李幗,曹蘇艷,錢婷婷,陸聲鏈,3
(1.廣西師范大學計算機科學與信息工程學院,廣西桂林,541004;2.上海市農業科學院農業科技信息研究所,上海市,201403;3.廣西多源信息挖掘與安全重點實驗室,廣西桂林,541004)
作物圖像分割是精準農業、植物表型的關鍵技術。實現自然條件下作物圖像的自動分割對農作物生長檢測、機器采摘、病蟲害識別等應用無疑具有重要意義。圖像分割算法已經有幾十年的研究歷史,常用的圖像分割方法包括顏色因子法、閥值分割法和基于機器學習的方法。顏色因子法最早由Woebbecke等[1]于1995年提出,此后經過多年的不斷完善改進,陸續形成了以EXG、EXR、EXB為代表的顏色因子算法。時至今日,國內外學者仍然還在不斷探索各種顏色因子在植物分割中的應用[2-5]。在基于閾值的圖像分割方法中,Ostu(又名最大類間差法)是最經典的方法之一,在植物圖像分割中也有較多研究。例如,Montalvo等[6]針對部分丟失綠色特征農田圖像,提出采用兩次Ostu方法實現農田圖像的分割,其分割準確率達到了91.8%;齊銳麗等[7]通過將圖像的RGB顏色空間轉換到HSV顏色空間,然后利用Ostu方法進行花椒圖像的分割。近年來,基于機器學習方法的圖像分割得到越來越多的研究。Dhanachandra等[8]采用K-means聚類算法進行自然條件下室外植物圖像的分割,他們為了保證K-means聚類算法的初始聚類中心最優,提出了采用減法聚類獲取初始聚類中心,結果發現這種處理比直接采用K-means算法好;黃巧義等[9]綜合利用RGB、CIE L*a*b*、HSV等多色彩空間和支持向量機(SVM)進行水稻圖像分割,獲得了不超過4%的分割誤差。杜娟將模板匹配算法和K-means聚類算法相結合用于從大田油菜圖像中提取油菜花[10],該方法具有高效、快速的優點;Singh則基于粒子群算法開發了一種用于向日葵葉圖像分割和分類的系統[11]。最近幾年來,隨著深度學習技術的廣泛應用,也涌現出了一批利用深度神經網絡進行植物圖像分割的研究報道[12-13]。但深度學習方法需要大量的數據標注工作,如何標注數據、需要多少訓練數據尚缺乏統一的標準,往往依賴于經驗,且其模型的內部運行機理仍然缺乏可解釋性。
盡管圖像分割技術已有多年歷史,但至今仍沒有一個通用的分割方法,通常需要針對特定應用選擇合適的算法。本研究結合EXG超綠分割和GrabCut算法的優缺點提出了改進的算法,并對不同生長時期和不同光照條件下黃瓜圖像進行試驗,以便為作物表型自動測量、作物冠層功能計算等應用提供方便易用的核心算法。
1995年,Woebbecke等[1]發現了在一般情況下,針對綠色植物圖像的處理時,將綠色通道的權重增強,就可以提高土壤等背景環境與植物之間的對比度,從而借助這一個特征就可以完成綠色作物的精準分割。基于這個特性,只需要把綠色作物圖像中的每一個像素點,通過對其進行2G-R-B的轉換操作,就能夠將屬于前景的綠色作物與非綠色的背景分割出來,這就是EXG超綠分割算法。EXG超綠算法的分割過程如圖1所示,在識別目標作物圖像之前需要先對圖像進行灰度化處理,然后采用最大類間方差法對灰度化圖像進行分割。

圖1 EXG超綠算法分割過程
1.1.1 灰度化因子
對于要進行分割的原圖像來說,作物與背景在R、G、B三個顏色分量上的值有著不同的特征。使用不同的色彩特征組合值來對圖像中的像素點進行轉換就可以增強作物與背景的顏色對比度,這樣轉化后的圖像則是原圖像的灰度圖像,灰度化因子就是三種色彩特征的不同組合。在RGB模型中,R代表著像素的紅色分量,G代表著像素的綠色分量,B代表著像素的藍色分量。在EXG超綠特征分割里使用的灰度化因子是綠色因子,經過綠色因子灰度化的圖像增強了綠色通道的權重,使得圖像里的綠色作物與背景有了更強的對比度。綠色因子灰度化采用式(1)計算[1]。
EXG=2G-R-B
(1)
1.1.2 最大類間方差法
將經過灰度化因子處理過的彩色圖像轉化成了灰度圖像,在灰度圖像中綠色作物與背景的灰度值差距較大,此時就可以使用閾值分割法對圖像進行分割。最大類間方差法不需要人工選擇閾值,它的計算過程簡單、穩定且用時少。確定合適的閾值后,通過把圖像中的像素點與這個閾值比較,就能夠區別出前景與背景。
最大類間方差法的基本原理是:對于一幅大小為X×Y的圖像,前景與背景之間的分割閾值為T,圖像的總平均灰度值為G。前景像素點是灰度值大于閾值T的像素點,記為N1;前景像素點數與圖像總像素點數的比例記為W1;前景像素點的平均灰度值記作G1。背景像素點是灰度值小于閾值T的像素點,記為N2;背景像素點數與圖像總像素點數的比例記為W2;背景像素點的平均灰度值記作G2。前景部分和背景部分之間的方差記作M[14],使得方差M取到最大值的灰度值T就是最佳分割閾值。
(2)
(3)
N1+N2=X×Y
(4)
W1+W2=1
(5)
G=G1×W1+G2×W2
(6)
M=W1×(G-G1)2+W2×(G-G2)2
(7)
M=W1×W2×(G1-G2)2
(8)
1.1.3 EXG超綠分割算法在作物圖像分割上的效果
將EXG超綠分割應用于作物圖像分割,就是使用綠色因子將彩色圖像灰度化,轉化成為灰度圖像,再使用最大類間方差法確定最佳分割閾值來進行閾值分割,實現作物與背景的分割。如圖2所示為該方法用于分割黃瓜植株圖像的效果。可以看到,采用超綠因子來提取綠色作物圖像的效果比較好,雜草、土壤等其他非綠色的背景都能夠很好區分,綠色作物的圖像可以突出顯示出來。而其缺點是如果背景中含有綠色的成分則很容易錯分,誤把背景中綠色的地方認為是前景的綠色作物,造成分割誤差。

(a)原圖
GrabCut算法是在2004年由微軟英國研究院的Carsten Rother等設計[15],它是基于Graph Cuts改進而來的一種圖像分割算法,相當于是對Graph Cuts的多次迭代版本。該算法只需要手動對圖像里的前景區域進行標注,通過圖像處理算法可以實現良好的圖像分割效果。GrabCut以其交互簡單、分割精度高的特點,被廣泛應用在計算機視覺處理的圖像分割領域[16-17]。
1.2.1 算法原理
GrabCut的實現過程如圖3所示,用戶首先通過選擇一個矩形來創建一個初始的分割區域,矩形內的像素標記為未知像素,被框在外面的像素點標記為背景;接著生成一個初始的圖像分割結果,所有未知像素都暫定放置在前景類中,并且所有已知的背景像素都放置在背景類中;接下來分別為初始前景和背景類別進行高斯混合模型(GMM)建模,前景類中的每個像素都分配給可能是前景GMM中的高斯分量。同樣,背景中的每個像素都分配給可能是背景中的高斯分量。然后再通過迭代能量最小化分割算法進行最小化分割的迭代,每次迭代都會使前面可能前景和可能背景的GMM的參數更優,從而獲得更加準確的前景和背景區域。

圖3 GrabCut算法分割過程
1.2.2 GrabCut算法在作物圖像分割上的效果
GrabCut是一個非常好用的圖像分割算法。對于前景和背景完全分開的圖像,僅需要用戶手動對前景區域進行簡單的矩形標注,GrabCut即可穩健地分割出圖像中的前景和背景。如圖4所示為該算法在黃瓜植株圖像上的分割效果。

(a)經框選后的結果圖
從圖中可以看出,該算法能夠較好地把較為單一的背景分割掉,而對于靠近綠色植物的那部分背景,包括栽培盆和盆內的土壤,則需要經過多次迭代分割后才能去除大部分。試驗中也發現,經過多次迭代后,依然有部分土壤背景殘留在分割圖像中。這也是該算法的不足之一,即對于前景與背景顏色相近或者背景與前景相互交錯的圖像,它就會把背景識別為前景一并輸出。同時,該算法需要用戶手工勾選才可以進行下一步的操作,自動化程度相比于其他算法比較弱。
通過對EXG超綠分割和GrabCut算法優缺點的分析,以及對圖像特點的分析。EXG超綠分割難以較好的將綠色背景去除,而GrabCut算法不方便去除黑色布背景和花盆土壤等,所以本文將EXG超綠分割和GrabCut算法進行了結合改進,改進后的算法不再需要手工標記。為便于敘述,下文將我們改進的算法稱為Combined算法。
Combined算法的主要思想是,通過預設的矩形框參數實現待分割圖像目標區域的自動框選,并將矩形框內的部分作為前景、矩形框外部作為背景輸入GrabCut算法進行初步分割,然后再用EXG超綠分割算法對初步分割得到的圖像進行進一步處理,得到最終的分割結果。Combined算法的分割過程如圖5所示,圖6為Combined算法分割效果圖。從圖中可以看出,經過第一步GrabCut分割后,此時還未能夠將目標植物與背景完全分割開,再經過超綠分割,可以很好地將植物與花盆土壤等背景分開提取出來,獲得更好的分割結果。由于在采集圖像時是通過固定角度拍攝植物,圖像中目標所處的位置相對固定,可以認為圖像邊緣區域為背景,圖像中間部分為前景,因此我們的算法中,預設原始圖像邊緣的20個像素為背景,內部的區域就是前景所在的矩形框。當然也可以根據實際需要調整預設矩形框的大小,理論上,預設的矩形框越小,處理速度越快;但矩形框太小有可能把部分目標區域劃分為背景,從而影響分割精度。

圖5 改進的Combined算法分割過程

(a)原圖
為了更好地驗證本文提出的改進算法的有效性,采用早、中、晚三個不同生長時期的室內黃瓜群體圖像,以及室外晴天和陰天兩種不同光照條件黃瓜群體圖像進行圖像分割試驗。
本文試驗所采用的黃瓜品種為迷你黃瓜,在上海市農業科學院的試驗基地進行,分別在溫室和室外大田種植了兩批,時間為2019年秋季。為了獲取黃瓜整個生長過程的圖像,在以上兩個地點中均選取了一個小區并在小區頂部安裝了網絡相機,從苗期開始至黃瓜結果,每天按上午、中午、下午各一張的頻率從固定角度拍攝黃瓜群體的圖像。為了便于說明問題,本文將黃瓜生長過程粗略分為早、中、晚三個時期,在溫室中每個生長時期各隨機選取了6張圖像,在室外大田圖像中,選取了晴天和陰天條件下拍攝的圖像各3張,共24張圖像。為了方便描述,對每張圖像進行了編號。早期的六張圖像表示為E1、E2、E3、E4、E5、E6;中期的六張圖像表示為M1、M2、M3、M4、M5、M6;晚期的六張圖像表示為L1、L2、L3、L4、L5、L6;晴天的三張圖像表示為S1、S2、S3;陰天的三張圖像表示為O1、O2、O3。
上述幾種圖像分割算法,包括本文改進的算法均使用Python 語言結合OpenCV圖像處理庫編碼實現,試驗環境如下:操作系統Windows 10家庭版,CUP處理器為Intel(R)Pentium(R)CPU N3710 @ 1.60 GHz,內存(RAM)4.00 GB。為對各種分割算法的分割質量進行定量比較,本文以像素為基礎,通過像素級別的對比來評價分割的有效性,分別計算出手工分割圖像中目標區域的像素個數和各個算法分割圖像中目標區域的像素個數,使用精度(ACC)來驗證算法的分割精準度。
式中:f0——算法分割圖像中目標區域的像素與手工分割圖像中目標區域的像素交集;
f——算法分割圖像中目標區域的像素。
對玻璃溫室中獲取的黃瓜早、中、晚不同生長時期獲取的三組圖像,分別采用EXG超綠分割算法、GrabCut算法和本文改進的Combined算法進行了試驗,圖7~圖9為分割效果,分割精度和運行時間的對比如表1和表2所示。
從圖7~圖9可以看出,EXG超綠分割沒有將背景分割干凈,GrabCut對于葉片邊緣的細節部分處理的不夠好,還有部分土壤殘留,而Combined算法能夠比較干凈完整的分割出植株圖像。

(a)原圖

(a)原圖

(a)原圖
在精度上,從表1可以看出,本文的改進算法Combined的平均分割精度達到了96.56%,高于EXG超綠分割的84.89%和GrabCut算法的91.69%,表明本文改進的算法在分割精度上相比前述兩種經典算法有較大的提高。從表1中還可以看出,Combined算法對于早期圖像的分割效果明顯優于其他兩種算法,對中期和晚期的黃瓜圖像而言,分割效果的差距較小,而EXG超綠分割和GrabCut算法分割的精確度隨著黃瓜植株的長大而提高,經過分析發現是因為圖像中所含的綠色葉片面積越大,這兩種算法的分割精度就會越高。本文改進的Combined算法的分割精度則不會因為黃瓜植株的生長發生大的變化,說明了該算法具有更好的魯棒性。

表1 三個算法的分割精度
由于算法的運行時間受試驗環境的影響,本文在采集算法運行時間時是在同一設備的試驗環境下進行的,對比結果如表2所示。從表2可以看出,Combined算法運行時間平均稍長于EXG超綠分割和GrabCut算法的平均時間,這也是此算法尚存在的不足之處。從表2中也可以看到,Combined算法和GrabCut算法在個別圖像上的處理時間特別長,而且Combined算法和GrabCut算法的運行時間波動較大。在試驗過程中發現矩形框參數的值對運行時間的影響比較大,研究發現矩形框數值設置的越小,運行的時間就越少且同一個時期內的圖像分割所需運行時間值的波動越小。此外對于個別圖像運行時間特別長的原因作了推測,可能是因為圖像在采集過程中的光照情況略有不同,導致個別圖像在處理時需要花費較多的時間。這也是該改進算法的不足之處,運行效率有待提升。

表2 三個算法的運行時間比較
為了測試以上算法對不同光照條件獲取圖像的影響,本文還選取了室外晴天和陰天情況下采集的圖像各三張進行分割試驗,結果如圖10和圖11所示,而表3為上述三種分割算法的分割精度對比結果,其中本文改進的Combined算法的平均分割精度達到了96.59%,稍為優于EXG超綠分割的95.4%和GrabCut算法的94.75%。即在強光照與弱光照的情況下,Combined算法的分割精度均高于其他兩種算法。從該試驗中也可以看出,EXG超綠分割和GrabCut算法在室外自然條件下獲取的黃瓜群體圖像上的分割效果明顯好于日光溫室內獲取的圖像,說明這兩種算法受光照影響較大,其魯棒性不如本文改進的算法。

(a)原圖

(a)原圖

表3 室外自然條件下的圖像分割精度
同時,從圖10、圖11這兩組圖像中也可以發現,在晴天光照過強的情況下,EXG和Combined算法會產生過分割的現象,導致部分葉片的像素缺失,但總體分割精度仍然優于CrabCut算法;而對于陰天光照條件下的圖像,上述三種算法的分割效果相當。
本文試驗所用到的黃瓜植株圖像來自于溫室和室外大田,包含了黃瓜早、中、晚三個不同生長時期,以及室外晴天和陰天兩種不同光照條件。本文以OpenCV庫結合Python語言研究了EXG超綠分割和GrabCut兩種圖像分割算法并針對分割效果提出了改進算法,由試驗的分析結果可以看出,本文改進的算法Combined具有更好的分割效果。
1)分析研究了EXG超綠分割和GrabCut兩種分割算法,基于其在黃瓜群體圖像上的分割試驗結果分析了兩種算法的優點與不足。
2)針對黃瓜植株圖像的準確、自動、快速分割的需要,提出了一種改進的算法。
3)為了驗證本文改進算法的有效性,對溫室內不同生長時期和室外不同光照條件下的黃瓜植株圖像進行了試驗驗證。試驗結果顯示,本文提出的改進算法在室內不同生長時期的黃瓜群體圖像上平均分割精度達到了96.56%,在室外自然條件下圖像上的平均分割精度達到了96.59%,均優于EXG超綠分割和GrabCut算法,且在黃瓜不同生長時期和不同光照條件下的分割精度差異不大,表明該改進算法具有更好的魯棒性。