-infected AECⅡ-derived Exos圖3 Mtb感染的AECⅡ來源Exos的形態和粒徑分布

Fig.4 Flow cytometry showing positive expression of Exos surface markers CD63,CD81 and HSP70圖4 流式細胞術檢測示Exos表面標志物CD63、CD81、HSP70陽性表達
2.1.2 Exos 的miRNA 微陣列檢測 總共評估了3 604 個Exos miRNA(圖5A),并鑒定了一組差異表達的miRNA(倍數變化>2)。前5 個差異表達的Exos miRNA 分 別 為miR-574-5p、miR-145、miR-6124、miR-6165、miR-6760-5p(圖5B),通過qPCR驗證了4個上調miRNA的表達水平,結果顯示miR-145的表達水平增加最多,見圖5C。
2.1.3 Mtb-AEC-Exos 促進AM 活化 共聚焦顯微鏡結果顯示,AECⅡ組和Mtb-AECⅡ組中均可見綠色DiO 標記的Exos 被巨噬細胞內化,見圖6。與AECⅡ組相比,Mtb-AECⅡ組巨噬細胞培養上清液中IL-10 水平增加,TNF-α 和IL-6 的水平降低(均P<0.01),見表3。
2.2 實驗2
2.2.1 轉染后各組Mtb-AECⅡExos 中miR-145水平比較 與對照組相比,mimic-NC 組和inhibitor-NC 組Mtb-AECⅡExos 中miR-145水平差異無統計學意義(P>0.05),miR-145 mimic 組miR-145水平升高,miR-145 inhibitor 組miR-145水平降低(P<0.05),見表4。
2.2.2 各組CD86 和CD163 陽性巨噬細胞百分比的比較 與對照組相比,mimic-NC 組和inhibitor-NC組的CD86 陽性和CD163 陽性巨噬細胞百分比差異無統計學意義(P>0.05),miR-145 mimic組CD86陽性巨噬細胞百分比降低,CD163 陽性巨噬細胞百分比升高(P<0.05),miR-145 inhibitor組CD86陽性巨噬細胞百分比升高,CD163 陽性巨噬細胞百分比降低(P<0.05),見表4、圖7。
2.2.3 各組巨噬細胞中miR-145、TNF-α、iNOS、Arg-1和IL-10的mRNA 水平比較 與對照組相比,mimic-NC 組 和inhibitor-NC 組miR-145、TNF-α、iNOS、Arg-1和IL-10的mRNA 水平差異無統計學意義(P>0.05),miR-145 mimic組TNF-α、iNOSmRNA表達水平降低,miR-145、Arg-1和IL-10mRNA表達水平升高(P<0.05),miR-145 inhibitor 組TNF-α、iNOSmRNA 表達水平升高,miR-145、Arg-1和IL-10mRNA表達水平降低(P<0.05),見表5。

Fig.5 Exos miRNA microarray detection圖5 Exos的miRNA微陣列檢測

Fig.6 Images showing that Mtb-AEC-Exos were internalized by macrophages圖6 Mtb-AEC-Exos被巨噬細胞內化
Tab.3 Comparison of TNF-α,IL-6 and IL-10 levels in macrophages between the two groups表3 2組巨噬細胞培養上清液中TNF-α、IL-6和IL-10水平的比較 (n=3,ng/L,±s)

Tab.3 Comparison of TNF-α,IL-6 and IL-10 levels in macrophages between the two groups表3 2組巨噬細胞培養上清液中TNF-α、IL-6和IL-10水平的比較 (n=3,ng/L,±s)
**P<0.01。
組別AECⅡ組Mtb-AECⅡ組t TNF-α 27.40±3.39 15.56±2.61 4.793**IL-6 50.62±6.45 29.14±3.38 5.109**IL-10 46.81±6.23 115.20±11.04 9.344**
Tab.4 Comparison of miR-145 levels and the percentages of CD86-positive and CD163-positive macrophages between the five groups表4 各組miR-145 水平與CD86陽性和CD163陽性巨噬細胞百分比比較 (n=3,±s)

Tab.4 Comparison of miR-145 levels and the percentages of CD86-positive and CD163-positive macrophages between the five groups表4 各組miR-145 水平與CD86陽性和CD163陽性巨噬細胞百分比比較 (n=3,±s)
**P<0.01;a與對照組比較,b與mimic-NC組比較,c與inhibitor-NC組比較,P<0.05。
組別對照組mimic-NC組miR-145 mimic組inhibitor-NC組miR-145 inhibitor組F miR-145 1.00±0.00 1.02±0.11 3.48±0.42ab 1.03±0.10 0.35±0.06ac 108.869**CD86陽性(%)40.70±5.58 41.26±5.23 22.14±3.56ab 40.95±5.18 62.43±7.02ac 21.045**CD163陽性(%)55.62±7.39 57.34±8.12 80.61±9.75ab 56.59±7.26 32.28±5.03ac 14.935**
Tab.5 Comparison of mRNA levels of miR-145,TNF-α,iNOS,Arg-1 and IL-10 between the five groups of macrophages表5 各組巨噬細胞中miR-145、TNF-α、iNOS、Arg-1和IL-10的mRNA水平比較 (n=3,±s)

Tab.5 Comparison of mRNA levels of miR-145,TNF-α,iNOS,Arg-1 and IL-10 between the five groups of macrophages表5 各組巨噬細胞中miR-145、TNF-α、iNOS、Arg-1和IL-10的mRNA水平比較 (n=3,±s)
**P<0.01;a與對照組比較,b與mimic-NC組比較,c與inhibitor-NC組比較,P<0.05。
組別對照組mimic-NC組miR-145 mimic組inhibitor-NC組miR-145 inhibitor組F iNOS 1.00±0.00 1.01±0.13 0.62±0.08ab 1.03±0.10 2.28±0.24ac 66.299**Arg-1 1.00±0.00 1.01±0.10 2.87±0.31ab 1.03±0.12 0.51±0.08ac 98.544**IL-10 1.00±0.00 1.02±0.15 3.25±0.27ab 1.01±0.11 0.46±0.07ac 158.444**組別對照組mimic-NC組miR-145 mimic組inhibitor-NC組miR-145 inhibitor組F miR-145 1.00±0.00 1.01±0.14 2.60±0.25ab 1.04±0.13 0.52±0.10ac 86.639**TNF-α 1.00±0.00 1.03±0.12 0.54±0.09ab 1.02±0.11 3.15±0.20ac 212.628**

Fig.7 CD86 and CD163 positive expression of macrophages in each group(flow cytometry)圖7 各組巨噬細胞CD86陽性和CD163陽性表達(流式細胞術)
Mtb 感染可激活宿主的免疫防御,涉及先天免疫細胞,導致IL-1β 和TNF-α 等各種炎性細胞因子的分泌增加[11]。巨噬細胞是抵抗Mtb感染的第一道屏障,了解Mtb-巨噬細胞相互作用的潛在機制可能為結核病治療提供新的策略。除了AM,AEC最近也被認為是Mtb 感染的主要目標,其不僅具有上皮屏障功能,還可作為非專業性免疫細胞在感染反應中發揮免疫調節作用[12]。AEC可通過對感染的直接反應或調節專業免疫細胞(如AM)免疫反應的間接作用,在宿主對Mtb 感染的保護反應中發揮重要作用[13-14]。另有研究認為,AM極化參與結核病的發病過程[15-16]。AM 極化具有M1 和M2 兩個階段:M1 型的特征是炎癥反應激活,包括但不限于TNF-α類的促炎細胞因子的表達水平升高;M2型的特點是通過增加抗炎細胞因子(如IL-10)的表達來發揮抗炎作用。研究已證實,在外部刺激(包括Mtb)下,AEC可通過分泌細胞因子和介質,調節AM表型或活化[17]。目前,有關源自AEC 的Exos 對AM 極化的影響研究少見。本研究結果顯示,與AECⅡ組相比,Mtb感染AECⅡ促進了Exos 的產生,但對AECⅡ的增殖水平沒有影響;Mtb-AECⅡ被巨噬細胞吸收后可通過增加IL-10 水平,減少TNF-α 和IL-6 的產生來誘導AM 的抗炎反應;表明Mtb 刺激AEC 來源的Exos 可誘導AM 向M2 極化,但其對AM 極化的調控機制尚不清楚。
Exos 可攜帶lncRNA、miRNA、mRNA 和其他分子,是不同細胞之間的重要信使,在包括結核病在內的許多疾病的發展中發揮關鍵作用。研究顯示,感染Mtb 會導致Exos 中部分miRNA 表達水平發生顯著 變 化[18-19]。然而,目前有關Mtb-AEC-Exos 和Mtb-AEC-Exos miRNA 在AM 極化中的作用尚不明確。研究顯示,在結核病患者血清和Mtb 感染后人類巨噬細胞中miR-145 表達水平下調,且其表達水平與炎性細胞因子表達水平呈負相關;Mtb 感染后巨噬細胞中miR-145的過表達可抑制感染誘導的炎癥反應[20-21]。本研究結果亦顯示,Mtb感染AECⅡ來源的Exos 中,其miR-145的表達水平與正常AECⅡ來源的Exos 相比存在差異,表明Mtb-AEC-Exos 的作用可能是通過miR-145 介導的,提示Mtb-AECExos對AM極化的影響可能與miR-145有關。
為了進一步闡述miR-145 在AM 響應Mtb 感染中的作用,本研究采用慢病毒載體轉染AECⅡ以上調或抑制Exos 中miR-145 表達。CD86 和CD163 分別是M1 巨噬細胞和M2 巨噬細胞的標志物,TNF-α和iNOS是M1極化巨噬細胞的代表性指標,Arg-1和IL-10 是M2 極化巨噬細胞的代表性指標。結果顯示,上調miR-145 后,Mtb-AECⅡExos 和巨噬細胞中miR-145水平均升高,同時CD163陽性細胞、Arg-1和IL-10的mRNA 表達升高,CD86陽性細胞、iNOS和TNF-α的mRNA 表達降低,而下調miR-145 表現出相反的作用,表明Mtb-AECⅡExos中miR-145的高表達促進了M2 巨噬細胞極化,限制了M1 巨噬細胞極化,提示Mtb 刺激AECⅡ衍生的Exos 可能通過miR-145 促進巨噬細胞M2 極化并抑制M1 極化而實現。
綜上所述,Mtb 感染AECⅡ來源Exos 可能通過miR-145刺激巨噬細胞向M2型極化,對抗炎癥。本研究表明Mtb感染AECⅡ來源Exos中的miR-145介導了AEC 和巨噬細胞之間的作用,但具體的調控機制仍有待進一步明確。