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1例Rhmod個體的RHAG基因分析

2021-12-22 01:52:26黃嫻李立新李雙玉吳麗娜解金輝
臨床輸血與檢驗 2021年6期
關鍵詞:檢測

黃嫻 李立新 李雙玉 吳麗娜 解金輝

Rh血型系統(ISBT004)包含RHD和RHCE兩個同源連鎖基因,分別編碼D抗原和CcEe抗原,是最重要的紅細胞血型系統之一。RHAG血型系統(ISBT030)由RHAG基因編碼Rh相關蛋白RhAG,RhAG蛋白對RhD/CE抗原在紅細胞膜上的正確連接定位十分重要[1]。RHAG基因變異可導致Rh血型抗原顯著減少,稱為Rhmod[2]。我們通過1例由于RHAG新復合雜合突變導致的Rhmod家系進行血清學與基因檢測,并采用生物信息學方法和蛋白結構模型,初步探討這例新的復合突變導致Rhmod型的分子基礎。

材料與方法

1 研究對象 Rhmod型家系來自天津,先證者父親已故,無兄弟姐妹子女,直系親屬僅現存母親。先證者,女,18歲,無輸血史和妊娠史,因溶血性黃疸收住入院,總膽紅素51 μmol/L,間接膽紅素27 μmol/L,血紅蛋白93 g/L。醫院初檢為Rh陰性,送檢血液中心進行交叉配血,為切脾手術備血。

2 試劑與儀器 抗C、c、E、e(CE-IMMUNODIAGN OSTIKA公司),抗D試劑4種(上海血液生物,加拿大宜美康,CE-IMMUNODIAGNOSTIKA,Sanquin),DNA提取試劑盒(Magen公司),Taq DNA聚合酶(Takara公司)。微柱凝膠抗球蛋白檢測卡、孵育器、卡式離心機(BIO-RAD公司),離心機(KUBOTA公司),分光光度計(IMPLEN公司),PCR儀(ABI公司),電泳儀(Thermo公司),凝膠成像儀(北京東訊天地)。所有試劑與儀器均在有效期內使用。

3 方法

3.1 Rh抗原檢測:采用試管鹽水法、微柱凝膠卡法,使用4種克隆株的抗D試劑檢測先證者RhD抗原。用吸收放散試驗檢測其紅細胞是否表達微量的D抗原,放散法使用Sanquin公司的酸放散試劑盒。由于樣本量所限,未進行RhCE抗原的吸收放散試驗。采用試管鹽水法和微柱凝膠卡法檢測所有受試者的RhCE抗原、不規則抗體篩查和直抗。

3.2 DNA提取及PCR擴增:采用蛋白酶K法抽提所有受試者的外周靜脈血DNA,檢測抽提DNA的濃度和純度。自行設計RHD、RHCE、RHAG基因所有外顯子的PCR引物(由Invitrogen公司合成),尋最適條件進行PCR-SSP。

3.3 DNA測序分析:RHD、RHCE、RHAG的PCR擴增產物送Invitrogen公司測序,測序引物使用擴增引物。測序結果用Choromas軟件與ISBT公布的RHD(NG_007494)、RhCE(RhCE*ce,NM_020485)、RHAG(NG_011704)基因序列進行比對。先證者母親進行相同的PCR擴增和RHAG基因測序。

3.4 生物信息學分析:使用PolyPhen-2和Provean兩個在線生物信息學軟件,分析氨基酸變異對蛋白質功能的影響。運用PyMOL軟件,對變異氨基酸進行空間定位,并分析其與周圍氨基酸的氫鍵作用。

結 果

1 血清學檢測結果 先證者D、C、c、E、e抗原鹽水法、微柱凝膠卡法均為陰性,分析可能為Rh抗原系統抗原不表達(Rhnull表型)或弱表達(Rhmod表型)。吸收放散試驗顯示D抗原為陽性,先證者符合Rhmod表型。其母親Rh抗原未見明顯異常,Rh血型為ccDEE。先證者和母親抗篩、直抗均陰性。

2RHD和RHCE基因變異檢測結果 先證者RHD基因1-10外顯子及剪切點區域未發現突變,RHCE*01.01第1外顯子存在48G>C(Trp16Cys),是常見的RHCE等位基因。

3RHAG基因變異檢測結果 如圖1所示,先證者RHAG基因第3外顯子編碼第142位氨基酸的堿基發生c.425T>C,使亮氨酸轉為脯氨酸(p.Leu142Pro),第8外顯子編碼第376位氨基酸的堿基發生c.1126G>A,使甘氨酸轉為蘇氨酸(p.Gly376Ser),兩處變異均為雜合錯義突變。先證者母親RHAG基因第8外顯子也存在c.1126G>A。

圖1 先證者RHAG基因測序結果

4 生物信息學分析結果

4.1 蛋白影響力評估:如圖2所示,p.Leu142Pro變異PolyPhen-2評分結果為0.999分,Provean評分結果為-6.220分;p.Gly376Ser變異PolyPhen-2評分結果為1.000分,Provean評分結果為-5.580分,預示這兩處變異均為有害變異,可影響蛋白質功能。

圖2 2種生物信息學軟件對氨基酸變異預測結果

4.2 變異位點空間結構分析結果:PyMOL模型分析顯示,RhAG蛋白有12個α-螺旋,p.Leu142Pro位于第5個α-螺旋跨膜區域接近胞內處,p.Gly376Ser位于第12個α-螺旋跨膜區域,如圖3所示。圖4為氨基酸變異前后氫鍵的比較,p.Leu142變為p.Pro142后,與p.Pro138的氫鍵作用消失;p.Gly376變為p.Ser376后,增加p.Ala372、p.Val373、p.Leu377位之間的3個氫鍵。分析顯示2處變異均可能改變氨基酸間氫鍵的聯系。

圖3 RhAG蛋白三維空間結構模型

圖4 氨基酸變異前后氫鍵比較

討 論

RHAG基因位于6號染色體長臂6p11-p21. 1,它編碼的RhAG抗原蛋白含409個氨基酸,12次穿膜,N端和C端都在膜內[3]。RhAG蛋白是膜上多聚體的主要成分之一,與RhD、RhCE、GPB、GPA、CD47、LW、帶3蛋白和帶4.2蛋白組成蛋白復合物[4]。如果RhAG抗原不能正常表達,不僅造成RhD/CE蛋白不能正常穿膜,還會造成紅細胞塌陷,口形和球形紅細胞增多[5],細胞水分過多和陽離子外流[6],紅細胞在體內存活期縮短,個體易發生輕到中度的代償性溶血性貧血[7-8],少數重度病例在脾切除術后仍有溶血癥狀[9]。本文中先證者患有溶血性黃疸,可能與RHAG基因變異有關,脾切除手術未輸血,術后溶血和貧血癥狀減輕。

Rh缺失型可分為無效等位基因型(amorph type)及調節型(regulator type)。Rhmod屬于調節型,RHD/CE基因正常,但RHAG是無活性的突變純合子或雙雜合子[10]。本文中先證者的RHAG基因外顯子存在425T>C和1126G>A兩處變異,均為雜合錯義突變,導致Rh抗原表達顯著減少的Rhmod型。Rhmod型案例罕見,目前國際上報道的Rhmod型有RHAG1183delA、RHAG3G>T、236G>A[11]、 398T>C、572G>A[12]和707A>C等,比對國內外文獻和NCBI、ISBT數據庫網站,未發現本文中RHAG兩處位點變異的報道,為新的基因變異。

先證者的兩處變異,1126G>A遺傳自母親,先證者父親已故無法測序且無兄弟姐妹子女,推測425T>C可能遺傳自父親。而先證者母親Rh抗原未見明顯異常,母親應為攜有一條正常RHAG基因,一條變異基因。進一步試驗可檢測先證者及母親RhAG及其它相關蛋白的表達水平,還可構建突變細胞體外分析變異對蛋白表達的影響。本文三維模型顯示先證者1處變異氨基酸位于α-螺旋跨膜區域接近胞內區,2處變異均可能改變氨基酸分子間作用,蛋白功能預測軟件預測為有害,推測其可能影響其與RhD/CE蛋白在胞內結合形成多聚體而不利于RhD/CE蛋白跨膜,為探索Rhmod的分子機制提供啟示。

利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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