基于生物信息學分析miR-655在口腔鱗狀細胞癌中的表達及功能探討

王曦 戈春城 童國勇 徐佳

口腔鱗狀細胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)，是口腔頜面部常見的惡性腫瘤，占比約為90%[1]。OSCC具有浸潤性強、淋巴結易轉移的特點，是導致患者5 年內總的生存率不到50%的主要原因[2-3]。研究OSCC的發病機制，尋找有效的分子靶點對OSCC的診斷及治療具有重要意義。目前隨著高通量基因測序技術在腫瘤中的應用，已有研究探討了某些mRNA或miRNA分子對OSCC的發生發展和預后的影響[4-5]。

microRNAs(miRNAs)是在真核生物中發現的一類可在轉錄及轉錄后水平調控靶基因表達的非編碼RNA，長約20～25 個核苷酸，目前已成為腫瘤研究的熱點[6-7]。miR-655位于14號染色體的 q32.31位點，參與基因表達的調控,影響細胞增殖和生長等生物學過程。研究報道miR-655具有抑制腫瘤的作用[8]，然而目前對miR-655在OSCC的研究國內尚未見報道，因此本研究擬利用公開發表的的RNA-seq數據，探討miR-655在OSCC患者中的表達及臨床意義。

1 資料與方法

1.1 數據資料收集

1.1.1 TCGA數據收集 從癌癥和腫瘤基因圖譜(the cancer genome atlas，TCGA)(https://cancergenome.nih.gov/)數據庫中下載342 例OSCC樣本及臨床數據(年齡、性別、腫瘤分級、腫瘤分期、吸煙、飲酒史、總生存期)和44 例癌旁樣本，該miRNA數據集采用RNA-seq技術檢測基因表達。

1.1.2 OSCC患者樣本收集 2018 年01 月～2020 年01月經恩施土家族苗族自治州中心醫院口腔科手術切除的40 例OSCC患者，術后病理科確診，收集癌組織及癌旁組織兩份標本，入組患者未行放化療、靶向治療等治療方案，置于-80 ℃保存備用。本研究征得患者及家屬的知情同意，并獲得本院倫理委員會批準。

1.1.3 主要試劑及儀器 正常人口腔上皮細胞HOK及OSCC細胞系(TSCCa、CAL-27、SCC-4、HN-6)(中科院上海細胞庫)；……