王琳 楊曉勤 陳云

[摘 要] 為了改進水稻葉片蛋白的雙向電泳分離方法,采用雙向電泳法分離水稻葉片蛋白,比較和分析了兩種上樣量對實驗的影響。改進的上樣量靈敏度高,分離條帶多且清晰,表明改進的實驗方法可以得到更為靈敏、清晰的圖譜,能更好地適應和促進實驗教學工作。
[關鍵詞] 實驗教學;改進;雙向電泳;葉片
[中圖分類號] Q503? ? ?[文獻標識碼] A? ? [文章編號] 1674-9324(2020)41-0383-02? ? [收稿日期] 2020-04-02
目前,雙向電泳技術是研究蛋白組學十分重要的技術手段,特別是以固相pH梯度等電聚焦為第一向的雙向電泳技術是當前分辨率最高,信息量最大的電泳技術。它具有結果直觀,分辨率較高,信息量大,技術成熟等優點,因此,此實驗也成為本科生生物化學實驗中的基礎性實驗,是生物化學實驗教學的重要內容。
在雙向電泳中,上樣量大小取決于樣品中蛋白質的種類、數目、檢測方法的靈敏度及膠條的pH梯度范圍和長度。不同樣品中蛋白的種類、數目有一定差異,所以在檢測方法相同,一向IPG膠條pH梯度范圍和長度相同的條件下,不同樣品的蛋白上樣量有差異。為了獲得一個分辨效果好和重復性好的雙向電泳圖譜,得到質量高的水稻葉片蛋白電泳分離效果,找出合適的蛋白上樣量很重要。作者在使用雙向雙向分離水稻葉片蛋白實驗的傳統方法時發現,根據原來的蛋白上樣量分離的蛋白斑點較少且模糊。為了提高水稻葉片蛋白的電泳分離效果,本文對此進行了探討。
一、方法
(一)常規實驗方法
首先采用三氯乙酸-丙酮法提取水稻葉片蛋白。將葉片研磨至葉片成粉末狀,加入溶液A(10%三氯乙酸(TCA)和0.07%β-巰基乙醇的預冷丙酮溶07%β-巰基乙醇的冰預冷丙酮溶液)懸浮沉淀。4℃,11000rpm離心15min,棄上清,重復兩次,將最終得到的沉淀真空冷凍干燥,然后用Bradford法測定蛋白質含量,最后通過雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳分離水稻葉片蛋白。稱取一定量的水稻葉片凍干樣品,溶于裂解液中(7mol/L尿素,2mol/L硫脲,4%CHAPS,2%IPG buffer 4-7,1%DTT),樣品超聲波處理五次,每次3-5s,間隔3s,于冰水中裂解30min,14000rpm離心20min,取上清,再離心,取上清,以充分去除雜質,獲得的蛋白樣品除少量用作濃度測定外,其余進行分裝,于-80℃保存。每次用之前,將分裝的蛋白樣品取出,室溫下解凍,根據所需總的蛋白質質量取一定體積的蛋白樣品,分別加入相應水化液(7mol/L尿素,2mol/L硫脲,2%CHAPS,0.4%DTT,0.5%IPG buffer pH4-7或pH3-10),終體積為350μL,再加入微量溴酚藍振蕩混勻,2000rpm離心1min,將含樣品的水化液均勻地加到水化盤中。第一向等電聚焦時,取pH4-7L,18cm干膠條,去掉保護膜,準備水化。把干膠條膠面朝下置于水化盤中水化,加入IPG覆蓋液使整個IPG strip被覆蓋。水化時間為10-12小時,溫度20℃。取出水化好的膠條,膠面朝上置于持膠槽中,膠條正負極與持膠槽正負極要一致,并使膠條與持膠槽兩端電極充分接觸,加適量IPG覆蓋液覆蓋整個IPG strip。水化前把樣品液加入水化液中。再根據合適的電泳參數進行等電聚焦。等電聚焦結束后,取出膠條,加入平衡液A(6mol/L尿素,0.05mol/LTris-HCI,2%SDS,30%甘油,0.1%DTT,0.002%溴酚藍)振蕩平衡15 min,再換平衡液B(6 mol/L尿素,0.5mol/L Tris-HCl,2%SDS,30%甘油,0.4%碘乙酰胺,0.002%溴酚藍)振蕩平衡15 min,取出膠條輕輕潤洗,并去除多余的平衡液,準備第二向電泳。采用分離膠濃度為12.5%的連續SDS-PAGE垂直平板電泳。將已平衡好的第一向膠條置于第二向凝膠的上方,排除氣泡,使二者緊密接觸。用1%瓊脂糖凝膠封固膠條,接通電源,以15℃循環水浴冷卻。15mA/塊膠恒流電泳30min,待溴酚藍前沿移至分離膠中后,再增大電流至30mA/塊膠,待溴酚藍前沿距凝膠板底0.5-1cm處,終止電泳。電泳結束后,將凝膠浸泡于固定液(40%無水乙醇,10%冰乙酸)中固定30min或過夜,倒去固定液,以雙蒸水洗4次,每次15min,然后在染色液(0.12% CBB G-250,10% ammonium sulfate,10% phosphoric acid and 20% methanol)中染色3~4小時,用蒸餾水漂洗數次,再用脫色液脫色30min,然后用蒸餾水漂洗數次直至背景顏色淺淡,蛋白質點清晰即可,掃描儀掃描膠圖。具體方法參照王[5]等。
(二)實驗方法的改進
常規的實驗方法中的蛋白質樣品上樣量為100ug。改進的實驗方法中蛋白質樣品上樣量為150ug。
二、結果與分析
本實驗比較了100μg和150μg兩個上樣量的雙向電泳分離水稻葉片蛋白效果,圖1(a)上樣量為100μg,圖1(b)上樣量為150μg,雖然圖1(a)的背景較淺,但蛋白斑點明顯少于圖1(b),很多低豐度蛋白在圖1(a)中無法檢測到,而圖1(b)中蛋白斑點相對較多,圖1(a)中清晰的蛋白斑點在圖1(b)中進一步加深,有些圖1(a)中檢測不到的點在圖1(b)中檢測到了。因此150μg的上樣量比100μg的上樣量更適合水稻葉片蛋白的雙向電泳分離。
三、討論
上樣量大小對雙向電泳總的蛋白質的覆蓋率有很大的影響。控制好上樣量,可以得到令人滿意的雙向電泳圖譜,提高重復性,并有利于后續的進一步分析。上樣量太小會造成蛋白點稀少,上樣量太大會造成一向等電聚焦時電流太大,使得第一向電泳無法達到最佳分離效果;第二向電泳中出現嚴重拖尾等現象,對結果分析有很大影響。改進的上樣量更有利于獲得蛋白數量多、背景清楚、靈敏度高的凝膠圖像,更適合雙向電泳分離水稻葉片蛋白的實驗教學。
四、結論
本實驗方法克服了雙向電泳分離水稻葉片蛋白傳統方法的一些不足,如用100ug的上樣量改進為150ug的上樣量,得到了更為靈敏、清晰的實驗結果,更好地適應和促進實驗教學工作,也有利于其他老師從中得到啟發。
參考文獻
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