新方法可鑒定植物表型 變化背后遺傳變異

近日，德國馬普學(xué)會發(fā)育生物學(xué)研究所Detlef Weigel研究團(tuán)隊(duì)，通過不使用完整基因組實(shí)現(xiàn)對植物表型變化背后遺傳變異的鑒定。

研究人員重新分析了擬南芥、番茄和玉米種群中的2000個性狀。用k-mers鑒定的關(guān)聯(lián)概括了用SNP發(fā)現(xiàn)的關(guān)聯(lián)，但具有更強(qiáng)的統(tǒng)計(jì)學(xué)支撐。重要的是，他們發(fā)現(xiàn)了與結(jié)構(gòu)變異和參考基因組缺失區(qū)域的新關(guān)聯(lián)。這些結(jié)果證明了在將序列讀數(shù)聯(lián)系到特定基因組區(qū)域之前執(zhí)行GWAS的效力，這使得可以檢測到影響表型變化的大量遺傳變異。

據(jù)《科學(xué)網(wǎng)》