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高絮凝活性放線菌的鑒定和培養基組分的初步優化

2022-01-10 05:28:46田宇曦楊自文
湖北農業科學 2021年24期
關鍵詞:大豆優化

田宇曦,陳 凌,閔 勇,楊自文

(湖北省生物農藥工程研究中心,武漢 430064)

絮凝是將分散的小顆粒聚攏形成大絮凝物的過程,絮凝劑廣泛應用于可飲用水凈化、廢水處理、下游處理、食品發酵工業等[1,2]。絮凝劑一般能分成3類,即無機絮凝劑、有機合成絮凝劑和天然產生的絮凝劑,其中,天然產生的絮凝劑包括海藻酸鈉、殼聚糖和微生物源絮凝劑。細菌、真菌、藻類和放線菌都能產生微生物絮凝劑,包括多聚糖、功能蛋白和糖蛋白等[3]。產生微生物絮凝劑的微生物分離自淡水環境、活性污泥、土壤、啤酒廢水和海洋沉積物等[4-6]。在絮凝領域,化學合成絮凝劑因為廉價和絮凝率高被廣泛應用,但是其使用會引起一些環境問題和老年癡呆癥等健康隱患[7,8]。用環境友好型、可生物降解的微生物源絮凝劑替代化學合成絮凝劑越來越受到關注,微生物源絮凝劑通過絮凝過程修復污染的水體,相比普通的化學絮凝更經濟且環保[9]。農村污水分散,不像城市有完善的污水收集和處理系統,農村污水污染物毒性較低,可生化性好,且農村對環境安全的要求更高,微生物源絮凝劑綠色無污染,能很好地滿足農村污水處理的環保要求,甚至實現資源的循環利用[10]。但是,盡管有大量微生物被發現能產生生物絮凝劑,真正商業應用的卻幾乎沒有[11,12]。

為了開發用于農村污水治理的高絮凝活性菌株,擬對高絮凝活性放線菌ws75382進行16SrDNA鑒定,為了降低絮凝劑的生產成本,并利用單因素試驗和正交試驗對其培養基組分進行優化,以期獲得最節省的培養組分,為今后將其在農村污水治理領域規?;瘧么蛳禄A。

1 材料與方法

1.1 材料

菌株為湖北省生物農藥工程研究中心菌種保藏中心保藏的放線菌。

培養基:①ISP2固體培養基:葡萄糖4 g/L,酵母粉4 g/L,麥芽浸出粉10 g/L,碳酸鈣2 g/L,瓊脂18 g/L,自然pH。②種子培養基:大豆粉20 g/L,葡萄糖20 g/L,硫酸銨5 g/L,氯化鈉8 g/L,碳酸鈣2 g/L,pH 7.0[13]。③發酵培養基:碳源、氮源、氯化鈉,碳酸鈣,pH 7.0。

細菌基因組提取試劑盒購自上海賽百盛基因技術有限公司,引物27F和1492R由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,高嶺土和EasyTaq混合酶購自生工生物工程(上海)股份有限公司。

1.2 放線菌的培養條件和絮凝率的測定

將湖北省生物農藥工程研究中心保存的放線菌ws75382斜面在ISP2固體平板上劃線活化,30℃倒置培養3~5 d。從活化平板挑菌塊1 cm2接入裝有50 mL種子培養基的500 mL三角瓶中,30℃搖床培養2 d,后將發酵液0.5 mL轉接入裝有50 mL發酵培養基的250 mL三角瓶中,30℃搖床培養2~3 d,鏡檢無污染后,取發酵液1.5 mL,12 000 r/min離心1 min,將發酵液上清液500μL加入20 mL 5 g/L高嶺土(加有40μL 1 mol/L CaCl2,均置于帶橡膠軟塞的玻璃試管中)上下顛倒混勻5 min,靜置3 min,取液面下1~2 cm處液體100μL至96孔板,用酶標儀在550 nm處測定吸光度OD550nm。對照是沒有發酵的發酵培養 基 上清 液。絮凝 率=(OD樣品-OD對照)/(OD對照-OD背景)×100%。

1.3 菌株的16S rDNA鑒定

采用細菌基因組提取試劑盒提取菌株ws75382基因組,使用細菌16SrRNA通用引物對其進行PCR擴增,引物 序列如下,27F:5′-AGAGTTTGATCCT GGCTCAG-3′和1492R:5′-ACGGCTACCTTGTTACG ACTT-3′。擴增體系:2×EasyTaq混合酶體系25μL,DNA模板1μL,上下游引物各1μL,加入ddH2O補足體積至50μL。PCR擴增反應條件:94℃2 min;94℃30 s,58℃30 s,72℃90 s,30個循環;72℃10 min,4℃無限循環終止反應。使用濃度為1%(W/V)的瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增后的產物,然后送生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序,獲得16SrDNA完整序列信息。登錄NCBI網站(www.ncbi.nlm.nih.gov),將獲得的基因序列與GenBank中已知的序列進行同源性比對分析,根據所獲得的相似性序列,用軟件MEGA-X采用鄰接法構建系統發育樹。

1.4 發酵培養基組分的優化

找到種子發酵液條件下絮凝率為50%左右的發酵液稀釋度,在此稀釋度下進行碳氮源優化試驗。①氮源試驗:以種子培養基為基礎,只改變氮源,考察20、15 g/L大豆粉分別與5 g/L蛋白胨、酵母浸粉和硫酸銨配合作氮源對放線菌ws75382絮凝率的影響,選出最佳氮源。②碳源試驗:以種子培養基為基礎,只改變碳源,考察20 g/L葡萄糖、蔗糖、麥芽糖和可溶性淀粉作碳源對放線菌ws75382絮凝率的影響,選出最佳碳源。使用SPSS17.0統計分析軟件進行單因素方差分析(Turkey′s HSD test,P<0.05),分析數據間的差異顯著性。

正交試驗同樣使用相同比例稀釋后的發酵液,將試驗獲得的最佳氮、碳源及氯化鈉和碳酸鈣進行正交試驗L16(45),獲得最佳培養基配方。

2 結果與分析

2.1 ws75382菌株的鑒定

湖北省生物農藥工程研究中心保存的放線菌ws75382在種子培養基中發酵可以達91.9%的絮凝活性。種子培養基有5種培養組分且各組分濃度都偏高。ws75382的16SrDNA擴增長度為1 433 bp,通過NCBI BLAST顯示其與Streptomyces cyslabdani?cusstrain K04-0144同源性最高,相似度為99.22%。ws75382的系統發育樹(圖1)顯示,其與Streptomy?cescyslabdanicusstrain K04-0144親緣關系最近。

圖1 ws75382 16Sr DNA系統進化樹

2.2 發酵培養基組分的優化

2.2.1 發酵培養基中的氮、碳源對放線菌ws75382絮凝率的影響 種子發酵液發酵條件下,ws75382發酵液和去離子水按30∶1(V/V)稀釋,稀釋后的發酵液上清絮凝率為64.9%,將單因素試驗中各發酵液均按發酵液∶水為30∶1稀釋,氮源優化結果見圖2,碳源優化結果見圖3。由圖2可以看出,大豆粉單獨作為氮源,放線菌ws75382發酵上清液絮凝率最高,顯著優于在大豆粉基礎上添加其他氮源,而大豆粉添加蛋白胨和酵母粉又顯著優于大豆粉+硫酸銨。所以,作為氮源,大豆粉最有利于放線菌ws75382產生絮凝劑。由圖3可以看出,4種碳源之間沒有顯著性差異,麥芽糖最有利于放線菌ws75382產生絮凝劑,其次是葡萄糖,考慮到麥芽糖成本較高,選擇葡萄糖作為放線菌ws75382發酵碳源。

圖2 N源優化結果

圖3 C源優化結果

2.2.2 發酵培養基優化結果 根據氮、碳源單因素試驗結果,選取大豆粉、葡萄糖及其他培養基成分,按L16正交表安排試驗,考察各培養基組分對放線菌ws75382絮凝率的綜合影響。正交試驗因素與水平見表1,正交試驗結果見表2,方差分析見表3。

表1 優化發酵培養基組分的正交試驗因素水平(單位:g/L)

由表2直觀極差分析可以看出,以絮凝率為評價指標,各因素對放線菌ws75382絮凝率的影響大小表現為A>C>D>B。最優組合為A3B3C4D2,即培養基最佳配方為大豆粉15 g/L,葡萄糖14 g/L,氯化鈉8 g/L和碳酸鈣3 g/L。由表3方差分析可見,大豆粉和氯化鈉對放線菌ws75382絮凝率的影響極顯著,與直觀分析結果一致。以A3B3C4D2培養基配方進行3次驗證試驗,所得絮凝率接近100%,證明其是優配方。

表2 正交試驗結果

表3 極差分析結果

3 小結與討論

未優化前,培養基配方為大豆粉20 g/L、葡萄糖20 g/L、硫酸銨5 g/L、氯化鈉8 g/L、碳酸鈣2 g/L,放線菌ws75382絮凝率為91.9%。經過優化,培養基配方為大豆粉15 g/L、葡萄糖14 g/L、氯化鈉8 g/L和碳酸鈣3 g/L,放線菌ws75382絮凝率為100%。相對初始培養基,優化后的培養基不僅組分簡化,氮源只需采用一種組分大豆粉,此外氮源和碳源的量分別降低了40%和30%。

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