新冠病毒或與“近親”差異更大并有兩亞型

中科院上海巴斯德研究所和北京大學等機構的研究人員，合作分析了新冠病毒的起源與持續演化。研究發現，雖然基因組分析表明，新冠病毒最接近云南中菊頭蝠攜帶的RaTG13，但它們在中性位點上的差異遠高于此前的認識，而且新冠病毒分化出了兩個亞型。相關論文刊登于《國家科學評論》。

研究人員調查了新冠病毒和其他相關冠狀病毒的分子差異程度。結果發現，雖然新冠病毒和蝙蝠SARS 相關冠狀病毒（RaTG13）之間的基因組核苷酸只有4%的變異，但兩者中性位點的差異為17%，表明這兩種病毒之間的差異比之前估計的要大得多。

該研究結果表明，新冠病毒和穿山甲SARS 冠狀病毒突刺蛋白的受體結合域功能位點之所以出現新變異，除了重組外，還可能是由突變和自然選擇引起的。

研究人員還對103 個新冠病毒基因組進行了群體遺傳分析。研究人員發現這些病毒株已發生了149 個突變點，而且大多數衍生突變是單基因突變，這表明它們要么是最近發生的，要么是種群增長的結果。

此外，新冠病毒可能進化成了兩種主要亞型——L 型和S 型，這兩種類型由兩個不同的單核苷酸多態性（SNP）明確定義，這表明到目前為止已測序的病毒株之間幾乎完全有聯系。

雖然L 型（占比約70%）比S 型（約30%）更普遍，但是研究人員發現S 型是原始版本。雖然L 型在武漢新冠肺炎暴發的早期階段更為流行，但在2020 年1 月初之后，L 型的出現頻率有所下降。

研究人員猜測，人類的干預可能對L 型施加了更嚴重的選擇壓力，因為L 型可能更具侵略性、傳播速度更快。另一方面，S 型的進化時間更長、攻擊性更弱，可能由于受到的選擇壓力相對較弱而增加了相對出現頻率。

專家認為，這些發現表明，有必要對新冠病毒感染者的臨床癥狀、基因組數據、流行病學數據等進行進一步的、即時的、全面的研究。