基于生物信息學探討甲狀腺功能亢進與骨質疏松間的作用關系*

李志超 譚國慶 徐展望 薛海鵬**

(1.山東中醫藥大學，山東 濟南 250000；2.山東中醫藥大學附屬醫院，山東 濟南 250000)

甲狀腺功能亢進是臨床常見內分泌性疾病，甲狀腺功能亢進癥引起骨量減少，增加骨折風險已得到公認[1]。甲狀腺素主要通過作用下丘腦-垂體-甲狀腺軸實現對骨系統的內分泌調控[2]。在骨骼發育成熟過程中，成骨細胞的骨形成及破骨細胞的骨吸收之間保持動態平衡，普遍認為甲狀腺功能亢進癥時高水平的甲狀腺素會加快骨轉換速率，造成骨代謝紊亂，促進骨吸收造成骨質疏松[3]。應用生物信息學整合甲狀腺功能亢進及骨質疏松的基因數據，不僅能較為科學的從分子層面闡述甲狀腺功能亢進與骨質疏松間的影響機制，而且也為藥物同時干預兩種疾病提供了理論基礎。

1 材料和方法

分別以骨質疏松及甲狀腺功能亢進為關鍵詞在相關疾病數據庫(Disgenet、TTD、OMIM、Drugbank、Genecards)中篩選相關靶點，其中Disgenet篩選評分≥0.3，Genecards篩選相關度≥5。將兩組基因通過uniprot數據庫轉換成uniprot ID進行去重整合，獲得已明確的疾病靶點。然后將兩組靶點映射取得韋恩圖，將得到的關鍵靶點通過string數據庫制作靶點間相互作用PPI網絡。將PPI網絡TSV格式導進Cytoscape3.7.2，篩選節點連接度(degree)≥35的靶點制作核心靶點圖。通過基因功能注釋DAVID 數據庫進行GO(Gene Ontology)生物過程富集分析以及 KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析使基因信息可視化，分別將篩選出的前20個GO條目與KEGG條目，依據Omicshare云平臺制作高級氣泡圖。

2 結果

經過基因庫搜索、轉換ID查重整合后共選出與骨質疏松癥和甲狀腺功能亢進相關基因875個和271個。……