基于黃地老虎轉錄組測序的SSR 和SNP 特征分析

常 虹，高 燕，王思威，王瀟楠，劉艷萍，孫海濱

（廣東省農業科學院植物保護研究所/廣東省植物保護新技術重點實驗室，廣東 廣州 510640）

【研究意義】黃地老虎（Agrotis segetumDenis and Schiffermüller）是一種重要的世界性農業害蟲，隸屬于鱗翅目（Lepidoptera）夜蛾科（Noctuidae），廣泛分布于亞洲、歐洲和非洲等地。黃地老虎主要為害棉花、馬鈴薯、玉米和十字花科蔬菜等作物，可對我國農業和經濟造成較大損失［1-2］。同時，它也是一種重要的遷飛害蟲，已有研究表明其在我國進行季節性遷飛［3-4］。遷飛可促進種群間的基因交流，極大降低不同地理種群間遺傳分化的程度。對黃地老虎種群遺傳結構進行研究，有助于探討不同地理種群間的遺傳分化關系，揭示其遷飛路徑及起源，進而為明確該蟲的種群發生動態及成災機制提供科學依據。【前人研究進展】微衛星又稱簡單重復序列（simple sequence repeats，SSR），是一類由1～6 個核苷酸簡單串聯重復組合而形成的核苷酸序列，一般由中心的重復序列和兩端的保守序列構成。微衛星具有共顯性遺傳、多態性信息含量高、具有很高的突變速率及穩定性高、實驗重復性好等優點，被廣泛應用于種群遺傳結構及遺傳分化等種群遺傳學的研究［5-8］。單核苷酸多態性（single nucleotide polymorphism，SNP）主要是指在基因組水平上由單個核苷酸變異引起的DNA 序列多態性，具有分布廣泛、數量豐富、遺傳穩定性高、較高DNA 降解耐受性等特點，被用于群體遺傳分析及品種鑒定等研究［9-12］。傳統的SSR 和SNP分子標記的開發需要構建基因組文庫進行克隆測序，檢測過程繁瑣且費時費力。……