基于黃地老虎轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的SSR 和SNP 特征分析

常 虹，高 燕，王思威，王瀟楠，劉艷萍，孫海濱

（廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所/廣東省植物保護(hù)新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，廣東 廣州 510640）

【研究意義】黃地老虎（Agrotis segetumDenis and Schiffermüller）是一種重要的世界性農(nóng)業(yè)害蟲，隸屬于鱗翅目（Lepidoptera）夜蛾科（Noctuidae），廣泛分布于亞洲、歐洲和非洲等地。黃地老虎主要為害棉花、馬鈴薯、玉米和十字花科蔬菜等作物，可對(duì)我國農(nóng)業(yè)和經(jīng)濟(jì)造成較大損失［1-2］。同時(shí)，它也是一種重要的遷飛害蟲，已有研究表明其在我國進(jìn)行季節(jié)性遷飛［3-4］。遷飛可促進(jìn)種群間的基因交流，極大降低不同地理種群間遺傳分化的程度。對(duì)黃地老虎種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究，有助于探討不同地理種群間的遺傳分化關(guān)系，揭示其遷飛路徑及起源，進(jìn)而為明確該蟲的種群發(fā)生動(dòng)態(tài)及成災(zāi)機(jī)制提供科學(xué)依據(jù)。【前人研究進(jìn)展】微衛(wèi)星又稱簡單重復(fù)序列（simple sequence repeats，SSR），是一類由1～6 個(gè)核苷酸簡單串聯(lián)重復(fù)組合而形成的核苷酸序列，一般由中心的重復(fù)序列和兩端的保守序列構(gòu)成。微衛(wèi)星具有共顯性遺傳、多態(tài)性信息含量高、具有很高的突變速率及穩(wěn)定性高、實(shí)驗(yàn)重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn)，被廣泛應(yīng)用于種群遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳分化等種群遺傳學(xué)的研究［5-8］。單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism，SNP）主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸變異引起的DNA 序列多態(tài)性，具有分布廣泛、數(shù)量豐富、遺傳穩(wěn)定性高、較高DNA 降解耐受性等特點(diǎn)，被用于群體遺傳分析及品種鑒定等研究［9-12］。傳統(tǒng)的SSR 和SNP分子標(biāo)記的開發(fā)需要構(gòu)建基因組文庫進(jìn)行克隆測(cè)序，檢測(cè)過程繁瑣且費(fèi)時(shí)費(fèi)力。……