劉玉飛,龐丹丹,李友勇,蔣會兵,田易萍,孫云南,陳林波*
苦茶堿代謝關鍵轉錄因子基因的篩選鑒定
劉玉飛1,2,龐丹丹1,2,李友勇1,2,蔣會兵1,2,田易萍1,2,孫云南1,2,陳林波1,2*
1. 云南省農業科學院茶葉研究所,云南 勐海 666201;2. 云南省茶學重點實驗室,云南 勐海 666201
苦茶是我國特異的茶樹資源,主要分布于西南地區,富含苦茶堿(1,3,7,9-四甲基尿酸)。苦茶堿具有鎮靜、催眠和抗抑郁等多種生理活性,其合成關鍵基因(苦茶堿合成酶基因)已經得到克隆和研究,但是苦茶堿代謝調控機制的研究鮮有報道。為了挖掘與苦茶堿代謝調控相關的轉錄因子,本研究以高苦茶堿(GKC)、低苦茶堿(LKC)茶樹品種以及常規茶樹品種(YK10)為研究對象,通過HPLC和RNA-seq分別就樣品的嘌呤生物堿含量和基因表達情況進行分析,并通過熒光定量PCR驗證了轉錄組數據的可靠性。結果表明,GKC和LKC的苦茶堿含量分別為21.82?mg·g-1和14.70?mg·g-1,而YK10中檢測不到苦茶堿,另外,GKC和LKC的咖啡堿含量均低于15.00?mg·g-1;通過RNA-seq方法,獲得了3?948個GKC vs YK10和LKC vs YK10共同的且表達趨勢一致的差異基因,這些差異基因是分屬29個家族的96個轉錄因子,通過分析最終確定30個候選轉錄因子,尤其是屬于NAC和HD-ZIP轉錄因子家族的、、、和等轉錄因子可能是參與苦茶堿代謝調控的關鍵基因。
苦茶;苦茶堿;RNA測序;轉錄因子
苦茶(var. kucha)是我國特異的茶樹資源,其鮮葉和以其鮮葉所制作的茶葉都具有獨特的苦味,其主要分布于廣東、廣西、云南、湖南,尤以云南以及南嶺山脈兩側最多[1-2],其中云南省南部、東南部的西雙版納州、紅河州分布著大量的苦茶資源[3]。……