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應用iTRAQ技術聯合PRM驗證技術篩選肝硬化患者急性腎損傷的早期預測生物標志物

2021-05-29 07:12:30王來亮周芳芳黃璐璐羅群
現代實用醫學 2021年4期
關鍵詞:差異水平

王來亮,周芳芳,黃璐璐,羅群

急性腎損傷(AKI)是肝硬化患者常見并發癥,發病率可高達20%[1]。肝硬化并發AKI患者住院時間長,多器官衰竭的風險高,30 d的病死率是未并發AKI患者的10倍[2]。肝硬化并發AKI至今尚無特效治療,早期預測并干預是改善該類患者預后的重要措施。腎功能評估的主要指標血肌酐(Scr)受影響因素多,依賴Scr診斷AKI既不敏感也不特異。定量蛋白質組學的迅速發展對發現AKI新型標志物和研究其發病機制有著重要意義。同位素標記相對和絕對定量技術(iTRAQ)是一種定量蛋白質組學的經典方法,具有定量較準確,全面分析中低豐度蛋白等優點,彌補了其他如基于雙向電泳難以檢測出低豐度、小分子量蛋白的不足。平行反應監測(PRM)是目前新型的靶向蛋白驗證手段,具有高分辨、抗干擾,重現性好,成本更低的特點,譜圖可直接檢索數據庫,與iTRAQ蛋白質組學技術聯合可同時完成生物標志物的發現和驗證。本研究應用iTRAQ技術篩選肝硬化并發AKI的早期差異表達蛋白,并通過PRM技術對靶向蛋白進行驗證,從而篩選出肝硬化并發AKI的早期預測新型生物標志物,現報道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料選取2018年1月至2019年12月在中國科學院大學寧波華美醫院住院的肝硬化患者90例,均符合年齡≥18歲,入院時未確診為AKI,但存在AKI高危因素,且取得患者知情同意。排除器質性腎臟病者,已接受透析治療者,擬行或已行肝腎移植者,伴有腫瘤者,確認懷孕,預期壽命不足3 d者,無法對患者或法定代理人進行知情告知者。根據是否并發AKI將患者分為AKI組(肝硬化并發AKI)和對照組(肝硬化未發生AKI)。

1.2 方法

1.2.1 收集臨床資料包括患者年齡、性別、體質量指數(BMI),合并癥(高血壓、糖尿病等),AKI高危因素情況(大量放腹水、消化道出血、感染/自發性腹膜炎、大量使用利尿劑及靜脈使用對比劑等[3]),入院出現AKI高危因素后第1、2天Scr水平。

1.2.2 iTRAQ技術篩選差異蛋白留取出現AKI高危因素后第1天尿液10ml,置于―80℃冰箱保存待檢。樣本預處理,提取總蛋白溶液,分裝后用iTRAQ分析,參考Bradford法進行蛋白濃度測定,蛋白還原烷基化及酶解處理成多肽,同位素標記肽段,應用LC-MS/MS技術,反相色譜分離及反向色譜-TripleTOF分析,結合數據庫檢索,獲得差異蛋白的鑒定列表和定量信息。差異蛋白篩選標準為濃度升高至對照組的1.5倍以上。

1.2.3 PRM驗證靶蛋白從上述iTRAQ篩選的差異蛋白中選擇豐度較高的靶蛋白,制備樣本的肽段混合物,根據靶蛋白的豐度情況,事先對樣本進行富集;根據挑選的靶肽段信息,進行預實驗,調整流出時間,或者重新挑選靶肽段;對正式樣本進行PRM檢測及數據分析。

1.3 統計方法采用Stata 12.0統計軟件進行分析。計量資料以均數±標準差表示,不同時間段比較采用方差分析,兩組比較采用t檢驗;計數資料比較采用2檢驗或Fisher確切檢驗。P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 一般情況11例(12.2%)患者在住院期間發生AKI,包括自發性腹膜炎5例,上消化道出血3例,大量放腹水1例,大量使用利尿劑1例,靜脈使用對比劑1例。AKI組男4例,女7例;年齡(62.1±14.7)歲;BMI(22±3.60)kg/m2;合并癥高血壓2例,糖尿病4例。對照組男44例,女35例;年齡(61.6±14.6)歲;BMI(23.54±4.09)kg/m2;合并癥高血壓17例,糖尿病20例。兩組上述差異均無統計學意義(均P>0.05)。

兩組在高危因素出現前和出現后第1天Scr水平差異均無統計學意義(均P>0.05),高危因素出現后第2天時差異有統計學意義(t=8.78,P<0.05)。AKI組在高危因素后出現第2天Scr水平較出現前明顯升高(P<0.05),見表1。

表1 兩組高危因素出現前、出現后第1天及第2天Scr水平比較 mol/L

2.2 差異蛋白篩選及驗證AKI組與對照組在高危因素出現后第1天尿液中共篩選出289個差異蛋白,其中上調蛋白64個,下調蛋白225個。在上調的差異蛋白中,AKI組谷氧還蛋白-1(GRX1)與S100鈣結合蛋白A7(S100A7)在高危因素出現后第1天分別升高至對照組的1.76倍及1.51倍。PRM技術驗證結果顯示,AKI組GRX1與S100A7水平分別升高至對照組的2.51及2.17倍,與iTRAQ技術篩選時的濃度變化趨勢一致。

3 討論

GRXs屬于硫氧還蛋白(TRX)家族,在細胞對氧化應激反應中發揮重要作用[4]。GRX1主要位于腎遠曲小管細胞頂部。Godoy等[5]發現,在缺血再灌注小鼠模型中,GRX1在小鼠尿液中特異性分泌增加。GRXs既可作為氧自由基的清道夫,也可作為抗凋亡分子和轉錄因子的氧化還原調節因子。抑制GRX1表達水平證明可以抑制凋亡信號調節激酶1的激酶活性。細胞實驗發現,缺血再灌注處理的細胞中若GRX1蛋白表達增加,細胞存活率和增殖率均高,且氧化損傷程度較輕[5]。

S100A7、S100A8和S100A9是S100鈣結合蛋白的成員,主要來源于中性粒細胞,也可由單核細胞、活化的巨噬細胞、樹突狀細胞和黏膜鱗狀上皮產生。S100鈣結合蛋白是先天免疫系統的激活因子。Tan等[6]發現,S100鈣結合蛋白通過激活TLR4/NLRP3炎癥小體途徑參與對比劑AKI的發生。Dessing等[7]發現S100鈣結合蛋白在缺血再灌注后巨噬細胞介導的腎臟修復中起關鍵作用。Kim等[8]發現,S100鈣結合蛋白水平在腎前性AKI中不升高,而在腎實質性AKI中升高。S100鈣結合蛋白水平升高可能提示發生腎實質性AKI時免疫反應和炎癥活動激活[8]。另有研究發現,S100A7表達水平升高與腎損傷程度平行[6]。因此,S100A7不僅是一種炎癥標志物,而且在炎癥性疾病的發病機制中發揮著關鍵作用。本研究發現,iTRAQ技術聯合PRM驗證技術篩選出的蛋白GRX1與S100A7在肝硬化并發AKI患者尿液中明顯升高,且早于Scr變化,可作為肝硬化患者并發AKI的早期預測新型生物標志物。

綜上所述,尿蛋白GRX1與S100A7在肝硬化患者AKI高危因素出現后Scr未明顯變化時已升高,可能是肝硬化并發AKI的早期預測新型生物標志物。但本研究樣本量相對較小,且篩選出的標志物未在新的肝硬化人群中進一步驗證,有待將來在大樣本中進一步驗證。

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