熱蛋白質組學分析鑒定TH588的靶標蛋白

劉宗元，朱松標，鄧海騰，陳宇凌

(1.清華大學生命科學學院，北京 100084；2.生物信息學教育部重點實驗室，北京 100084)

鑒定活性小分子的靶標蛋白不僅可以建立活性小分子與細胞表型之間的聯(lián)系，闡明活性小分子的作用機理，還可以發(fā)現(xiàn)活性小分子的脫靶效應及可能的適應癥，并在藥物開發(fā)的早期階段預測潛在的副作用和毒性，從而降低研發(fā)失敗的風險。活性小分子靶標的鑒定是藥物研發(fā)的關鍵步驟之一，也是分析化學發(fā)展的重要領域。親和色譜-質譜技術是活性小分子靶標鑒定的標準方法，但需對小分子進行化學修飾，可能導致小分子的活性降低或改變，影響藥物與靶蛋白的結合。近年來，不依賴化學修飾的活性小分子靶標鑒定技術迅速發(fā)展，主要是基于活性小分子與靶標蛋白結合引起的蛋白穩(wěn)定性變化，從而改變靶標蛋白對酶促水解反應、化學變性和熱變性的耐受程度。這些鑒定方法包括藥物親和反應靶標穩(wěn)定性(DARTS)、蛋白質氧化速率穩(wěn)定性(SPROX)、細胞熱位移測定(CETSA)、熱蛋白質組分析(TPP)[1]。TPP技術基于與配體結合可增加目標蛋白在高溫下的穩(wěn)定性，造成目標蛋白隨溫度的溶解曲線發(fā)生偏移這一原理，結合高分辨定量質譜技術，可在細胞裂解物、細胞、組織甚至動物等多層面上實現(xiàn)對小分子靶標蛋白的鑒別，具有重要的應用前景[2-3]。鑒于TPP技術在操作上的復雜性，獲得可靠和可重復的TPP數(shù)據(jù)仍然非常困難。

7，8-二氫-8-氧鳥嘌呤三磷酸酶(MTH1)通過清除氧化受損的核苷酸，防止DNA復制時氧化堿基造成的DNA損傷，是細胞應對ROS引起DNA損傷的關鍵酶[4]。……