單細胞RNA測序技術在病毒研究中的應用

屈亮，李素，仇華吉

綜 述

單細胞RNA測序技術在病毒研究中的應用

屈亮，李素，仇華吉

中國農業科學院哈爾濱獸醫研究所，獸醫生物技術國家重點實驗室，哈爾濱 150069

單細胞RNA測序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技術已經成為不同領域中研究細胞異質性的有效工具。在病毒研究領域中，利用該技術分析病毒和細胞的轉錄組，可以在單細胞水平上檢測病毒感染的動態變化，了解病毒與細胞間復雜的相互作用。本文簡述了scRNA-seq技術，著重介紹病毒感染宿主細胞后scRNA-seq研究的最新進展，同時也描述了細胞周期、基因表達、細胞狀態等細胞異質性對病毒感染過程的影響，以及病毒變異對其本身感染過程的影響。此外，本文還分析了scRNA-seq在研究病毒–宿主互作動態變化方面具有的獨特優勢，及其在病毒研究領域中廣闊的應用前景，為揭示病毒的感染與致病機制、抗病毒靶標的開發等提供參考。

單細胞RNA測序技術；細胞異質性；病毒感染

單細胞測序(single-cell sequencing, SCS)技術是在單個細胞水平上測序基因組和轉錄組的技術，主要分為單細胞DNA測序(single cell genomic DNA sequencing)與單細胞RNA測序(single-cell RNA se-quencing, scRNA-seq)。SCS技術能夠區分細胞群體中單個細胞間的差異，從而反映出一些少量細胞所具有的獨特表型。近年來，這些少量的具有異質性的獨特細胞受到了越來越多的關注。

細胞異質性是生物組織所具有的普遍特征[1]。生物個體內的細胞最初都來自于相同的受精卵細胞。但隨著細胞分裂和不同的微環境影響，細胞逐漸累積基因突變，最終形成具有不同異質性的細胞。……