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豬場生物安全疾病檢測方法探討

2020-05-11 06:56:06呂莫然
豬業(yè)科學 2020年4期
關鍵詞:生物檢測方法

呂莫然,劉 爵

(1.北京農(nóng)學院,北京 昌平 102206;2.北京農(nóng)林科學院,北京 海淀 100097)

隨著非洲豬瘟的暴發(fā)和生物技術的不斷發(fā)展,養(yǎng)殖業(yè)的生物安全問題愈發(fā)突出。養(yǎng)殖場在建設時,要特別注意所選的建設場地,規(guī)劃好合理的豬場結構和布局,完善配套的設施設備并注意及時改進,要有合理的生物安全體系,工作人員也要嚴格執(zhí)行生物安全制度,進出豬場要嚴格消毒,對病豬死豬的處理也要按國家相關規(guī)定,進行無害化處理[1]。生物安全按方法實施的對象,可以分為外部防御和內(nèi)部控制。外部生物安全防御主要是對養(yǎng)殖場的外來病原體進行控制,防止其進入,主要措施是加強外來人員的清洗消毒;內(nèi)部生物安全是對養(yǎng)殖場內(nèi)的病原體進行控制,防止其在養(yǎng)殖場內(nèi)傳播[2]。因此,及時發(fā)現(xiàn)養(yǎng)殖場內(nèi)的病原體對內(nèi)部生物安全的管理具有重要作用。目前實驗室最常用的檢測方法是PCR檢測,此項研究通過實際操作實驗中對臨床樣本流行性疾病豬圓環(huán)病毒3型的檢測以及檢測方法的優(yōu)化來建立和完善生物安全體系進行建議指導。

1 材料與方法

1.1 材料

所用毒株以及臨床樣品均保存在實驗室;病毒基因組DNA提取試劑盒購自Qiagen生物技術公司;PCR反應試劑購自天根生化科技(北京)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 病毒和臨床樣品的DNA提取

實驗前先將水浴鍋預熱至56℃,緩沖液AL和ATL如果有沉淀要重新溶解,分別在緩沖液AW1和AW2中加入適量96%~100%的無水乙醇使之達到工作濃度。將樣品粉碎在2 ml離心管中使用200 μl的PBS渦旋混合,加入20 μl的蛋白酶K,振蕩混勻。混合200 μl AL緩沖液,震蕩混勻之后放入預先加熱好的56 ℃ 水浴鍋中,溫水浴10 min。向離心管中加入200 μl無水乙醇,振蕩混勻。將上述液體用移液槍轉(zhuǎn)移到DNeasy mini濾柱中,靜止1 min,至少8 000hg離心大約1 min,棄去濾出液。將濾柱重新放入新的2 ml離心管,加入500 μl的緩沖液AW1混勻,8 000hg離心 1 min,棄去濾出液。將濾柱置于新的2 ml離心管,加入 500 μl的緩沖液AW2混勻,靜止1 min,至少20 000hg離心大約3 min,棄去濾出液。將濾柱重新放入新的 2 ml離心管或1.5 ml離心管,在濾柱中間加入200 μl核酸酶的水,室溫靜置一會兒,6 000hg離心2 min。

1.2.2 引物的設計與合成

根據(jù)PCV 3全序列(MF155643.1),借助生物工具軟件Primier 5在引物設計原則的基礎上,設計兩種進行普通PCR的特異性引物并送公司進行合成。其序列為:

P1:5? -GTTACCCAACTGTG CCCATCTATG-3’;

P2:5? -GTCACGCACAATTT CTCTCTCGG-3’。

1.2.3 實驗室臨床樣品的檢測

根據(jù)優(yōu)化后的檢測方法,對實驗室臨床樣品進行檢測,此過程根據(jù)試劑盒提供的說明書進行實驗操作,PCR擴增檢測實驗采用25 μL反應體系,加入PCR mix 2.5 μL,forward primer(10 mmol/L) 12.5 μL,reverse primer(10 mmol/l) 0.1 μL,DNA 模板 0.1 μL,ddH2O 添加至25 μL。通過1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增反應產(chǎn)物。電泳緩沖液為1xTAE,電壓為220 V,反應時間為10 min。使用紫外線照相儀對結果進行記錄。

2 結果

2.1 PCV3 PCR反應條件優(yōu)化結果

經(jīng)過對擴增各參數(shù)多次的優(yōu)化,對實驗設計的引物進行特異性檢測,結果如圖1所示,只有特定檢測的病毒有條帶,表明病原體檢測的方法具有高度特異性。

M:DL 2000 Maker;1:豬圓環(huán)病毒3型(Porcine circovirus type 3,PCV3)2:豬流感病毒(Swine influenza virus,SIV)3:豬偽狂犬病病毒(Pseudorabies virus, PRV)4:豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)5:豬流行腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)6:豬細小病毒(porcine parvovirus,PPV)7:豬 瘟 病 毒(Classical swine fever virus,CSFV)8:豬圓環(huán)病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)9:豬圓環(huán)病毒1型(Porcine circovirus type 1,PCV1)

2.2 臨床病料檢測的結果

利用優(yōu)化好的聚合酶鏈式反應(PCR)檢測方法,將實驗室2018年之前和2019年在各省豬場收集的病料進行檢測。樣本包括心、肝、脾、肺、腎等臟器和支氣管淋巴結、腸系淋巴結、腹股溝淋巴結、肺淋巴結等。檢測結果可以反映豬場內(nèi)部生物安全的管理效果,如表1所示。

3 討論

近年來,隨著流行性疾病的頻繁暴發(fā),豬場生物安全的內(nèi)部控制變得愈發(fā)重要。一些傳染病由于沒有及時被檢測出來,在豬群中快速傳播,給養(yǎng)豬業(yè)帶來了巨大的經(jīng)濟損失。因此建立靈敏特異的檢測方法對完善生物安全體系具有重要作用。

圖1 設計引物的特異性實驗

表1 臨床病料的檢測結果

此次用于指導生物安全生產(chǎn)的是豬圓環(huán)病毒的一種基因型,豬感染后會引起斷奶后多系統(tǒng)衰竭綜合征、腎病、皮膚及內(nèi)臟的炎癥反應。感染母豬難以受孕,流產(chǎn)率上升,還會生產(chǎn)出弱胎、死胎、畸形胎甚至木乃伊胎。豬圓環(huán)病毒3型常常與豬圓環(huán)病毒2型、豬瘟病毒、偽狂犬病病毒等形成混合或繼發(fā)感染,僅僅根據(jù)臨床癥狀和病理變化難以做出正確的判斷。而電鏡觀察最直接,也最常規(guī),是將病豬的組織制成切片在電鏡下觀察,但這種方法步驟繁瑣,需要大量的時間和精力。原位雜交技術檢測是使用探針與組織、細胞或染色體上待測單鏈DNA或RNA形成專一的核酸雜交分子,再經(jīng)特殊方法檢測出來;但目前這種方法在國內(nèi)應用于檢測豬圓環(huán)病毒不多見,操作也較為復雜,特異性不高。新興起的LAMP(環(huán)介導恒溫擴增技術)是指在設計好引物之后,在恒溫水浴鍋內(nèi)進行基因的擴增,花費時間短,也無需特殊實驗儀器,靈敏度比PCR也高,但在實際操作中,容易被氣溶膠污染產(chǎn)生假陽性。ELISA檢測方法是利用抗原或抗體的相互作用與酶進行連接,再與底物作用[3-6];該種方法特異性和敏感性都比較高,缺點是檢測過程中需要精密儀器(酶標儀),除此之外,使用該方法檢測的試劑盒價格較高。IFA(間接免疫熒光)和IPMA(免疫過氧化物酶單層細胞實驗)兩種檢測方法相似,主要區(qū)別是最后的觀察,IFA依靠熒光觀察,IPMA依靠酶進行顯色反應觀察。兩者都需要精密的儀器,而且,IFA實驗結果存在非特異性染色。綜合來說,實驗室大多數(shù)檢測操作復雜,花費時間較長,專業(yè)性要求較高。PCR(聚合酶鏈反應)因其操作簡便成為實驗室應用最廣泛的檢測方法,實驗需要設計出特異性較高的引物,以堿基互補配對為原則,在模板和引物的指導下,通過DNA聚合酶擴增出新鏈。

在對豬場內(nèi)部進行生物安全管理時,要嚴格執(zhí)行消毒制度,加強管理;科學飼養(yǎng),提高豬群免疫力,加強保健意識。及時對豬群進行疾病檢測,減少病毒感染擴散[7]。

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