LncRNA XLOC_015132對(duì)山羊黑色素沉積的影響及其lncRNA-miRNA-mRNA軸的預(yù)測(cè)

付 琳 劉 麗 楊 恒 王高富 任航行 周 鵬董賢文 張 麗,*

(1 重慶市畜牧科學(xué)院/重慶市山羊工程技術(shù)研究中心，重慶 402460；2 重慶化工職業(yè)學(xué)院，重慶 401228; 3西南大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院，重慶 402460)

長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是大于200 nt的一種非編碼RNA。根據(jù)lncRNA與其靶基因在染色體上的位置關(guān)系，可以將lncRNA分為5個(gè)亞類(lèi)：正義、反義、雙向、基因間和內(nèi)含子lncRNA[1]。研究顯示，lncRNA可以通過(guò)轉(zhuǎn)錄、后轉(zhuǎn)錄和翻譯水平在多種癌癥[2]、炎癥[3]、纖維化[4]、血管生成[5]的發(fā)展和進(jìn)程中發(fā)揮正向或反向的調(diào)控作用。黑色素瘤是一種常見(jiàn)的皮膚惡性腫瘤，目前對(duì)黑色素相關(guān)lncRNA功能的研究，大多來(lái)源于黑色素瘤及其細(xì)胞系，在惡性黑色素瘤中，lncRNA可通過(guò)多種機(jī)制發(fā)揮作用，其可能通過(guò)調(diào)控相關(guān)信號(hào)分子誘導(dǎo)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、激活或抑制關(guān)鍵蛋白活性改變細(xì)胞外基質(zhì)性能、或激活PI3K/AKT、Wnt/β-catenin、MAPK等信號(hào)通路活性，促進(jìn)黑色素瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移[6]。

LncRNAXLOC_015132是與色素調(diào)控密切相關(guān)的重要lncRNAs，其在不同膚色山羊皮膚組織間存在顯著差異表達(dá)，與其同時(shí)被鑒定到的還有呈現(xiàn)高度組織特異性和功能特異性的LncRNAXLOC_15448、HOTAIR等[7]。研究發(fā)現(xiàn)，LncRNAXLOC_15448可能通過(guò)XLOC_15448/miR-182-5p/MITF軸參與酉州烏羊皮膚黑色素細(xì)胞的生長(zhǎng)及黑色素的沉積[8]，HOTAIR可能通過(guò)與HOXD10互作調(diào)控山羊皮膚黑色素細(xì)胞的分化與黑色素生成[9]。LncRNA可通過(guò)互作分子調(diào)控黑色素的沉積。Wei等[10]對(duì)黑色素瘤和皮膚痣的對(duì)比發(fā)現(xiàn)，UCA1能夠負(fù)調(diào)控抑癌基因miR-507，miR-507基因同時(shí)抑制叉頭盒M1(forkhead-boxM1，F(xiàn)OXM1)基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)，推斷UCA1通過(guò)miR-507-FOXM1軸促進(jìn)惡性黑色素瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。Ding等[11]研究發(fā)現(xiàn)，NEAT1海綿化miR-23a-3p能夠調(diào)節(jié)靶蛋白Krueppel樣因子3(krueppel-like factor 3，LF3)的表達(dá)；……