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lncRNA RPA3-AS1/miR-203a-3p/BAG3分子軸對人心肌細胞凋亡的影響*

2021-07-28 12:36:58周利平楊化冰
國際檢驗醫學雜志 2021年14期
關鍵詞:生物水平檢測

黃 銳,王 劍△,譚 慧,周利平,楊化冰,劉 娟

1.利川市人民醫院心血管內科,湖北利川 445400;2.恩施州中心醫院西醫部藥劑科,湖北恩施 445000

急性心血管事件是人類死亡的主要原因之一,伴隨人口老齡化的加重,心血管疾病的發生率逐年增加[1-3]。心肌缺血再灌注可加重心肌細胞甚至心臟結構的損傷,嚴重影響心臟功能[4-6]。心肌細胞凋亡是導致心肌缺血再灌注損傷的重要原因[7-8]。因此,降低心肌細胞凋亡率是預防和治療心肌缺血再灌注損傷的關鍵。長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一種高度保守的單鏈內源性RNA,長度超過200個核苷酸[9-10]。lncRNA廣泛參與調控基因的表達,在細胞的發育、增殖、衰老、凋亡等進程中發揮關鍵作用[11-12]。越來越多的研究發現,心肌細胞損傷伴隨lncRNA表達譜的改變,lncRNA表達增加或降低可導致心律失常、心肌肥大、心肌梗死等各種心臟疾病[13]。全血lncRNA的表達水平是診斷心血管疾病的重要標志物[14]。RPA3-AS1是近年來新發現的lncRNA,RPA3-AS1在人類疾病特別是心血管疾病的關系尚不明確。本研究旨在探討RPA3-AS1是否在心肌缺血再灌注損傷中發揮作用,探究RPA3-AS1在心肌細胞中可能的作用機制。

1 材料與方法

1.1材料

1.1.1臨床標本 收集2019年1月至2020年6月利川市人民醫院心血管內科治療的43例急性心肌缺血患者(患者組)全血標本,以及同期43例體檢健康者(健康組)全血標本。本研究得到利川市人民醫院倫理委員會批準,受試者均簽署知情同意書。

1.1.2細胞與試劑 人心肌細胞系AC16購于中科院上海細胞庫。高糖DMEM培養基和胎牛血清購于美國Hyclone公司。實時定量聚合酶鏈反應(qPCR)試劑盒和轉染試劑LipofectamineTM3000購于美國Invitrogen公司。噻唑藍(MTT)試劑盒購于南京凱基生物科技發展有限公司。TRizol裂解液購于美國Sigma公司。載有RPA3-AS1序列的質粒和陰性對照質粒購于上海和元生物技術股份公司。一抗和二抗購于美國Abcam公司。Annexin Ⅴ-FITC細胞凋亡檢測試劑盒購于上海碧云天生物技術有限公司。

1.2方法

1.2.1細胞培養和轉染 于37 ℃、5% CO2的培養箱中,人心肌細胞系AC16培養在含10%胎牛血清、100 U/mL青霉素和100 U/mL鏈霉素的高糖DMEM培養基中。將對數生長期AC16細胞接種于6孔板,待細胞密度達到60%時,根據LipofectamineTM3000轉染試劑說明書,轉染載有RPA3-AS1序列的質粒(實驗組)和陰性對照質粒(對照組),培養箱中繼續培養48 h。

1.2.2qPCR檢測 RPA3-AS1、miR-203a-3p和BAG3 mRNA的表達 采用TRIzol-氯仿-異丙醇體系提取全血標本和細胞系總RNA,逆轉錄合成cDNA。qPCR反應條件為95 ℃ 6 min,95 ℃ 20 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,總共40個循環。采用2-ΔΔCt方法計算RPA3-AS1、miR-203a-3p和BAG3 mRNA相對表達量。以GAPDH為內參檢測RPA3-AS1和BAG3 mRNA的表達;以U6為內參檢測miR-203a-3p的表達。引物序列如下,miR-203a-3p正向引物:CCG GTG AAA TGT TTA GGA CCA CTA G,反向引物:GCC GCG TGA AAT GTT TAG G;GAPDH正向引物:CTG GGC TAC ACT GAG CAC C,反向引物:AAG TGG TCG TTG AGG GCA ATG;BAG3正向引物:AGC TCC GAC CAG GCT ACA TT,反向引物:GGA TAG ACA TGG AAA GGG TGC。U6正向引物:CTC GCT TCG GCA GCA CA,反向引物:AAC GCT TCA CGA ATT TGC GT。

1.2.3MTT法檢測AC16細胞活力 將對數生長期的兩組細胞接種于96孔板,每孔5×103個細胞,每孔加入200 μL培養基。分別在接種后第1、2、3、4、5 d兩組的細胞活性。MTT檢測時,在各孔細胞中加入20 μL MTT試劑(濃度為5 g/L),在培養箱中培養4 h后吸去液體,各孔加入150 μL二甲基亞砜,室溫下在震蕩搖床振蕩至結晶完全溶解,酶標儀檢測各孔在450 nm波長處的吸光度(A)值(反映細胞活力)。

1.2.4流式細胞術檢測AC16細胞凋亡率 收集對數生長期的兩組細胞,采用PBS溶液洗3次,采用binding buffer重懸細胞并調整細胞密度。分別取100 μL細胞懸液,加入5 μL Annexin V-FITC并混勻,加入5 μL PI并混勻,在培養箱內避光培養15 min。加入100 μL binding buffer并混勻,在1 h內采用流式細胞儀檢測兩組細胞的凋亡率。

1.2.5生物信息學方法預測RPA3-AS1的作用機制 采用生物信息學軟件starBase v2.0預測RPA3-AS1可配對結合的miRNA。采用生物信息學軟件miRWalk 2.0和DIANA-microT預測miR-203a-3p可配對結合的靶基因mRNA。

1.2.6Western blot法檢測BAG3蛋白和相關凋亡蛋白的表達 采用細胞裂解液提取細胞總蛋白,檢測蛋白濃度,每組取35 μg總蛋白行聚丙烯酰胺凝膠電泳。硝酸纖維素膜轉膜后,采用5%脫脂牛奶封閉1 h。加入一抗在4 ℃下孵育過夜。洗膜后,加入二抗在室溫下孵育2 h。滴加ECL發光液,在成像系統中采集圖像。

2 結 果

2.1兩組受試者全血中RPA3-AS1的表達 健康組和患者組全血中RPA3-AS1的相對表達水平分別為6.19±0.57和1.35±0.41,與健康組相比,患者組全血RPA3-AS1的表達水平顯著降低,差異有統計學意義(P<0.01)。見圖1。

注:與健康組相比,aP<0.01。

2.2兩組AC16細胞中RPA3-AS1的表達 健康組和患者組AC16細胞中RPA3-AS1相對表達水平分別為1.01±0.07和9.91±1.27,患者組RPA3-AS1相對表達水平顯著高于健康組,差異有統計學意義(P<0.01)。

2.3高表達RPA3-AS1抑制AC16細胞活力 MTT法結果顯示,從第2 天起,患者組AC16細胞活力顯著高于健康組,差異具有統計學意義(P<0.05)。見圖2。

注:與健康組相比,bP<0.05,aP<0.01。

2.4高表達RPA3-AS1抑制AC16細胞凋亡 流式細胞術顯示,轉染質粒48 h后,患者組和健康組AC16細胞凋亡率分別為(3.93±0.62)%和(10.76±1.48)%,與健康組相比,高表達RPA3-AS1顯著抑制AC16細胞的凋亡,差異具有統計學意義(P<0.01)。見圖3。

注:與健康組相比,aP<0.01。

2.5生物信息學方法預測RPA3-AS1的作用機制 采用生物信息學軟件starBase v2.0預測RPA3-AS1可配對結合miR-203a-3p。采用生物信息學軟件miRWalk 2.0和DIANA-microT預測miR-203a-3p可配對結合BAG3 mRNA。見圖4。

圖4 生物信息學方法預測RPA3-AS1的作用機制

2.6高表達RPA3-AS1的AC16細胞中miR-203a-3p和BAG3 mRNA的表達 qPCR結果顯示,患者組和健康組AC16細胞miR-203a-3p的相對表達水平分別為0.26±0.04和1.03±0.14,高表達RPA3-AS1可抑制miR-203a-3p的表達(P<0.01)。患者組和健康組AC16細胞BAG3mRNA的相對表達水平分別為4.59±0.56和1.03±0.08,miR-203a-3p表達水平降低后,BAG3 mRNA表達水平顯著升高,差異有統計學意義(P<0.01)。

2.7高表達RPA3-AS1促進BAG3蛋白表達 Western blot結果顯示,高表達RPA3-AS1的AC16細胞中,BAG3蛋白表達水平明顯升高,BAG3蛋白表達水平升高后,細胞中Bcl-2和p53蛋白表達水平升高,Bax和Caspase-8蛋白表達水平降低。見圖5。

圖5 Western blot法檢測BAG3蛋白及相關凋亡蛋白表達情況。

3 討 論

lncRNA是一種內源性的非編碼RNA,參與調控基因的轉錄和翻譯,影響細胞的各種生命進程[15-16]。越來越多的lncRNA如H19、AK139328、TUG1、KCNQ1OT1、MALAT1等被證實與心血管疾病的發生、發展密切相關,在心肌缺血再灌注損傷中發揮關鍵調控作用[17-20]。RPA3-AS1是近年來新發現的lncRNA,其作用機制尚未見報道。本研究中,通過檢測健康組和患者組全血標本發現,RPA3-AS1在患者組全血標本中的表達明顯低于健康組,表明其可能在心肌缺血中發揮重要作用,可能與心肌缺血再灌注損傷相關。臨床研究表明,心肌細胞凋亡可能是心肌缺血再灌注損傷發生的主要因素[21-22]。本研究結果表明,心肌細胞高表達RPA3-AS1后,心肌細胞的活力顯著增加,心肌細胞的凋亡率顯著降低,RPA3-AS1可增強心肌細胞活力并抑制其凋亡。

近年來研究發現,lncRNA主要通過以不完全互補配對的方式與微小RNA(miRNA)結合,抑制miRNA與靶基因mRNA的配對結合,在轉錄后水平促進miRNA靶基因的表達[23]。本研究通過生物信息學軟件starBase v2.0預測,RPA3-AS1可配對結合miR-203a-3p。miR-203a-3p可促進脂多糖誘導的心肌細胞凋亡和炎癥,沉默miR-203a-3p可下調心肌細胞凋亡蛋白的表達,降低心肌細胞的凋亡率[24]。本研究結果表明,高表達RPA3-AS1后,人心肌細胞中miR-203a-3p表達水平降低,RPA3-AS1可抑制miR-203a-3p的表達。本研究通過生物信息學軟件miRWalk 2.0和DIANA-microT預測,miR-203a-3p可配對結合Bcl-2相關抗凋亡蛋白3(BAG3)mRNA。BAG3蛋白是一種高度保守的熱休克蛋白70(HSP70)分子結合伴侶,屬于抗凋亡基因(BAG)家族蛋白,可在多個水平調控細胞的活性、凋亡、轉移等生理過程[25]。BAG3蛋白可抑制心肌細胞的凋亡,BAG3蛋白表達缺失與缺血再灌注心肌損傷密切相關[26]。本研究結果表明,miR-203a-3p表達降低后,人心肌細胞中BAG3基因表達顯著升高,表明miR-203a-3p可能發揮抑制BAG3基因表達的作用。Bcl-2和p53蛋白具有抑制細胞凋亡的作用,Bax和Caspase-8蛋白具有促進細胞凋亡的作用,因此,Bcl-2、p53、Bax和Caspase-8蛋白表達水平可反映細胞凋亡情況。本研究發現,高表達RPA3-AS1后,人心肌細胞中Bcl-2和p53蛋白表達升高,Bax和Caspase-8蛋白表達降低,提示RPA3-AS1可抑制心肌細胞的凋亡,從而可能預防和治療心肌缺血再灌注損傷。本課題組下一步將通過雙熒光素酶報告基因實驗證實RPA3-AS1與miR-203a-3p及miR-203a-3p與BAG3 mRNA之間的配對結合。

lncRNA RPA3-AS1可能通過調控miR-203a-3p/BAG3分子軸促進人心肌細胞的活性并抑制其凋亡。本研究首次揭示RPA3-AS1在人心肌缺血再灌注損傷中的作用及可能的作用機制,為RPA3-AS1的臨床應用提供了一定的實驗基礎。

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