基于重測序數據的湖羊產羔數性狀全基因組關聯分析

謝銳，朱墨，童世鋒，趙福平，劉楊*

(1. 南京農業大學動物科技學院，江蘇 南京 210095； 2. 農業農村部都市農業重點實驗室，上海 200240；3. 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所，北京 100193)

繁殖性狀是羊的重要經濟性狀，繁殖性能的高低直接決定了整個養殖經濟效益的高低。如何提高羊產羔數一直是科學家們致力于研究解決的重要課題。提高母羊產羔數的前提是提高母羊的排卵數，而哺乳動物的排卵過程受到復雜的機制調控，而且不同品種羊之間還存在著顯著差異，如特塞爾綿羊和薩福克羊每個排卵周期只排1個卵，而高產的布魯拉美利奴羊每個排卵周期可以排10個卵[1]。除了國外的羊具有優秀繁殖性能外，我國本地綿羊品種湖羊也因具有“一年多胎，一胎多羔”的優秀繁殖性能而聞名世界。但影響湖羊產羔數的關鍵功能基因以及高繁殖力性狀的遺傳機理還有待進一步研究。

隨著二代基因組測序技術的快速發展，越來越多的研究利用基因組測序方法來尋找與羊繁殖性狀有關的候選基因，這為從基因組水平上研究目標經濟性狀提供了便利。全基因組關聯分析(GWAS)是在全基因組范圍內尋找與動植物重要經濟性狀相關聯的遺傳變異，是一種復雜性狀功能基因鑒定的分析策略[2]。GWAS概念是由Risch在1996年提出[3]，最早是被應用在醫學上研究復雜疾病的遺傳模式[4]。GWAS方法因具有速度快、通量高和高精度等顯著優點,其在畜牧學遺傳育種中的作用日益凸顯，目前已經成為挖掘與家畜重要經濟性狀相關候選基因最重要的方法之一[5]。……