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改進(jìn)Unet++在腦腫瘤圖像分割的研究

2022-06-23 11:00:26侯奕辰謝俊章曾慶喜
關(guān)鍵詞:特征區(qū)域

侯奕辰,彭 輝,謝俊章,曾慶喜

(成都信息工程大學(xué) 軟件工程學(xué)院,四川 成都 610200)

0 引 言

腫瘤治療主要包括前期對(duì)腫瘤的體積位置進(jìn)行測(cè)量,中后期分割正常和病變組織[1,2]。MRI(magnetic resonance imaging)核磁共振成像是一種放射成像領(lǐng)域常用的技術(shù),由于MRI圖像多模態(tài),復(fù)雜的特點(diǎn),醫(yī)生很難精確地手動(dòng)分割,如何高效、精確且自動(dòng)地對(duì)MRI腦腫瘤圖像進(jìn)行分割成為了研究熱點(diǎn)[3]。

腦腫瘤分割有基于閾值、區(qū)域、像素分類等傳統(tǒng)分割算法[4]和基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的分割算法等。相比傳統(tǒng)分割算法,卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是目前用于分割的主流算法。目前在醫(yī)學(xué)圖像上表現(xiàn)更佳的是由Long等[5]提出的全卷積網(wǎng)絡(luò)改進(jìn)而來(lái)的Unet系列的網(wǎng)絡(luò)[6]。在Unet的基礎(chǔ)上,?zgün等[7]提出了3DUnet,F(xiàn)austo等[8]提出了3DVnet,是目前主流的3D網(wǎng)絡(luò)框架,3D網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)與2D網(wǎng)絡(luò)基本一致,主要是將卷積、池化等2D方法換成了3D,優(yōu)勢(shì)是能將3D圖像整張輸入網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練,能提取到更多空間信息,缺點(diǎn)是模型參數(shù)量增大,需要有更強(qiáng)的計(jì)算能力和顯存資源。Zhou等[9]在Unet基礎(chǔ)上提出了Unet++網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)加入了深度監(jiān)督,將跳躍連接改進(jìn)為密集的短連接,可以抓取不同層次的特征,并將它們通過(guò)疊加的方式進(jìn)行整合,但相比3D網(wǎng)絡(luò)在分割精度上還是有些許劣勢(shì)。

針對(duì)上述問(wèn)題,本文保留了Unet++網(wǎng)絡(luò)原大體結(jié)構(gòu),為了提高分割精度,提升網(wǎng)絡(luò)性能,在該網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)的主要內(nèi)容如下:將殘差塊和數(shù)據(jù)相關(guān)性Dupsampling上采樣方法分別融入U(xiǎn)net++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中的編碼和解碼階段,改進(jìn)了激活函數(shù),提高了網(wǎng)絡(luò)特征提取的能力,明顯提高了分割精度。針對(duì)MRI腦腫瘤圖像存在不均衡的特點(diǎn),在網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練階段引入了交叉熵和Dice結(jié)合的混合損失函數(shù),進(jìn)一步提高了分割精度。

1 本文方法

1.1 改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)

本文提出的網(wǎng)絡(luò)在Unet++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn),保留了原始網(wǎng)絡(luò)的大概結(jié)構(gòu),包括保留了4次下采樣和4次上采樣以及最大通道數(shù)1024;保留了密集的短連接,將圖像的低級(jí)語(yǔ)義和高級(jí)語(yǔ)義更好地融合,減少信息損失;保留了深度監(jiān)督模塊,對(duì)Encoder編碼部分的每一層提取的特征圖進(jìn)行上采樣,在網(wǎng)絡(luò)最上層通過(guò)1×1卷積降維后進(jìn)行輸出,相當(dāng)于對(duì)網(wǎng)絡(luò)編碼部分的每一個(gè)分支進(jìn)行監(jiān)督,輸出效果最好的特征圖。

改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1所示:在編碼階段的每一層中如X(0,0)到X(4,0), 用殘差塊即Mish(2×(Conv3×3+BN+Mish)+(Conv1×1+BN)) 代替原始網(wǎng)絡(luò)的兩次3×3卷積+BN(batch normalization)批量標(biāo)準(zhǔn)化和激活操作,層與層之間使用Maxpooling最大池化方式進(jìn)行下采樣;在解碼階段如X(i,1-4), 使用數(shù)據(jù)相關(guān)型Dupsampling上采樣方式代替原始網(wǎng)絡(luò)的雙線性插值上采樣方式;在網(wǎng)絡(luò)的編碼和解碼階段,用Mish激活函數(shù)代替Relu激活函數(shù)。編碼部分和解碼部分通過(guò)Skip-connection跳躍連接將不同層的語(yǔ)義特征進(jìn)行融合;在網(wǎng)絡(luò)最上層使用4個(gè)Conv1×1分支將每一層上采樣的結(jié)果降維后進(jìn)行輸出。

圖1 改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)

1.2 殘差塊

Unet++網(wǎng)絡(luò)的編碼部分是通過(guò)使用多個(gè)卷積操作來(lái)提取特征,當(dāng)網(wǎng)絡(luò)層數(shù)加深時(shí),網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練會(huì)變得困難,且特征提取能力不足。為了提取圖像更多的語(yǔ)義信息,提高特征提取的能力以及防止梯度消失,本文結(jié)合殘差網(wǎng)絡(luò)的思想,在網(wǎng)絡(luò)編碼部分的特征提取階段使用殘差塊(resi-dual block)[10]代替原始網(wǎng)絡(luò)的兩次卷積加上BN標(biāo)準(zhǔn)化以及激活操作的結(jié)構(gòu)。一個(gè)殘差塊有F(x)和x兩條路徑,F(xiàn)(x)路徑擬合殘差,x路徑為identity mapping恒等映射。針對(duì)Unet++網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu),本文使用的改進(jìn)殘差塊如圖2所示,相比原始Unet++編碼部分的卷積塊,該殘差塊多了一個(gè)1×1卷積加上BN標(biāo)準(zhǔn)化的分支,相當(dāng)于殘差塊的x恒等映射,該分支由于保留了淺層網(wǎng)絡(luò)的特征,可以使網(wǎng)絡(luò)隨著深度增加而不出現(xiàn)退化的問(wèn)題。另一分支是由兩組3×3卷積+BN標(biāo)準(zhǔn)化+Mish激活函數(shù)組成,最后將個(gè)兩分支進(jìn)行連接,經(jīng)Mish函數(shù)激活后進(jìn)入下一個(gè)殘差塊作為輸入。

圖2 殘差塊(residual block)

1.3 上采樣

Unet++網(wǎng)絡(luò)同Unet網(wǎng)絡(luò)一樣也是基于Encoder-Decoder編碼解碼模型的框架,其主要流程是通過(guò)卷積操作對(duì)圖像進(jìn)行特征學(xué)習(xí),由于卷積操作提取的特征圖相比原圖像會(huì)縮小,一般是原圖像的1/16或者1/32,所以在Decoder解碼端需要通過(guò)上采樣將圖像恢復(fù)至原始圖像大小才能作為最終的預(yù)測(cè)圖像。之前最常使用的上采樣方法是雙線性插值上采樣方法,該方法雖然能滿足恢復(fù)圖像大小以及大部分特征信息的要求,但是這種過(guò)于簡(jiǎn)單且數(shù)據(jù)無(wú)關(guān)性的雙線性插值上采樣方法仍然不是最好的選擇。

為此,本文采用一種由Tian等[11]提出的基于數(shù)據(jù)相關(guān)性的新型上采樣方法名為Dupsampling,該方法同雙線性插值方法一樣,都能在Decoder解碼端將圖像像素翻倍,直至恢復(fù)原始圖像大小,但由于該方法強(qiáng)數(shù)據(jù)依賴性的特點(diǎn),即能通過(guò)像素與像素之間的相關(guān)性在解碼時(shí)恢復(fù)更多的圖像特征信息,從而產(chǎn)生更高質(zhì)量的分割結(jié)果。

Dupsampling上采樣結(jié)構(gòu)如圖3所示,F(xiàn)為經(jīng)過(guò)Encoder編碼端提取特征后低分辨率的特征圖,F(xiàn)中左上角第一個(gè)維度為1×C的塊可以看作特征圖中的一個(gè)像素,C為F的通道數(shù)。W是一個(gè)待訓(xùn)練矩陣,維度為C×N。將特征圖中的每個(gè)像素x分別與矩陣W進(jìn)行矩陣相乘,得到維度為1×N的向量v作為一個(gè)特征表示,最終通過(guò)Rearrange重組方法將向量v從維度1×N重組為維度2×2×N/4,此時(shí)已經(jīng)對(duì)F中第一個(gè)維度為1×C的塊進(jìn)行了2倍上采樣。

圖3 Dupsampling結(jié)構(gòu)

W是根據(jù)已知的訓(xùn)練標(biāo)簽得到的,也就是真正的分割結(jié)果,對(duì)每個(gè)分割結(jié)果進(jìn)行一個(gè)矩陣轉(zhuǎn)換,將其轉(zhuǎn)換為編碼模塊得到的特征圖相同的維度。該過(guò)程為線性映射,形式化定義為式(1)

(1)

(2)

本文通過(guò)融入該方法于Unet++網(wǎng)絡(luò)解碼端進(jìn)行上采樣編碼端提取到的特征,相比使用雙線性插值上采樣方式的分割網(wǎng)絡(luò),該方法在上采樣時(shí)已經(jīng)計(jì)算并最小化了特征圖和被壓縮標(biāo)簽的像素點(diǎn)之間的損失,并融合了高級(jí)語(yǔ)義特征和低級(jí)語(yǔ)義特征,從而使得上采樣后恢復(fù)分辨率的圖像更為準(zhǔn)確。

1.4 激活函數(shù)

在卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中,輸入數(shù)據(jù)一般經(jīng)過(guò)卷積層提取特征,再由批量規(guī)范化層將數(shù)據(jù)進(jìn)行均值為0,方差為1的標(biāo)準(zhǔn)化處理,最后使用激活函數(shù)進(jìn)行非線性化操作,引入更多的非線性因素,增加神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的非線性變化,提高神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的信息表達(dá)能力。

Relu激活函數(shù)和Mish激活函數(shù)如圖4所示。傳統(tǒng)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)使用最多的激活函數(shù)是Relu[12],Relu激活函數(shù)圖像如圖4(a)所示,當(dāng)函數(shù)輸入值為負(fù)時(shí),函數(shù)值為0,當(dāng)函數(shù)輸入值為正時(shí),函數(shù)值等于輸入值,該激活函數(shù)的缺點(diǎn)是輸入數(shù)據(jù)為負(fù)時(shí),由于Relu函數(shù)的曲線過(guò)于平直會(huì)出現(xiàn)Dead Relu Problem(神經(jīng)元壞死現(xiàn)象),即x<0時(shí),梯度為0,不再對(duì)任何數(shù)據(jù)有所響應(yīng),因此會(huì)產(chǎn)生梯度消失的問(wèn)題,網(wǎng)絡(luò)難以更好地訓(xùn)練。MRI腦腫瘤圖像數(shù)據(jù)存在一些數(shù)據(jù)為負(fù)的情況,使用Relu激活函數(shù)的效果并不是最好。針對(duì)這些問(wèn)題,本文采用Misra等[13]提出的Mish激活函數(shù),Mish激活函數(shù)圖像如圖4(b)所示,該函數(shù)同Relu函數(shù)一樣,以上無(wú)邊界(即正值可以達(dá)到任何高度),避免了由于封頂而帶來(lái)的飽和,但對(duì)數(shù)據(jù)負(fù)值時(shí)有平滑的曲線,允許更好的梯度流,能有效避免梯度消失的問(wèn)題,且平滑的曲線能使更多的特征信息進(jìn)入網(wǎng)絡(luò),提高網(wǎng)絡(luò)的準(zhǔn)確性和泛化性。Relu激活函數(shù)和Mish激活函數(shù)的公式分別如式(3)和式(4)所示

Relu(x)=max(0,x)

(3)

Mish(x)=x*tanh(ln(1+exp(x)))

(4)

圖4 Relu和Mish激活函數(shù)圖像

1.5 損失函數(shù)

在網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練階段,本文采用融合了(cross entropy loss function)交叉熵?fù)p失函數(shù)和Dice兩種損失函數(shù)結(jié)合的混合損失函數(shù)。Dice損失函數(shù)最早提出主要是解決NLP(natural language processing)自然語(yǔ)言處理中數(shù)據(jù)不均衡的問(wèn)題[14],后面用在醫(yī)學(xué)圖像小目標(biāo)分割中也有很好的效果。由于MRI腦腫瘤圖像中存在前景和背景特征分布不均衡的問(wèn)題,例如圖像中存在器官像素的數(shù)量遠(yuǎn)小于背景像素?cái)?shù)量,單個(gè)交叉熵?fù)p失函數(shù)會(huì)使模型嚴(yán)重偏向于背景,導(dǎo)致效果不好,所以本文添加了Dice損失函數(shù)來(lái)彌補(bǔ)單個(gè)交叉熵?fù)p失函數(shù)的不足。Dice損失函數(shù)和交叉熵?fù)p失函數(shù)的公式分別如式(5)和式(6)所示

(5)

(6)

其中,pi和gi分別為預(yù)測(cè)圖像和標(biāo)簽圖像中的像素點(diǎn),本文使用的混合損失函數(shù)為這兩種損失函數(shù)之和,即式(5)和式(6)相加。

2 實(shí)驗(yàn)過(guò)程與結(jié)果分析

2.1 實(shí)驗(yàn)平臺(tái)

本文的實(shí)驗(yàn)環(huán)境為:Python3.7,Pytorch1.6深度學(xué)習(xí)框架,cuda10.2版本,Windows10操作系統(tǒng),NVIDIA TAITAN Xp顯卡,顯存大小為12 G,處理器為Iterl(R) Xeon(R),運(yùn)行內(nèi)存為64 G。

2.2 數(shù)據(jù)集

2.2.1 數(shù)據(jù)集分析

本文使用的數(shù)據(jù)為MICCAI Brain Tumor Segmentation (BraTS) 2019年和2018年的數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集是腦膠質(zhì)瘤患者的3DMRI核磁共振圖像,其中2018年數(shù)據(jù)集高級(jí)別膠質(zhì)瘤(HGG)病例和低級(jí)別膠質(zhì)瘤(LGG)病例總共有285例,2019年數(shù)據(jù)集在2018年原有數(shù)據(jù)集的基礎(chǔ)上增加了50例,包括49例高級(jí)版膠質(zhì)瘤病例和1例低級(jí)別膠質(zhì)瘤病例。每一例患者的3D核磁共振圖像包含T1、T1ce、T2和FLAIR這4種模態(tài),以及專家進(jìn)行手動(dòng)標(biāo)注的標(biāo)簽(GT金標(biāo)準(zhǔn)圖像)。本文網(wǎng)絡(luò)模型與標(biāo)簽一樣將腦膠質(zhì)瘤圖像分割為3個(gè)區(qū)域,包括整體腫瘤區(qū)域、核心腫瘤區(qū)域和增強(qiáng)腫瘤區(qū)域。本文使用2018年數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練集作為訓(xùn)練集和驗(yàn)證集,將2019年新增數(shù)據(jù)集的訓(xùn)練集作為測(cè)試集。圖5為2018年數(shù)據(jù)集中其中一例病例的側(cè)面和頂部圖像展示,其中圖5(a)~圖5(d)分別為FLAIR、t1、t1ce和t2這4種模態(tài)的頂部和側(cè)面腦腫瘤圖像,圖5(e)為專家標(biāo)注的腦腫瘤標(biāo)簽圖像。

圖5 BraTS18數(shù)據(jù)集中一例數(shù)據(jù)的側(cè)面和頂部圖像

2.2.2 數(shù)據(jù)集預(yù)處理

BraTS18年和BraTS19年的數(shù)據(jù)已經(jīng)做了許多預(yù)處理工作比如去顱骨重采樣以及數(shù)據(jù)配準(zhǔn)等,由于MRI圖像數(shù)據(jù)本身的特點(diǎn),要用于本文的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中并有助于網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練,還需要進(jìn)一步進(jìn)行處理,主要包括標(biāo)準(zhǔn)化、偏置場(chǎng)校正、裁剪、切片、合并等。

由于圖像采集時(shí)的不正確操作或者圖像本身的特性,核磁共振的圖像會(huì)存在一些偏置場(chǎng),是一種不良偽影,會(huì)使圖像產(chǎn)生灰度值亮度偏差,影響分割精度。所以,本文采用N4偏置場(chǎng)校正算法來(lái)校正圖像中的偏置場(chǎng)。N4偏置場(chǎng)校正算法目前應(yīng)用較為廣泛,在眾多醫(yī)學(xué)圖像處理中取得了不錯(cuò)的效果。本文采用的N4偏置場(chǎng)校正算法對(duì)其中某一圖像處理結(jié)果與原圖像對(duì)比如圖6所示,其中左邊圖像為原始FLAIR圖像,右邊圖像為N4偏置場(chǎng)矯正后的圖像。

圖6 N4偏置場(chǎng)校正前后圖像

BraTs數(shù)據(jù)集中不同模態(tài)的圖像都有著重要的信息,為了解決不同模態(tài)圖像存在的對(duì)比度差異問(wèn)題,本文使用了Z-Score方法,該方法對(duì)圖像中含有器官的部分都進(jìn)行零均值標(biāo)準(zhǔn)化和單位標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化。

MRI圖像都有黑色背景占很大一部分的特點(diǎn),就會(huì)導(dǎo)致圖像中腦腫瘤區(qū)域占比很小,黑色背景對(duì)于分割沒有任何幫助,反而會(huì)導(dǎo)致數(shù)據(jù)類別不平衡,所以需要對(duì)MRI圖像進(jìn)行裁剪,使腦腫瘤區(qū)域占比更大。

MRI圖像為3D圖像,不能在2D網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,為了適應(yīng)本文提出的2D網(wǎng)絡(luò),所以需要對(duì)圖像進(jìn)行切片為2D圖像,并拋除無(wú)病灶的切片,同樣是解決數(shù)據(jù)類別不平衡的問(wèn)題。又由于MRI圖像多模態(tài)的特點(diǎn),需要將各模態(tài)的切片合并組成多通道圖像輸入網(wǎng)絡(luò)。經(jīng)過(guò)裁剪切片組合后的圖像為160×160×4,即長(zhǎng)寬為160,通道數(shù)為4。

2.2.3 評(píng)價(jià)指標(biāo)

本文使用Dice相似系數(shù)(dice similarity coefficient,DSC)和豪斯多夫距離(Hausdorff distance)兩個(gè)指標(biāo)對(duì)最后的分割結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)。

(1)Dice相似系數(shù)

Dice相似系數(shù)是評(píng)價(jià)腦腫瘤分割結(jié)果常用的評(píng)價(jià)指標(biāo),表示標(biāo)簽中真實(shí)區(qū)域和預(yù)測(cè)圖像區(qū)域重合的部分占兩者之和的百分比,是一種幾何相似度度量的指標(biāo)。Dice相似系數(shù)的公式如式(7)所示,其中TP、TN、FP、FN分別代表真陽(yáng)性、真陰性、假陽(yáng)性、假陰性

(7)

(2)豪斯多夫距離

豪斯多夫距離用來(lái)衡量?jī)蓚€(gè)點(diǎn)集之間的距離,定義公式如式(8)、式(9)所示

(8)

(9)

式(8)表示點(diǎn)集A到點(diǎn)集B的豪斯多夫距離,式(9)表示點(diǎn)集B到點(diǎn)集A的豪斯多夫距離,雙向豪斯多夫距離為這兩者中較大的值,它能度量這兩個(gè)點(diǎn)集之間的最大不匹配程度。

2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

本文訓(xùn)練數(shù)據(jù)集為BraTS18年的訓(xùn)練集,測(cè)試數(shù)據(jù)集為BraTS19年較18年多出來(lái)的50例數(shù)據(jù)。表1是在該50例測(cè)試數(shù)據(jù)中各種實(shí)驗(yàn)方法的對(duì)比結(jié)果,圖7為Unet系列網(wǎng)絡(luò)的分割結(jié)果對(duì)比展示,圖8為改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練的loss值下降曲線。其中這些方法學(xué)習(xí)率為0.03,batch size統(tǒng)一為12,學(xué)習(xí)批次epoch根據(jù)不同模型訓(xùn)練過(guò)程有所不同,但是均不超過(guò)200都已得到相對(duì)穩(wěn)定、較好的效果。

表1 不同方法分割精度

圖7 不同方法分割結(jié)果

圖8 訓(xùn)練loss曲線

在表1中,Dice WT(whole tumor)、Dice TC(tumor core)、Dice ET(enhancing tumor)分別為整體腫瘤區(qū)域、核心腫瘤區(qū)域以及增強(qiáng)腫瘤區(qū)域在Dice分割指標(biāo)下的分割精度,HD(Hausdorff distance)WT、HD TC、HD ET分別為整體腫瘤區(qū)域、核心腫瘤區(qū)域以及增強(qiáng)腫瘤區(qū)域在豪斯多夫距離分割指標(biāo)下的分割精度。由表1實(shí)驗(yàn)對(duì)比結(jié)果所示,在Unet++網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中融入了殘差塊、基于數(shù)據(jù)相關(guān)性的Dupsampling上采樣方法、Mish激活函數(shù)以及交叉熵和Dice損失函數(shù)結(jié)合的混合損失函數(shù)對(duì)MRI腦腫瘤圖像分割精度有明顯的提升,且對(duì)比Unet、3DUnet、3DVnet以及Unet++在分割精度上有明顯的優(yōu)勢(shì),整體腫瘤區(qū)域、核心腫瘤區(qū)域和增強(qiáng)腫瘤區(qū)域Dice系數(shù)分別達(dá)到0.9236、0.8745、0.8404,Hausdorff距離為1.806、2.994、1.865。由圖7分割結(jié)果所示,不規(guī)則形狀中最外層最大的為浮腫區(qū)域,中間層為增強(qiáng)腫瘤區(qū)域,最里層最小的為壞疽,且浮腫區(qū)域和增強(qiáng)腫瘤區(qū)域中間也有部分壞疽。WT全腫瘤區(qū)域包括了浮腫區(qū)域、增強(qiáng)腫瘤區(qū)域和核心腫瘤區(qū)域,TC核心腫瘤區(qū)域包括了增強(qiáng)腫瘤區(qū)域和壞疽,ET為增強(qiáng)腫瘤區(qū)域。改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)分割結(jié)果相比前幾種方法在整體腫瘤區(qū)域和核心腫瘤區(qū)域更接近標(biāo)簽GT圖像,在3個(gè)區(qū)域的邊緣輪廓分割結(jié)果也更為精確。在圖8訓(xùn)練loss曲線可以看出,本文改進(jìn)的Unet++方法在125次迭代之前就已經(jīng)達(dá)到較低值且損失值波動(dòng)較小,逐漸趨于平穩(wěn),對(duì)比3DUnet和3DVnet以及Unet和Unet++損失值都整體明顯低一些。通過(guò)對(duì)比可以看出,本文改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)在MRI腦腫瘤自動(dòng)分割網(wǎng)絡(luò)較原始Unet++網(wǎng)絡(luò)有明顯提升,相比其它分割網(wǎng)絡(luò)也有明顯的優(yōu)勢(shì)。

3 結(jié)束語(yǔ)

本文根據(jù)MRI腦腫瘤圖像的特點(diǎn)以及針對(duì)目前醫(yī)學(xué)圖像分割網(wǎng)絡(luò)存在的問(wèn)題提出了改進(jìn)的Unet++網(wǎng)絡(luò)用于MRI腦腫瘤圖像自動(dòng)分割。主要貢獻(xiàn)如下:將改進(jìn)的殘差塊(residual block)融入U(xiǎn)net++網(wǎng)絡(luò)編碼層的特征提取部分,代替原始網(wǎng)絡(luò)中單純的卷積結(jié)構(gòu),提升了特征提取精度并防止網(wǎng)絡(luò)退化;用基于數(shù)據(jù)相關(guān)性的Dupsampling上采樣方式代替雙線性插值上采樣方法,提高上采樣過(guò)程中生成特征圖的質(zhì)量,同時(shí)也加快了網(wǎng)絡(luò)收斂速度;在網(wǎng)絡(luò)的每一層用Mish激活函數(shù)代替Relu激活函數(shù),Mish更加平滑的曲線會(huì)使網(wǎng)絡(luò)提取更多信息,提高網(wǎng)絡(luò)的泛化性和準(zhǔn)確性;使用Dice損失函數(shù)和交叉熵?fù)p失函數(shù)結(jié)合的混合損失函數(shù),彌補(bǔ)單個(gè)損失函數(shù)在數(shù)據(jù)出現(xiàn)不均衡時(shí)的不足。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,本文提出的改進(jìn)Unet++網(wǎng)絡(luò)相比Unet++以及Unet等主流網(wǎng)絡(luò)有較明顯的精度優(yōu)勢(shì),但2D網(wǎng)絡(luò)仍然會(huì)存在丟失一些3D圖像空間信息的問(wèn)題。在后面的工作中會(huì)根據(jù)2D網(wǎng)絡(luò)的問(wèn)題以及3D網(wǎng)絡(luò)參數(shù)量過(guò)大等問(wèn)題繼續(xù)優(yōu)化網(wǎng)絡(luò),提升分割效果。

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