小擬南芥MKK基因家族全基因組鑒定及進化和表達分析

李曉翠，康凱程，黃先忠，范永斌，宋苗苗，黃韻杰，丁佳佳

研究報告

小擬南芥MKK基因家族全基因組鑒定及進化和表達分析

李曉翠1，康凱程1，黃先忠2,3，范永斌1，宋苗苗1，黃韻杰1，丁佳佳1

1. 石河子大學生命科學學院，植物基因組學實驗室，石河子 832003 2. 安徽科技學院農學院，鳳陽 233100 3. 石河子大學生命科學學院，石河子 832003

絲裂原活化蛋白激酶激酶(mitogen-activated protein kinase kinase, MAPKK或MKK)是絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)級聯的重要組成部分，在植物的生長發育和脅迫應答過程中發揮重要作用。目前，已在多種植物中鑒定了MKK基因家族，但在十字花科植物小擬南芥()中MKK基因家族的系統鑒定與分析尚未見報道。為了探索小擬南芥MKK基因家族的進化和功能，本研究通過全基因組分析鑒定了小擬南芥中16個基因，散布于小擬南芥的10條染色體上。基于系統發育分析和多重序列比對，將這些基因分為5個亞族：A亞族(5個)、B亞族(2個)、C亞族(4個)、D亞族(3個)和E亞族(2個)。分子進化和共線性分析表明小擬南芥中存在7對復制基因，分別是/、/、/、/、/、/和/，其中/在復制事件之后發生了加速進化。結合啟動子區的順式元件分布和在成熟葉片、莖、花和果實以及鹽脅迫下的表達模式，結果發現復制基因的表達具有組織特異性和功能多樣性。部分復制基因在組織中的表達模式存在差異，但在鹽脅迫下的表達模式卻基本相同。本研究結果為解析MKK介導的小擬南芥發育過程和非生物脅迫信號轉導通路的復雜機制奠定了基礎。

MKK；小擬南芥；基因家族；組織表達；……