基于質譜的蛋白質組學方法新進展

季美超，付 斌，張養軍

(軍事科學院軍事醫學研究院生命組學研究所，蛋白質組學國家重點實驗室，北京蛋白質組研究中心，國家蛋白質科學中心-北京，北京 102206)

20世紀90年代，隨著基因組學的迅速發展，人類基因組測序工作初步完成。2001年，人類基因組草圖正式發表[1]，標志著生命科學正式進入后基因組時代。人們逐漸意識到基于mRNA水平的研究并不能包含生命的全部信息，因此對于生命活動的直接執行者——蛋白質研究逐漸成為熱點。不同于傳統方法針對一種或者幾種蛋白質的研究，澳大利亞學者Williams等[2]于1994年首次提出“蛋白質組學”這一概念，即“從整體水平對特定時間或環境下細胞或組織內基因組所表達的全部蛋白質結構和功能進行研究”。蛋白質組學研究的對象動態且多變，與基因組學相比更加復雜。而隨著高通量蛋白質組分析技術及方法的發展，其已廣泛應用于生物、醫藥及病理研究等領域，逐漸成為驅動精準醫學發展的強勁動力。

蛋白質組研究主要包括3個方面：表達蛋白質組學、結構蛋白質組學和功能蛋白質組學[3]。其中，表達蛋白質組學是對細胞組織或個體的蛋白質表達譜分析以及其蛋白質組成含量和變化規律的檢測；結構蛋白質組學側重于亞細胞蛋白質組的分析，對于細胞組成及通路研究具有重要意義；功能蛋白質組學則是蛋白質組研究的最終目的，即闡明某功能相關蛋白質的活動規律以及蛋白質間相互作用的問題。……